| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1428029 = | 157 (1.050) | 45 (0.310) | 11/172 | NT | 22.5% | noncoding (766/1196 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1428067 = | 159 (1.100) | noncoding (728/1196 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
TGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCC > NC_000913/1427969‑1428165 | catgacctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGC‑AGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATc > 2:4001952‑M1/61‑100 (MQ=255) gCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATc > 2:3847178/1‑100 (MQ=255) atgacctcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATc > 2:1448893‑M1/60‑100 (MQ=255) atgacctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATc > 2:3695699‑M1/60‑100 (MQ=255) tgaccgcaatcagctgggtaatctgcttcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCg > 2:351992‑M1/59‑100 (MQ=255) cTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCg < 2:1358868/100‑1 (MQ=255) tCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 2:622073/1‑100 (MQ=255) tCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 1:86831/1‑100 (MQ=255) ccgatctttttACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGc < 2:3579586/94‑1 (MQ=255) acctcaatcagcttggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgagGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 2:461488‑M1/57‑100 (MQ=255) acctcaatcagcttggtaatctgctgcatgcagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 2:2509918‑M1/57‑100 (MQ=255) acctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 2:4125529‑M1/57‑100 (MQ=255) acctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 1:2034817‑M1/57‑100 (MQ=255) acctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGc > 2:1803830‑M1/57‑100 (MQ=255) cAAGTTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCTCCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCt < 2:490939/100‑1 (MQ=255) cAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTTGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCt > 1:454147/1‑100 (MQ=255) cAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCt > 2:2001226/1‑100 (MQ=255) ctcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTg > 1:3208759‑M1/55‑100 (MQ=255) tcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTga > 1:2081762‑M1/54‑100 (MQ=255) tcaatcagctgggtaatctgctgcatggagaggagcaatttgtctcagccgatGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTga > 2:1518891‑M1/54‑100 (MQ=255) aGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTga < 1:1932717/100‑1 (MQ=255) ggtaaaaaCCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgag < 1:2227435/93‑1 (MQ=255) ggTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgag < 1:1238058/100‑1 (MQ=255) gTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTgaga < 1:3085388/100‑1 (MQ=255) tttttACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGTCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGCGAc > 2:700562/1‑100 (MQ=255) ttttACCTTGCCGGGACTCTCGGTGATCAGCCAGTCCACATCCTCCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGAc < 2:3075985/99‑1 (MQ=255) aCCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAAtt > 1:3376306/1‑100 (MQ=38) ctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggccgaggtggatgtggactggctgatcgccgagcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTg > 1:2386169‑M2/69‑100 (MQ=255) accaaggggcgccacagcgcgaggagctggccgaggtggatgtggactggctgatcgccgagcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGct > 1:35999‑M2/67‑100 (MQ=255) accaaggggcgccacagcgcgaggagctggccgaggtggatgtggactggctgatcgccgagcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGct > 1:649860‑M2/67‑100 (MQ=255) ccaaggggcgccacagcgcgaggggctggccgaggtggatgtggactggctgagcgacgagcgctCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGttc > 2:2676695‑M2/66‑100 (MQ=255) ccaaggggcgccacagcgcgaggagctggccgaggtggatgtggactggctgatcgccgagcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctc > 1:2141914‑M2/66‑100 (MQ=255) ccaaggggcgccacagcgcgaggagctggccgaggtggatgtggactggctgatcgccgagcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctc > 1:1694247‑M2/66‑100 (MQ=255) caaggggcgccacagcgcgaggagctggccgaggtggatgtggactggctgatcgccgagcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctcc > 1:3147840‑M2/65‑100 (MQ=255) aggggcgccacagcgcgaggagctggccgaggtggatgtggactggctgatcgccgagcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctcctc > 2:213458‑M2/63‑100 (MQ=255) gggACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGctcctc > 1:2396407/1‑99 (MQ=38) aCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCa < 2:1032657/100‑1 (MQ=35) aCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCa < 1:2994342/100‑1 (MQ=35) cGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCAt > 2:674802/1‑100 (MQ=32) cGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAg > 2:3268705/1‑100 (MQ=35) ggCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGc < 1:4101572/100‑1 (MQ=38) ggCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCGCTCGCTCCGGCGCTCTTTAGTAGCCGGCATCCGCTGCGACAGACTGTTCCTCGCCAt < 2:2594224/95‑1 (MQ=2) gATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGa > 1:1398333/1‑100 (MQ=38) cAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTa > 2:2962157/1‑100 (MQ=38) gagcaatttgtctcagccgatgccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTAc > 1:3737647‑M2/60‑100 (MQ=255) ccAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTAccc < 2:649380/100‑1 (MQ=35) ccAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTAccc < 2:1727813/100‑1 (MQ=38) gTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATTGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGc < 1:1024141/100‑1 (MQ=255) ccACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTg > 1:2886488/1‑100 (MQ=35) ccACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTg > 2:2907199/1‑100 (MQ=38) cacaTCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGa > 1:4133681/1‑100 (MQ=38) cacaTCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGa > 1:323979/1‑100 (MQ=38) tCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGa > 1:1750328/1‑100 (MQ=38) tCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTAGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGa > 2:2232201/1‑100 (MQ=255) cagccgatgccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAg > 2:4140292‑M2/47‑100 (MQ=255) cagccgatgccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAg > 1:750836‑M2/47‑100 (MQ=255) cagccgatgccggctaccaaggagcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAg > 2:1886263‑M2/47‑100 (MQ=255) gccgatgccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGt > 1:2673735‑M2/45‑100 (MQ=255) gccgatgccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGt > 1:3771428‑M2/45‑100 (MQ=255) ccTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTc > 1:3819996/1‑100 (MQ=38) cgatgccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAACTTGCTCCTCTCCATGCAGCAGCTTACCCAGCTGATTGCGGTCa > 1:1199850‑M2/43‑100 (MQ=255) cgatgccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCa > 1:1553249‑M2/43‑100 (MQ=255) ccgatgccggctaccaaggagcgccacagcgcgaagagctgcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCCCTCCAAGAAGCAGATTACCCAGCCGATTGACGTCa > 2:1173856‑M2/43‑100 (MQ=255) cTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCa < 1:2814551/100‑1 (MQ=38) 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GCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGCCAAATTGCTCCTCTCCATGACGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGc < 2:365058‑M1/99‑1 (MQ=255) ccggctaccaaggggcgccacagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTc > 2:2704092‑M2/38‑100 (MQ=255) gCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGtt > 2:123742/1‑100 (MQ=38) cctcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGc > 1:729168/1‑100 (MQ=38) cgcTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCgg < 1:981499/100‑1 (MQ=38) gcTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggt < 1:2865746/100‑1 (MQ=38) tgtgGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggtgg < 1:2775270/100‑1 (MQ=38) gtgGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggtggt < 1:588637/100‑1 (MQ=38) ggcgccCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCAAGCTCGTTGGCCGAGGTGGTGa > 1:1372058‑M2/7‑100 (MQ=255) ggCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGgtggtg < 1:2521060/99‑1 (MQ=38) ggCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGa > 1:231876/1‑100 (MQ=38) gcgcTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggtggcctg > 1:546680/1‑96 (MQ=255) gcgcTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGAc < 1:1904755/100‑1 (MQ=38) cgcTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGAcc > 2:341545/1‑100 (MQ=35) gcTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCa < 1:2461833/100‑1 (MQ=38) cagcgcgaggagctggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTgacta < 2:2034814‑M2/83‑3 (MQ=255) CCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGc > 1:354329‑M2/1‑100 (MQ=255) tGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTACTCTCCATGAAGCAGATTACCAAGCTGATTGCGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCtgt > 2:796518/1‑100 (MQ=255) ggTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCtgtg < 2:1809768/100‑1 (MQ=32) ggTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCtgtg < 1:3680977/100‑1 (MQ=33) tAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTggg > 1:1113843/1‑100 (MQ=33) aGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGt < 2:2203007/100‑1 (MQ=33) gCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTc > 1:3188311/1‑100 (MQ=33) ccGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCa > 1:3839121/1‑100 (MQ=33) gcATCGGCTGTGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGGTGTCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGc < 2:2758377‑M2/98‑1 (MQ=255) gcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGc < 1:3966036‑M2/98‑1 (MQ=255) gcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGc < 2:954949‑M2/98‑1 (MQ=255) cATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGcc < 1:4028591‑M2/99‑1 (MQ=255) cATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGcc > 1:2937226‑M2/2‑100 (MQ=255) | TGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCC > NC_000913/1427969‑1428165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |