| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1428029 = | 157 (1.050) | 45 (0.310) | 11/172 | NT | 22.5% | noncoding (766/1196 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1428067 = | 159 (1.100) | noncoding (728/1196 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCT > NC_000913/1427930‑1428128 | tATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCgg > 1:1032657/1‑100 (MQ=255)tATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCgg < 1:1790535/100‑1 (MQ=255) gcctgacccacagcctggtcaccaccgcggacaccgagcatgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtcacagccgatGc < 2:2758377‑M1/2‑1 (MQ=255) aTTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCgg > 2:2647685/1‑99 (MQ=255) aTTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGc > 2:3154990/1‑100 (MQ=255) aTTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGc > 2:378774/1‑100 (MQ=255) ttCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGCTCAGCCAGTCCACCTCCACCTCGGcc < 2:3978744/100‑1 (MQ=255) ttCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGcc < 1:623307/100‑1 (MQ=255) cctgacccacagcctggtcaccaccgcggccaacgagcatgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGcc < 1:4017231‑M1/3‑1 (MQ=255) tCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCa < 2:2321310/100‑1 (MQ=255) cGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAg > 1:3050320/1‑100 (MQ=255) tGTTGAGGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGctc < 2:677809/100‑1 (MQ=255) tGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGctcctc > 1:2266527/1‑100 (MQ=255) tGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGctcctc > 1:2028046/1‑100 (MQ=255) tGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTcgcg < 2:1999942/100‑1 (MQ=255) ggCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCgcgc > 2:3267813/1‑100 (MQ=255) gCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCt > 1:317557/1‑100 (MQ=255) gCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCt > 1:1015247/1‑100 (MQ=255) ccGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCtg > 1:1358869/1‑100 (MQ=255) gTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCtgtg < 2:2982772/100‑1 (MQ=255) gTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCtgtg < 1:1700094/100‑1 (MQ=255) gTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCtgtg > 2:2080624/1‑100 (MQ=255) tGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGgcgc > 1:2029928/1‑100 (MQ=255) ttCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTc > 1:253588/1‑100 (MQ=255) tCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTcc < 1:2907411/100‑1 (MQ=255) cTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCt > 2:66244/1‑100 (MQ=255) tGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTg > 1:149319/1‑100 (MQ=255) gcgcGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTgg < 2:47868/100‑1 (MQ=255) gcgcGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTgg < 1:1372610/100‑1 (MQ=255) gcgcGGATTCTGCTTCAACGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTgg < 1:3906870/100‑1 (MQ=255) cgcgGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGt > 2:4017204/1‑100 (MQ=255) ggATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAg < 2:2430326/99‑1 (MQ=255) gATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGcc > 2:2775263/1‑100 (MQ=255) ttcttcTTGAAGGTTTTTACGTTGCCGGGACGCTCGTCAATCTGCTAGTCAACATCCGCCTCGTCCAGCTCCGCGCGCTGTGGAGTTTCTTGGTac < 2:2584941/96‑2 (MQ=255) ttCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCgg < 2:89210/100‑1 (MQ=255) ttCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCgg < 1:163909/100‑1 (MQ=255) gagcatgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCgg > 1:806467‑M1/64‑100 (MQ=255) gagcatgacctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCgg > 1:2868642‑M1/64‑100 (MQ=255) gagcatgacctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCgg > 2:2704092‑M1/64‑100 (MQ=255) agcatgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGc > 1:2200813‑M1/63‑100 (MQ=255) gcatgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCa > 2:3030316‑M1/62‑100 (MQ=255) catgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCAt > 1:3435311‑M1/61‑100 (MQ=255) catgacctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCAt > 1:2968336‑M1/61‑100 (MQ=255) gtttCAAGGTTATTACCTTGCCGGGACGGTCGGCGATCAGGCAGTCCACATCCGCCTCGGCCAGCTGCTCGCGCGGTGTCGCCCGTTGGTAGCGGGCAt > 2:3495736/3‑99 (MQ=255) atgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATc > 2:1448893‑M1/60‑100 (MQ=255) atgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCACCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTCGGTACCcggcctc > 2:3930697‑M1/60‑97 (MQ=255) atgacctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATc > 2:3695699‑M1/60‑100 (MQ=255) atgacctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATc > 2:1865247‑M1/60‑100 (MQ=255) tgacgtcaatcggctgggtaatctgcttcttggaggggagcaatttgtctcagccgatGC‑AGCTCTTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCgg > 2:1173856‑M1/59‑100 (MQ=255) cTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCg < 2:1358868/100‑1 (MQ=255) cTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCg > 1:2304904/1‑100 (MQ=255) cTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCg > 1:2499418/1‑100 (MQ=255) cTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCg < 2:1832572/100‑1 (MQ=255) tCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 1:86831/1‑100 (MQ=255) acctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 1:2673735‑M1/57‑100 (MQ=255) acctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 2:4125529‑M1/57‑100 (MQ=255) cAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTTGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCt > 1:454147/1‑100 (MQ=255) ctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTg > 2:4140292‑M1/55‑100 (MQ=255) tcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTga > 1:2081762‑M1/54‑100 (MQ=255) tcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTga > 2:1518891‑M1/54‑100 (MQ=255) ggTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgag < 1:3204765/100‑1 (MQ=255) ggTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgag < 1:4124513/100‑1 (MQ=255) ggTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgag < 1:1238058/100‑1 (MQ=255) ggTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgag > 2:354582/1‑100 (MQ=40) ggTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgag < 1:3340731/100‑1 (MQ=255) ggTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGAGCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCGCGCGCTGTGGCGCTCCTTAGTAGCCGGCATCGGCTga < 2:639504/99‑1 (MQ=14) tttttACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGTCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGCGAc > 2:700562/1‑100 (MQ=255) ttttACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACa > 2:1778316/1‑100 (MQ=40) ttttACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCAgatcgg > 1:3579603/1‑96 (MQ=255) tACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAAt < 1:2142816/100‑1 (MQ=38) cTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGc < 2:1246514/100‑1 (MQ=38) tGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctc < 2:602574/100‑1 (MQ=35) gtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctc > 1:3737647‑M1/42‑100 (MQ=255) cGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACACCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctcc < 2:2448696/98‑1 (MQ=25) ggACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCtctc > 1:1875499/1‑100 (MQ=38) aCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCa < 1:3844672/100‑1 (MQ=35) cGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCAt < 1:971589/100‑1 (MQ=32) cGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCAt > 1:3828268/1‑100 (MQ=32) ggCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGc > 2:2030121/1‑100 (MQ=35) ggCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGc < 1:4101572/100‑1 (MQ=38) ggCGATCAGCCAGTCCACATCCACCGCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGc < 2:3356898/100‑1 (MQ=25) gATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGa > 1:4033662/1‑100 (MQ=38) aTCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGAt < 1:3793932/100‑1 (MQ=38) aGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTAc > 2:84587/1‑100 (MQ=35) aGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTAc > 2:2690666/1‑100 (MQ=38) gCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTAcc > 2:3624913/1‑100 (MQ=38) ccAGTCCACATCCCCCACGGCCAGCTCCTCGCGCTGTAGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTAccc < 1:2371778/100‑1 (MQ=255) cAGTCCACATCCACCTCGACAAGCTCATCCCGCTGTGTCGCTCCGTGGTAGCCGGCATCGTCTGAGACAAATTGCCCCTCTCCATATAGCAGa < 2:2958710/93‑1 (MQ=11) cacaTCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGa > 1:323979/1‑100 (MQ=38) acaTCCCCCTCGGCCAGCTCCTTGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGAt < 1:1134436/100‑1 (MQ=255) aTCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTg > 2:1383449/1‑100 (MQ=38) tCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGa > 1:1750328/1‑100 (MQ=38) tCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTAGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGa > 2:2232201/1‑100 (MQ=255) ccACCGCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTTCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAg < 2:3655084/100‑1 (MQ=255) cACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAgg < 1:4141795/100‑1 (MQ=38) cTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCa < 1:2980498/100‑1 (MQ=38) cTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCa < 1:2814551/100‑1 (MQ=38) tCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCAt < 1:714724/100‑1 (MQ=35) ggCCAGCTCCCCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGc < 1:3388824/100‑1 (MQ=255) GCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGc > 1:3543891‑M1/1‑99 (MQ=255) | TATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCT > NC_000913/1427930‑1428128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |