| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4555361 = | 137 (1.130) | 11 (0.100) | 6/158 | NT | 8.7% | intergenic (+12/+129) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 4555390 = | 108 (1.000) | intergenic (+41/+100) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
ACGTCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACC > NC_000913/4555262‑4555460 | taacaggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgtaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaa > 2:3213480‑M1/100‑100 (MQ=255) tCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAgc < 2:822200/100‑1 (MQ=255) tCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAgc < 1:489128/100‑1 (MQ=255) caggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAgc < 2:1886491‑M1/4‑1 (MQ=255) ggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAgcgc < 1:2395710‑M1/6‑1 (MQ=255) ggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAgcgc > 1:483099‑M1/95‑100 (MQ=255) ggaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAgcgc < 1:1693328‑M1/6‑1 (MQ=255) gaagaatgagtactaacattcaggttatacatatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagcAAGCGCa > 2:2232812‑M1/94‑100 (MQ=255) gaagaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCa < 1:2108665‑M1/7‑1 (MQ=255) ctgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCaa > 1:2252529/1‑100 (MQ=255) tgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAg < 1:2687497/100‑1 (MQ=255) tgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAg > 1:10918/1‑100 (MQ=255) tgGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAg < 2:3072758/100‑1 (MQ=255) agaatgagtactaacagtcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacagagtaatactccttgcgggttcttaatttaagaAAGCGCa > 2:1369184‑M1/92‑98 (MQ=255) ggAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAgg > 1:1824971/1‑100 (MQ=255) gaatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAgg > 2:1279763‑M1/91‑100 (MQ=255) aatgagtactaacattcaggttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAgg > 2:2046047‑M1/90‑99 (MQ=255) aTTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTa < 1:696235/100‑1 (MQ=255) ttCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAATGGTaa > 1:1786198/1‑100 (MQ=255) ctcGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAAc > 1:1886497/1‑100 (MQ=255) cGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACgn < 2:2552726/100‑2 (MQ=255) cGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGt > 2:1805474/1‑100 (MQ=255) cGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGt > 1:27438/1‑100 (MQ=255) cGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCt < 2:214781/100‑1 (MQ=255) ttGACTATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCtn < 1:2967191/99‑2 (MQ=255) ttGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTg > 2:174838/1‑100 (MQ=255) tGACTATATTTATTTTGATGGCTATCGGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTcc < 2:719893/96‑1 (MQ=255) gACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTgcg < 2:2142169/100‑1 (MQ=255) gACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTgcg < 2:682209/100‑1 (MQ=255) cGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCt < 1:359139/100‑1 (MQ=255) ttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTc > 1:3189909‑M1/70‑100 (MQ=255) tatttattTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTc < 1:2527062/100‑1 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 1:1931478/100‑1 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt > 1:1358934/1‑100 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 1:1194621/100‑1 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt > 1:1535931/1‑100 (MQ=255) tttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCtt > 2:1665424/1‑100 (MQ=255) tttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCtt > 2:1554335/1‑100 (MQ=255) atacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCtt > 1:2767299‑M1/68‑100 (MQ=255) atttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaaa < 2:1852789/100‑1 (MQ=255) agatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAt > 2:669586‑M1/64‑100 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 2:561722/100‑1 (MQ=255) ttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTa < 2:518366/100‑1 (MQ=255) gATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaag < 2:2050197/100‑1 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:2778104/100‑1 (MQ=255) tGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:1025213/99‑1 (MQ=255) gCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGt > 2:1376130/1‑100 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCCTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACCTATTATAATCAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTc < 1:3166336/100‑1 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTc > 2:22806/1‑100 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTACTTAAATTAAGAAGTc > 2:1912391/1‑100 (MQ=255) tATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTTCGCTTTCTTAAAGTaag > 2:3128447/1‑94 (MQ=255) tATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCg > 1:1466476/1‑100 (MQ=255) tATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCg > 2:2168199/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAAt > 2:588528/1‑99 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg < 1:869777/100‑1 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 1:2298577/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 1:2532125/1‑100 (MQ=255) ttGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAg > 2:2484576/1‑100 (MQ=255) tGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGt < 1:3154156/100‑1 (MQ=255) gATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTa < 2:2962024/100‑1 (MQ=255) ttCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAtt > 1:3077608/1‑100 (MQ=255) tCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTa > 1:82890/1‑100 (MQ=255) aTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACt > 1:581536/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACtt < 2:39807/100‑1 (MQ=255) ggCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACttt > 1:2840349/1‑100 (MQ=255) ggCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTACTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACttt > 2:2088873/1‑100 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 1:413283/100‑1 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 1:164328/100‑1 (MQ=255) ccGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGt < 1:1011672/100‑1 (MQ=255) cGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTa < 1:2409151/100‑1 (MQ=255) gCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTaa < 2:10918/100‑1 (MQ=255) cTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTaaa > 2:3193634/1‑100 (MQ=255) tGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAt > 1:596099/1‑100 (MQ=255) tGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAt > 1:2021722/1‑100 (MQ=255) ggATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAtt < 1:1385356/100‑1 (MQ=255) ggATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAtt > 1:1733700/1‑100 (MQ=255) gATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTg > 1:2187547/1‑100 (MQ=255) aTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGc < 2:2717415/100‑1 (MQ=255) tAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCa > 2:2826821/1‑100 (MQ=255) aaaGTCGACGGCTGACTTATTATAATAAGCGAAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAg < 2:1191268/100‑1 (MQ=255) aaaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCan < 2:1726811/100‑2 (MQ=255) aaaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAg < 2:1603037/100‑1 (MQ=255) aaaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAg < 2:1356301/100‑1 (MQ=255) aaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAgg > 1:627827/1‑100 (MQ=255) aaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAgg > 1:1311312/1‑100 (MQ=255) aGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg < 1:341523/100‑1 (MQ=255) aGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGACTATTACTTTGTAAATTGCAg < 2:1993599/98‑1 (MQ=255) cGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGt > 1:1552302/1‑100 (MQ=255) gCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGtt > 1:2495196/1‑100 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 2:1304509/100‑1 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg > 2:3149959/1‑100 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 1:2036323/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:2935648/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc > 2:2227004/1‑100 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:586804/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc > 2:776798/1‑100 (MQ=255) attatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGGAGTGTTTAGCTATCt > 2:3104400/1‑100 (MQ=255) taataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtat < 1:3143298/100‑1 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata > 2:1647789/1‑100 (MQ=255) AAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAcc < 2:1224635‑M1/100‑1 (MQ=255) | ACGTCTGCTGGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACC > NC_000913/4555262‑4555460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |