| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2405625 | 97 (0.750) | 18 (0.150) | 12/164 | NT | 16.0% | intergenic (‑553/+78) | nuoA/lrhA | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A/transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes |
| ? | NC_000913 | = 2405660 | 100 (0.840) | intergenic (‑588/+43) | nuoA/lrhA | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A/transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGG > NC_000913/2405561‑2405759 | ggtggtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCg > 2:799787/1‑100 (MQ=255) gtggtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGt < 1:1012571‑M2/100‑2 (MQ=255) gtggtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGt > 1:3130309‑M2/1‑99 (MQ=255) ggtTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAACGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttt < 1:1708527‑M2/100‑4 (MQ=255) ttGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATACGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGACTCGttttt < 2:70752‑M2/100‑6 (MQ=255) tGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAATGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGtttttt > 1:2042415‑M2/1‑94 (MQ=255) tGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGtttttt > 2:2550779‑M2/1‑94 (MQ=255) gAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGtttttta > 2:2660324‑M2/1‑93 (MQ=255) aaaaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTac < 2:1994161/100‑1 (MQ=255) aaaaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAACCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTac > 2:393542/1‑100 (MQ=255) aaaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTaca > 2:2525429/1‑100 (MQ=255) aaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTacac < 1:559546/100‑1 (MQ=255) aaaTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTacac < 1:3207571/100‑1 (MQ=255) aCAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGt > 2:694995/1‑100 (MQ=255) aCAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGt > 1:2618862/1‑100 (MQ=255) cAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtc > 2:974009/1‑100 (MQ=255) tttttGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtctc > 2:1548498/2‑100 (MQ=255) ttttGTAAGCTTCGCACTGTGCGATTAAGCATTTTTACTAACAAATAGCCGCTGGTGTTTATAACTCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTggc < 2:3271484/97‑3 (MQ=255) ttGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAgg > 2:1145039/1‑100 (MQ=255) gTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGaa > 1:792254/1‑100 (MQ=255) gTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGaa > 1:883288/1‑100 (MQ=255) tACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAAt > 2:532341/1‑100 (MQ=255) aCGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAAtt > 1:2148202/1‑100 (MQ=255) cGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATta < 1:2657945/100‑1 (MQ=255) gTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtat > 1:1344396/1‑100 (MQ=255) gTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtat > 2:513369/1‑100 (MQ=255) ttCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatc < 2:2768734/100‑1 (MQ=255) tCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatct > 1:1897190/1‑100 (MQ=255) tCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatct < 1:2246286/100‑1 (MQ=255) tCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatc < 2:2878248/99‑1 (MQ=255) cTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatcta > 2:1043855/1‑100 (MQ=255) cTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatcta < 1:919127/100‑1 (MQ=255) gCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctatc < 1:2616891/100‑1 (MQ=255) gCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctat > 1:433064/1‑99 (MQ=255) cGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCg > 1:1987182/1‑100 (MQ=255) cGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCg > 1:3484445/1‑100 (MQ=255) aaGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTAc < 2:2695251/100‑1 (MQ=255) aaGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGATTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttttagtaaaaattcttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaa < 2:136344‑M2/99‑46 (MQ=255) aGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGGTCGTTTTTTAGACTATTGTCGCAGGAATTATCTATCGTACGTCGATTa > 1:3346424/1‑98 (MQ=255) aGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACt > 1:893778/1‑100 (MQ=255) ggATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTc < 2:1632477/100‑1 (MQ=255) ggATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTc < 1:1290323/100‑1 (MQ=255) gATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttttagtaaaaatacttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgt < 2:975885‑M2/100‑50 (MQ=255) gATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTACCCCACGAATTCTCTATCGTCCCTCGACTAccc > 2:3331647/1‑97 (MQ=255) aTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCACGAATTATCTATCGTCCGTCGCTTACTCg > 2:1557522/1‑99 (MQ=255) aTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGACAAAGGAAGTATCTATCGTCCGTCGATTACt > 2:2980683/1‑97 (MQ=255) tttttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCACGTTTTTTACACTAGTGTCTCATGCACTATCTATCGTCCGTCGATCACTcta > 2:647084/1‑97 (MQ=255) ttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatt < 1:325117‑M2/100‑55 (MQ=255) ctaaaaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTCTCGTCCGTCGATTACTCGATATccc > 2:2339638/4‑100 (MQ=255) aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttt < 1:730908‑M2/100‑57 (MQ=255) aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATcc < 2:1018551/99‑1 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCt > 2:83646/1‑100 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCt > 2:1652560/1‑100 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCt > 1:1187724/1‑100 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCCTCCGTCGATTACTCGATATCCCt > 2:3117807/1‑100 (MQ=255) tAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCtt > 1:842025/1‑100 (MQ=255) tAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCtt > 1:3372220/1‑100 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCttt > 1:1628790/1‑100 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCttt > 1:2733402/1‑100 (MQ=255) aaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtc > 1:2983203/1‑100 (MQ=255) aaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtca < 1:57445/100‑1 (MQ=255) aaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaa < 1:83646/100‑1 (MQ=255) aaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTCTACACTATTGTCCCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaa < 1:2875752/100‑1 (MQ=255) aaaaGCCGCTTGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaat < 2:1185592/100‑1 (MQ=255) aaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTTtttttagtaaaaatccttcatcgcattgtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaaccacc < 2:2763352‑M2/100‑65 (MQ=255) aaaGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaatc < 2:2931468/100‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTTtttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaaccaccag < 1:2102184‑M2/100‑67 (MQ=255) gCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaaccaccag < 1:2447364‑M2/100‑68 (MQ=255) gCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaac > 1:3637645/1‑100 (MQ=255) gCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaac < 1:243241/100‑1 (MQ=255) ccGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGtttttttagtaaaaatccttcatcgcatagtgcagaacgtacaaaactgttcatttttcaaccaccag < 2:3586529‑M2/100‑69 (MQ=255) ccGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaaca < 1:1528529/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaacaa > 1:2998542/1‑100 (MQ=255) 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1:2387211/100‑1 (MQ=255) ggTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatc > 1:711381/1‑100 (MQ=255) ggTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAat < 2:1344388/99‑1 (MQ=255) gTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatca > 1:2073203/1‑100 (MQ=255) gTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatca > 2:3286665/1‑100 (MQ=255) gTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatc < 2:379755/99‑1 (MQ=255) ttAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCACAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatcatc > 2:2293943/1‑100 (MQ=255) tAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATcc > 1:2700764/1‑100 (MQ=255) tAAAACACCACCAGCTGCTCGTTTTTTACACTATGGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACTATGTATCATcc < 2:1911692/100‑1 (MQ=255) acacacCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATcccc < 1:3495967/98‑1 (MQ=255) aaaCACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATcccc < 1:22068/100‑1 (MQ=255) aaaCACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATcccc > 1:467901/1‑100 (MQ=255) cccAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCCGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCgca > 2:1148698/1‑98 (MQ=255) ccAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGa < 1:2903506/99‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAg < 1:2515563/100‑1 (MQ=255) cAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGa < 2:2497806/98‑1 (MQ=255) gCGTCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGCAATTATCTATCGTCCGTCAATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAg < 2:2992406/100‑1 (MQ=255) gCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACa > 1:3613618/1‑100 (MQ=255) cTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACAt > 1:1189954/1‑100 (MQ=255) gTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTgg < 1:1928219/100‑1 (MQ=255) | GGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAACACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTCCGGAGCAGACATTGG > NC_000913/2405561‑2405759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |