| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4555361 = | 137 (1.130) | 11 (0.100) | 6/158 | NT | 8.7% | intergenic (+12/+129) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 4555390 = | 108 (1.000) | intergenic (+41/+100) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
TATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTGGTAG > NC_000913/4555292‑4555489 | ttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTc > 1:3189909‑M1/70‑100 (MQ=255)ttatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTc > 1:3176947‑M1/70‑100 (MQ=255)tatttattTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTc < 1:2527062/100‑1 (MQ=255) tatacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt > 1:1534603‑M1/69‑100 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt > 1:1358934/1‑100 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt > 1:1535931/1‑100 (MQ=255) tttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCtt > 2:1554335/1‑100 (MQ=255) tttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCtt > 2:1665424/1‑100 (MQ=255) atacagatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCtt > 1:2767299‑M1/68‑100 (MQ=255) ttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTa > 1:2181000/1‑100 (MQ=255) ttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTa < 1:200776/100‑1 (MQ=255) atttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaaa > 2:692869/1‑100 (MQ=255) agatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAt > 1:1030125‑M1/64‑100 (MQ=255) agatagctaaacaataccctgcaatttacaaagtaatactcattgcgacttcttaatttaagaAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAt > 2:669586‑M1/64‑100 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACTCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 2:1625741/100‑1 (MQ=255) tttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAtt < 2:561722/100‑1 (MQ=255) gATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaag < 2:2050197/100‑1 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:2778104/100‑1 (MQ=255) tGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 1:1025213/99‑1 (MQ=255) gCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGt > 2:1376130/1‑100 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTc > 2:22806/1‑100 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTACTTAAATTAAGAAGTc > 2:1912391/1‑100 (MQ=255) tATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTTCGCTTTCTTAAAGTaag > 2:3128447/1‑94 (MQ=255) tATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCg > 2:2168199/1‑100 (MQ=255) tATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCg > 1:1466476/1‑100 (MQ=255) cTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCaa < 2:1358931/100‑1 (MQ=255) tGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAAt < 1:300293/100‑1 (MQ=255) tGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAAt < 2:1841144/100‑1 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAAt > 2:588528/1‑99 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 1:272433/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 1:2298577/1‑100 (MQ=255) ttGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAg > 2:2484576/1‑100 (MQ=255) tGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGt < 1:3154156/100‑1 (MQ=255) tCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTa > 1:82890/1‑100 (MQ=255) aTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACt > 2:2394755/1‑100 (MQ=255) aTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACt > 2:2173852/1‑100 (MQ=255) aTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACt > 1:581536/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACtt > 2:3202616/1‑100 (MQ=255) ggCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACttt > 1:2840349/1‑100 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 1:413283/100‑1 (MQ=255) gCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTg < 1:164328/100‑1 (MQ=255) ccGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGt < 1:1011672/100‑1 (MQ=255) cGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTa < 1:1677604/100‑1 (MQ=255) gCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTaa < 1:2214457/100‑1 (MQ=255) gCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTaa < 2:10918/100‑1 (MQ=255) tGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAt > 1:1913633/1‑100 (MQ=255) aTAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGc < 2:2078871/100‑1 (MQ=255) aaaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCan < 2:1726811/100‑2 (MQ=255) aaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAgg > 2:1290720/1‑100 (MQ=255) aaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAgg > 1:627827/1‑100 (MQ=255) aGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg < 1:341523/100‑1 (MQ=255) aGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGACTATTACTTTGTAAATTGCAg < 2:1993599/98‑1 (MQ=255) gCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGtt > 1:2495196/1‑100 (MQ=255) cTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTa > 2:2122753/1‑100 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 1:2036323/100‑1 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 2:1304509/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc > 1:127080/1‑100 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 1:2615619/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 2:2935648/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc > 2:776798/1‑100 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:586804/100‑1 (MQ=255) attatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGGAGTGTTTAGCTATCt > 2:3104400/1‑100 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 1:1700592/100‑1 (MQ=255) tataATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGt > 2:2823460/1‑100 (MQ=255) taataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtat < 1:3143298/100‑1 (MQ=255) taataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtat > 2:3191123/1‑100 (MQ=255) agaaagcgcaaggaacgtttacccttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata > 2:471264‑M2/33‑100 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata > 2:1647789/1‑100 (MQ=255) gaaagcgcatggaacgtttacccttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGAAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 2:2616612‑M2/32‑100 (MQ=255) gaaagcgcaaggaacgtttacccttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 1:856836‑M2/32‑100 (MQ=255) AAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAAcc > 2:376664‑M1/1‑100 (MQ=255) GCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTGTCTTAAATTAACAAGTCGCAATGAGTCTTATTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTg > 2:2808407‑M1/1‑100 (MQ=255) CGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGa < 1:1401755‑M1/100‑1 (MQ=255) GCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGaa < 2:3028661‑M1/100‑1 (MQ=255) GCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGaa > 2:1870012‑M1/1‑100 (MQ=255) CAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAAt < 1:2770343‑M1/100‑1 (MQ=255) CAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAAt > 2:1232414‑M1/1‑100 (MQ=255) CAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAAt > 2:2876240‑M1/1‑100 (MQ=255) GGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTa > 1:604081‑M1/1‑100 (MQ=255) GGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTAGTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATg < 2:394122‑M1/97‑1 (MQ=255) gTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGACGTCGCAGTGTGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAg < 2:2298568/100‑1 (MQ=255) tAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGt > 1:2050536/1‑100 (MQ=255) tAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGt > 1:2471389/1‑100 (MQ=255) tAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGGAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGt < 2:1823936/100‑1 (MQ=255) aaCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTAc > 1:892579/1‑100 (MQ=255) cGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTc < 1:2394765/100‑1 (MQ=255) gTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCa < 2:446522/100‑1 (MQ=255) tCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAtt < 2:2508387/100‑1 (MQ=255) tCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAtt < 1:22806/100‑1 (MQ=255) ccttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGCGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttc > 2:1454903‑M2/11‑100 (MQ=255) cttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttct > 1:1147738‑M2/10‑100 (MQ=255) cttgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttct > 2:1193108‑M2/10‑100 (MQ=255) tgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCattatt > 1:2399300‑M2/8‑99 (MQ=255) tgcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttcttc < 1:2108665‑M2/93‑1 (MQ=255) tgcgcttGCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATATGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAttcttc > 2:2232812‑M2/8‑100 (MQ=255) gcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTcc > 1:483099‑M2/7‑100 (MQ=255) gcgcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGGTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTcc < 2:1786193‑M2/94‑1 (MQ=255) gcttTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTg < 2:1886491‑M2/96‑1 (MQ=255) tTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTACAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTGTTa > 2:3213480‑M2/2‑100 (MQ=255) tCTTAAATTAAGAGGTAGTGTTTAGTATTTCTTTTTAAATTGAAGGGTATTCTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTTCTCATTCTTCCTGGTAg < 2:2683859/100‑1 (MQ=255) | TATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCATTCTTCCTGGTAG > NC_000913/4555292‑4555489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |