| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2979753 = | 78 (0.720) | 13 (0.130) | 10/168 | NT | 15.8% | coding (733/936 nt) | lysR | transcriptional activator of lysA; autorepressor |
| ? | NC_000913 | 2979785 = | 65 (0.630) | coding (765/936 nt) | lysR | transcriptional activator of lysA; autorepressor | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCC > NC_000913/2979654‑2979852 | ccactaaacgcctgaaccagcgctgatgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaac < 2:2564502‑M1/1‑1 (MQ=255)ccactaaacgcctgaaccagcgctgatgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaac > 1:537249‑M1/100‑100 (MQ=255)aCTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAcc < 2:753118/100‑1 (MQ=255)aCTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAcc < 1:1864608/100‑1 (MQ=255) cTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAccc < 1:529689/100‑1 (MQ=255) cTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAAcc < 1:1250169/99‑1 (MQ=255) actaaacgcctgaaccagcgctgatgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCg > 1:877910‑M1/98‑100 (MQ=255) gAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGc < 2:221302/100‑1 (MQ=255) gAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGc > 1:2493982/1‑100 (MQ=255) ctaaacgcctgaaccagcgctgatgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGc > 1:917124‑M1/97‑100 (MQ=255) ctaaacgcctgaaccagcgctgatgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGc > 2:1369301‑M1/97‑100 (MQ=255) cgaaacgcctgaaccagcgctgatgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaac > 2:2523994‑M1/97‑97 (MQ=255) aaCATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCt < 1:1740125/100‑1 (MQ=255) cATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCa > 1:2425806/1‑100 (MQ=255) aGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCg < 2:3110670/99‑1 (MQ=255) ggTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCa > 2:621965/1‑100 (MQ=255) ggTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCa > 1:796673/1‑100 (MQ=255) gTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCAc > 1:2888812/1‑100 (MQ=255) tAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGTGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGGACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTa < 1:287609/100‑1 (MQ=255) aaaCGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAg > 1:682198/1‑100 (MQ=255) aaaCGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAg > 1:2002703/1‑100 (MQ=255) aaaCGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAg < 2:3074760/100‑1 (MQ=255) aaaCGACGCATGAACGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTAAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGCGGGTACTTCGGTGGTTATCCTGTTGACAGCACTAg > 2:2650770/1‑100 (MQ=255) aaCGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGa > 2:1457681/1‑100 (MQ=255) cgacgCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGAtt < 1:523738/100‑1 (MQ=255) gCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGc < 1:2905436/100‑1 (MQ=255) aTGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCgg < 1:1720736/100‑1 (MQ=255) tGATCGTAGAAACCCACAGCGTCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCgg > 2:1831484/1‑99 (MQ=255) tGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGc > 1:2564527/1‑100 (MQ=255) atgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGc > 2:1221257‑M1/75‑100 (MQ=255) tgacgggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaacCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCa > 1:1676405‑M1/74‑100 (MQ=255) gATTGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCGAGGGTCCGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACGCGCTCACCg < 2:2509642/83‑1 (MQ=255) gATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCa > 2:2774294/1‑100 (MQ=255) aTCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAGTGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCaa > 1:2192182/1‑100 (MQ=255) aTCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCaa > 1:1576429/1‑100 (MQ=255) aTCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCaa > 2:1725573/1‑100 (MQ=255) aTCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCaa > 1:1279606/1‑100 (MQ=255) aTCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCACACTAGATTATGCGGCaa > 2:2852888/1‑100 (MQ=255) cGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGc < 1:717017/100‑1 (MQ=255) cGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGc > 1:1178834/1‑100 (MQ=255) cGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGc < 1:3087983/100‑1 (MQ=255) gggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaacCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCg > 2:1802874‑M1/70‑100 (MQ=255) gTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCg > 1:530731/1‑100 (MQ=255) gTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGGAGGTATTTCGGGGGTTAACCCGGTCACCGCACTAGATTATGCg > 2:2143863/1‑93 (MQ=255) tAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCgg > 1:555182/1‑100 (MQ=255) ggcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCgg > 2:3052655‑M1/69‑100 (MQ=255) ggcggtgcagggggcggatcaggctgacggggaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCgg > 2:2580976‑M1/69‑100 (MQ=255) gcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGcgga > 2:151580‑M1/68‑99 (MQ=255) gcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGt > 1:917964‑M1/68‑100 (MQ=255) ctggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGt > 1:1581972‑M1/68‑100 (MQ=255) aGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGAGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGt < 2:1855409/100‑1 (MQ=255) gAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGtt > 2:1424048/1‑100 (MQ=255) ggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCggtag < 2:1581959‑M1/35‑3 (MQ=255) aaaCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGttt < 1:621966/100‑1 (MQ=255) aaCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGttt < 2:6310/99‑1 (MQ=255) tgctgggttcggatcaggctgacggtgaacggacccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTTGCCGCACTAGATTTTGCGGCaa > 2:2283506‑M1/64‑91 (MQ=255) cccACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAg < 1:2839745/99‑1 (MQ=255) cgacaGCGCCACGTCAGACGTCTCAATGCTACGGGCGTGGGTAGGTATTTGGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGc < 2:1979632/82‑1 (MQ=255) cacaGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAgtgg > 1:918126/1‑100 (MQ=255) gggggcggatcaggctgacggtgaacggcaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAgtgg > 2:2429021‑M1/60‑99 (MQ=255) caGCGGCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAgtgg < 2:2806680/98‑1 (MQ=255) gcgcCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTgcg < 1:2376976/100‑1 (MQ=255) tcttccgatctCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTgcggc < 2:394107/90‑1 (MQ=255) cgcgTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGcggcgg < 2:2250486/100‑1 (MQ=255) gcgTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGt > 1:1979907/1‑100 (MQ=255) gTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTc < 1:725541/100‑1 (MQ=255) cAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAg < 2:1774204/100‑1 (MQ=255) tCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAg < 2:2511849/97‑1 (MQ=255) tCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTAt > 2:2796070/1‑100 (MQ=255) tGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTAtt > 1:2603434/1‑99 (MQ=255) cgcAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCg > 1:1240516/1‑100 (MQ=255) cgcAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCg > 1:1439527/1‑100 (MQ=255) gcAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATAATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCgg < 2:1964248/100‑1 (MQ=255) cAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGt > 2:989978/1‑100 (MQ=255) cAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGt > 2:792207/1‑100 (MQ=255) ggTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCg > 1:2204/1‑100 (MQ=255) ggTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCg > 1:2054000/1‑100 (MQ=255) aCGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTc > 2:3002759/1‑100 (MQ=255) cgggcgggGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTc < 2:1787271/99‑1 (MQ=255) cgggcgggGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATAGCGGTTCCGTTCa > 1:1807953/1‑100 (MQ=255) gatctgggTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCAcc < 2:322647/95‑1 (MQ=255) gcgggGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCg < 1:2027964/100‑1 (MQ=255) ggggTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGATCCGTTCACCGTCa > 2:796024/1‑100 (MQ=255) gggTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCAccagatc > 1:322649/1‑95 (MQ=255) ggtaTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGa > 1:1453509/1‑100 (MQ=255) ggtaTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGa > 2:2610436/1‑100 (MQ=255) taTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCAGCGTCAGGCTGATc > 2:1338737/1‑100 (MQ=255) taTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATc < 1:2582691/100‑1 (MQ=255) aTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATcc < 1:2286131/100‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTTAACCCGCTCGCCGCACTAGATTATGCGGCCAGCGGTTTAGTCGTGCGGCGGTCCAGTATTGCGGTTCCGTTCCCCGGCAGCCTGATc < 2:1293910/98‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATc < 2:1235868/98‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCg < 1:1685793/100‑1 (MQ=255) tCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTCCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGcc > 2:1963294/1‑100 (MQ=255) ggtggtTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGcccc > 1:732895/1‑100 (MQ=255) gtTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGc > 2:1707488/1‑100 (MQ=255) gtTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGc < 2:1240508/100‑1 (MQ=255) ttAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGc > 2:963961/1‑99 (MQ=255) ttAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCa < 2:2603409/100‑1 (MQ=255) aCCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCg > 1:190792/1‑100 (MQ=255) CCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGcc > 1:1707503‑M1/1‑100 (MQ=255) | ACTGAACATCAGGTTAAACGACGCATGATCGTAGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCC > NC_000913/2979654‑2979852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |