| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 998439 = | 160 (1.310) | 7 (0.060) | 6/180 | 13.8 | 4.7% | intergenic (+32/‑51) | elfA/elfD | laminin‑binding fimbrin subunit/putative periplasmic pilin chaperone |
| ? | NC_000913 | 998461 = | 136 (1.230) | intergenic (+54/‑29) | elfA/elfD | laminin‑binding fimbrin subunit/putative periplasmic pilin chaperone | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAA > NC_000913/998340‑998538 | tCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAc > 1:641080/1‑100 (MQ=255) cGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAcc > 1:782926/1‑100 (MQ=255) gCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAccc > 1:1108301/1‑100 (MQ=255) tACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCt < 1:2494806/100‑1 (MQ=255) aCGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTc < 1:3027786/100‑1 (MQ=255) cGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTcc < 2:1289386/100‑1 (MQ=255) ggggAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCa > 1:327344/1‑100 (MQ=255) ggggAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCa > 1:2489653/1‑100 (MQ=255) gggAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAg < 2:3060449/100‑1 (MQ=255) gggAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAg > 1:2545471/1‑100 (MQ=255) gggAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAg > 1:625492/1‑100 (MQ=255) ggAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAg < 1:1766417/99‑1 (MQ=255) gAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAGCTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAgtg < 2:1108305/100‑1 (MQ=255) aaaGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAgtgt < 1:2471435/100‑1 (MQ=255) aaGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGtt < 1:1358855/100‑1 (MQ=255) aGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑c < 2:444400/100‑1 (MQ=255) cGACTTCATGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTACTATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCTTCCTGTGTT‑Ct < 1:1611021/99‑1 (MQ=255) cGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTg < 2:1545972/100‑1 (MQ=255) gACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTgg < 2:743714/100‑1 (MQ=255) cTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTCACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAg > 2:1445449/1‑100 (MQ=255) cTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAg > 1:2158836/1‑100 (MQ=255) ttCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAgg < 2:1049770/100‑1 (MQ=255) ttCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAgg < 2:1661475/100‑1 (MQ=255) tCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAAGAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAggg < 2:1067393/100‑1 (MQ=255) cAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAggg < 1:1445444/99‑1 (MQ=255) aGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGa < 2:782928/100‑1 (MQ=255) aGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGa > 1:1689158/1‑100 (MQ=255) tAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGatat > 1:976004/1‑100 (MQ=255) tgtgAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCa > 1:1369047/1‑100 (MQ=255) tgtgAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCa > 2:536275/1‑100 (MQ=255) gtgAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCat > 2:1531631/1‑100 (MQ=255) tgAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCata < 1:1944494/100‑1 (MQ=255) tgAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCata > 1:1475264/1‑100 (MQ=255) aTGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATAttt > 1:2350390/1‑100 (MQ=255) ggTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTa < 2:2967359/100‑1 (MQ=255) ggTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTa < 1:1538837/100‑1 (MQ=255) gTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATAtttttt < 1:393820/98‑1 (MQ=255) tAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAag < 2:793741/100‑1 (MQ=255) aaCAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAaga < 1:98310/100‑1 (MQ=255) aCAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAagag < 2:2980405/100‑1 (MQ=255) aCAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAagag > 2:1407630/1‑100 (MQ=255) cAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGt > 2:2956446/1‑100 (MQ=255) aTTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGAc > 1:2953790/1‑100 (MQ=255) ccATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTAtt > 1:2605748/1‑100 (MQ=255) tatTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTAt > 2:1901541/1‑100 (MQ=255) tatTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTAt < 2:615670/100‑1 (MQ=255) tatTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTAt < 2:641081/100‑1 (MQ=255) tatTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTCTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTAt < 1:2061134/100‑1 (MQ=255) atTAACTATTATTAATAGAACTCATTAGTTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATg > 1:1872576/1‑100 (MQ=255) atTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATg < 1:2449130/100‑1 (MQ=255) atTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATg < 1:2768631/100‑1 (MQ=255) atTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATg < 1:1926302/100‑1 (MQ=255) aaCTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGaaa < 1:201443/100‑1 (MQ=255) aCTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGaaaa > 1:270377/1‑100 (MQ=255) tattatTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTTATTATTACCCCTCC‑TTGTTGATATAGGGGATATTCATATTCTTTAAACGGGACTATTTATg > 1:2253567/1‑94 (MQ=255) tattatTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACt < 2:2265809/100‑1 (MQ=255) ttattaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTg < 2:1262978/100‑1 (MQ=255) tattaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGc < 1:2859258/100‑1 (MQ=255) tattaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGc > 2:2584048/1‑100 (MQ=255) tattaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGc < 1:124043/100‑1 (MQ=255) tattaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGc < 1:2956427/100‑1 (MQ=255) attaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCa > 2:1272349/1‑100 (MQ=255) attaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCa > 1:2396456/1‑100 (MQ=255) attaATAGAACTCATTAATTGAATTATTAATTAGTACCCCTCCAGAGTT‑CTGAAGGGGATATTCATATTTTTTAAGTGTGACTATTTATGAAAACTTgaa > 1:811479/1‑98 (MQ=255) ttaATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCTGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCAt < 1:2151579/100‑1 (MQ=255) aaTAGAACTCAGTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATATTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATaa > 1:1615503/1‑100 (MQ=255) aTAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAAc > 1:954763/1‑100 (MQ=255) tAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACa < 1:17337/100‑1 (MQ=255) aGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACaa > 1:2268296/1‑100 (MQ=255) aGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACaa > 1:2963278/1‑100 (MQ=255) gAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACaaa > 2:1690958/1‑100 (MQ=255) aCTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAgg > 2:1378847/1‑100 (MQ=255) aCTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAgg < 2:1426045/100‑1 (MQ=255) cTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATCAAAACTTGCATAACAAAggg < 1:1869539/100‑1 (MQ=255) cATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGaa < 2:2350400/100‑1 (MQ=255) cATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGaa > 1:1575177/1‑100 (MQ=255) tAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCAAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtg < 1:1765694/100‑1 (MQ=255) tcttccgatctaattaGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtgtg < 1:1222093/90‑1 (MQ=255) aTTGTTTTATTAATTAGTACTCGTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAATAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtgtg < 1:292217/100‑1 (MQ=255) aTTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtgtg < 2:2869942/100‑1 (MQ=255) aTTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtgtg > 2:2128243/1‑100 (MQ=255) aTTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATtgtg < 2:1451935/100‑1 (MQ=255) ttGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGTGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGa < 1:1917595/100‑1 (MQ=255) tGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCCGTGTC‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGAc < 1:2111468/100‑1 (MQ=255) ttttATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCg < 2:806574/100‑1 (MQ=255) ttttATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCg > 1:538170/1‑100 (MQ=255) ttattaATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTa > 1:2741390/1‑100 (MQ=255) ttattaATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTa > 1:1836335/1‑100 (MQ=255) aattaattaGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTAGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTaa > 1:1057676/2‑100 (MQ=255) attaattaGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAg < 2:1147729/100‑1 (MQ=255) attaattaGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAg > 1:1732078/1‑100 (MQ=255) ttaattaGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGt > 2:1892581/1‑100 (MQ=255) taattaGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGtt < 2:1628209/100‑1 (MQ=255) aattaGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGagatcggaaga > 2:1222097/1‑90 (MQ=255) taGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAAc < 2:270377/100‑1 (MQ=255) taGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAAc > 2:1072178/1‑100 (MQ=255) gTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACgg < 1:44787/100‑1 (MQ=255) tACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGc < 2:2678280/100‑1 (MQ=255) tACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGc < 2:2677986/100‑1 (MQ=255) ccccTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCaa > 1:2637533/1‑100 (MQ=255) | TCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTT‑CTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGAGTGACTATTTATGAAAACTTGCATAACAAAGGGAATTGTGACCGTAAGTTTAACGGCAA > NC_000913/998340‑998538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |