| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3613601 = | 145 (1.030) | 30 (0.240) | 14/158 | NT | 19.4% | intergenic (+45/‑66) | acpT/nikA | 4'‑phosphopantetheinyl transferase/nickel/heme ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 3613631 = | 120 (0.960) | intergenic (+75/‑36) | acpT/nikA | 4'‑phosphopantetheinyl transferase/nickel/heme ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GCAATGGATCGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATG > NC_000913/3613532‑3613730 | gCAATGGATCGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACtt > 1:665206/1‑100 (MQ=255)cgcaaatagagtgcggcggagtgtggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACtt > 2:2892588‑M1/70‑100 (MQ=255) gcaaatagagtgcggcggagtgtggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTa > 1:492397‑M1/69‑100 (MQ=255) gcaaatagagtgcggcggagtgtggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTa > 2:3763813‑M1/69‑100 (MQ=255) gcaaatagagtgcggcggagtgtggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTa > 1:2157629‑M1/69‑100 (MQ=255) cAATGGATCGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTa > 1:3669585/1‑100 (MQ=255) cAATGGATCGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTa < 1:223474/100‑1 (MQ=255) aaatagagtgcggcggagtgtggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTAtt > 2:667265‑M1/67‑100 (MQ=255) tagagtgcggcggagtgtggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTcc > 1:2812661‑M1/64‑100 (MQ=255) gATCGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTcc > 1:3346291/1‑100 (MQ=255) tCGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGc < 1:827013/100‑1 (MQ=255) gagtgcggcggagtgtggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGc > 1:2160103‑M1/62‑100 (MQ=255) cGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGcc < 2:69800/100‑1 (MQ=255) gATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCa < 2:499015/100‑1 (MQ=255) tCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCt < 1:1274853/100‑1 (MQ=255) ttAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTAttt < 2:2561689/100‑1 (MQ=255) ttAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTAttt < 1:1778143/100‑1 (MQ=255) tAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTAtttt < 1:1636459/100‑1 (MQ=255) aaCTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGTCGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTa > 2:2531377/1‑100 (MQ=255) cTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAAt > 2:1035373/1‑100 (MQ=255) tGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATc < 2:1879663/100‑1 (MQ=255) gATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAATAGGTAATCAGTATGACGACTACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATcc > 2:2106633/1‑100 (MQ=255) gATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATcc > 2:3089770/1‑100 (MQ=255) ggagagcatggtaaccccaatggattaaaatagatggcggaaataAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCAGACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCa < 2:148950‑M1/55‑1 (MQ=255) cGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCAtt > 2:3200968/1‑99 (MQ=255) gCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTgg > 1:707931/1‑100 (MQ=255) ccACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTgggg < 2:3137216/100‑1 (MQ=255) ccACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTgggg < 2:478915/100‑1 (MQ=255) cACCAGATTGCCAATCTATTGCTCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTCATCCATTGGGGt < 2:555674/100‑1 (MQ=255) aCCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGtt < 1:2289064/100‑1 (MQ=255) ccGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTan < 2:1379084/100‑2 (MQ=255) cGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTAcc > 1:664021/1‑100 (MQ=255) tGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGc < 2:3308185/100‑1 (MQ=255) gCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCAt > 2:1323569/1‑97 (MQ=255) aTCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCtctcn < 1:3617483/100‑2 (MQ=255) aTCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTcc < 1:418094/100‑1 (MQ=255) tATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGCCGAATACTTAAACTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCACTGGGGTTACCATGCTCTCcac < 2:2755932/99‑1 (MQ=255) tATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCcac > 2:1204995/1‑99 (MQ=255) aTTGATCCAGAGCAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCcac < 2:2356783/98‑1 (MQ=255) aTTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCacac > 1:2150963/1‑100 (MQ=255) ttGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGTTCTCCACACt < 2:3362207/100‑1 (MQ=255) tGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTc < 2:3830560/100‑1 (MQ=255) tGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTGCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACt > 1:1548199/1‑99 (MQ=255) gATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTcc > 1:3438896/1‑100 (MQ=255) gATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTcc > 1:2414972/1‑100 (MQ=255) gATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTcc > 1:2055451/1‑100 (MQ=255) cAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTccgccg < 2:91480/100‑1 (MQ=255) cAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTccgccg > 1:2940661/1‑100 (MQ=255) aGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCcgccgc < 1:3007386/100‑1 (MQ=255) atctggTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCAc < 1:28128/96‑1 (MQ=255) atctggTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCAc < 1:32732/96‑1 (MQ=255) aCAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCAct > 2:3447259/1‑100 (MQ=255) gcggaaataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCActc > 1:963876‑M2/40‑100 (MQ=255) ggaaataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTa > 1:2562905‑M2/38‑100 (MQ=255) ggaaataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTa > 2:1427964‑M2/38‑100 (MQ=255) ggaaataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTa > 2:2598219‑M2/38‑100 (MQ=255) ggaaataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATAAGCGTTAACATGCTCTCCACACTACGCCGCACTCTa > 2:1340984‑M2/38‑100 (MQ=255) ggTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCAcagat > 2:32732/1‑96 (MQ=255) ggTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTa > 2:2166933/1‑100 (MQ=255) gaaataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTatat > 1:3092152‑M2/37‑100 (MQ=255) gaaataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTAt > 1:3092251‑M2/37‑100 (MQ=255) tAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTAtt > 1:1083617/1‑100 (MQ=255) tAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTAtt < 2:152693/100‑1 (MQ=255) aataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTACGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTAttt > 2:1853204‑M2/35‑100 (MQ=255) aaTCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTAttt > 2:3678315/1‑100 (MQ=255) ataagtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTg > 1:1899568‑M2/34‑100 (MQ=255) aTCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTg > 2:3783970/1‑100 (MQ=255) agtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTgcgc > 1:2979356‑M2/31‑100 (MQ=255) agtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTgcgc > 2:2963571‑M2/31‑100 (MQ=255) AGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTAtttgaga < 2:854230‑M1/100‑4 (MQ=255) AGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTgcgc < 2:146357‑M1/100‑1 (MQ=255) gtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCgct > 1:1851353‑M2/30‑100 (MQ=255) gtatgacgattttaagtattcgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCgct > 1:3798832‑M2/30‑100 (MQ=255) GTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCgct < 2:3892406‑M1/100‑1 (MQ=255) TATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCgctg < 1:1168030‑M1/100‑1 (MQ=255) ATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCgctgc < 2:2950012‑M1/100‑1 (MQ=255) TGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCgctgct > 1:3842567‑M1/1‑100 (MQ=255) CGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGc > 1:54329‑M1/1‑100 (MQ=255) CGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGc > 1:2608770‑M1/1‑100 (MQ=255) GAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCt > 1:94885‑M1/1‑100 (MQ=255) tACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTtgt > 1:889094/1‑100 (MQ=255) cTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGc < 2:1906146/100‑1 (MQ=255) ttAAAATCGTTATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTTCGTCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCg < 2:2596677/100‑1 (MQ=255) ttAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCg < 2:343447/100‑1 (MQ=255) aaTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCtt < 2:3282251/100‑1 (MQ=255) aaTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCtt < 1:3408825/100‑1 (MQ=255) aTCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCttt < 1:3049769/100‑1 (MQ=255) cgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTa < 1:235972‑M2/91‑1 (MQ=255) cgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTa < 1:1502642‑M2/91‑1 (MQ=255) cgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTa < 1:2561577‑M2/91‑1 (MQ=255) cgtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTa < 2:2826029‑M2/91‑1 (MQ=255) gtcatactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTAt < 2:3542327‑M2/92‑1 (MQ=255) catactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTAGTGCGTCTTTTATCg > 1:3886996‑M2/7‑100 (MQ=255) atactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGt > 2:3589098‑M2/6‑100 (MQ=255) tactTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTAACATGCTCTCCACACTCCGCCGCATTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTc > 2:2440364‑M2/5‑100 (MQ=255) actTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTcc < 2:268932‑M2/97‑1 (MQ=255) actTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTcc < 2:1740068‑M2/97‑1 (MQ=255) ctTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCa < 1:2044384‑M2/98‑1 (MQ=255) ctTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCa > 1:2433040‑M2/3‑100 (MQ=255) tATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCAt < 1:1969340/99‑1 (MQ=255) | GCAATGGATCGATTCAGTTAACTGATCCGCCCACCCGACTGCCCATCTATTGATCCAGAACAGGTAATCAGTATGACGAATACTTAAAATCGTCATACTTATTTCCGCCATCTATTTTAATCCATTGGGGTTACCATGCTCTCCACACTCCGCCGCACTCTATTTGCGCTGCTGGCTTGTGCGTCTTTTATCGTCCATG > NC_000913/3613532‑3613730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |