New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2979753 = | 78 (0.720) | 13 (0.130) | 10/168 | NT | 15.8% | coding (733/936 nt) | lysR | transcriptional activator of lysA; autorepressor |
? | NC_000913 | 2979785 = | 65 (0.630) | coding (765/936 nt) | lysR | transcriptional activator of lysA; autorepressor |
AGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGG > NC_000913/2979686‑2979884 | gcggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGt > 1:917964‑M1/68‑100 (MQ=255) ctggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGt > 1:1581972‑M1/68‑100 (MQ=255) aGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGAGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGt < 2:1855409/100‑1 (MQ=255) gAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGtt > 2:1424048/1‑100 (MQ=255) ggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCggtag < 2:1581959‑M1/35‑3 (MQ=255) ggtgcagggggcggatcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGttt > 1:61376‑M1/66‑100 (MQ=255) aaaCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGttt < 1:621966/100‑1 (MQ=255) aaCCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGttt < 2:6310/99‑1 (MQ=255) cccACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAg < 1:2839745/99‑1 (MQ=255) cacaGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAgtgg > 1:918126/1‑100 (MQ=255) gggggcggatcaggctgacggtgaacggcaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAgtgg > 2:2429021‑M1/60‑99 (MQ=255) caGCGGCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAgtgg < 2:2806680/98‑1 (MQ=255) gcgcCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTgcg < 1:2376976/100‑1 (MQ=255) cgccgcGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTgcgg > 2:2052705/1‑100 (MQ=255) tcttccgatctCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTgcggc < 2:394107/90‑1 (MQ=255) cgcgTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGcggcgg < 2:2250486/100‑1 (MQ=255) gcgTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGt > 1:1979907/1‑100 (MQ=255) tcaggctgacggtgaacggaaccgcaatactgaaccgccgcaccactaaaCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGtt > 1:1687515‑M1/51‑100 (MQ=255) gTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTc < 1:725541/100‑1 (MQ=255) gTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTc < 1:2875500/100‑1 (MQ=255) cAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAg < 2:1774204/100‑1 (MQ=255) tCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAg < 2:2511849/97‑1 (MQ=255) tCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTAt > 2:2796070/1‑100 (MQ=255) tGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTAtt > 1:2603434/1‑99 (MQ=255) cgcAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCg > 1:1240516/1‑100 (MQ=255) cgcAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCg > 1:1439527/1‑100 (MQ=255) gcAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATAATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCgg < 2:1964248/100‑1 (MQ=255) cAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGt > 2:989978/1‑100 (MQ=255) cAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGt > 2:792207/1‑100 (MQ=255) ggTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCg > 1:2204/1‑100 (MQ=255) ggTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCg > 1:2054000/1‑100 (MQ=255) aCGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTc > 2:3002759/1‑100 (MQ=255) cgggcgggGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTc < 2:1787271/99‑1 (MQ=255) cgggcgggGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATAGCGGTTCCGTTCa > 1:1807953/1‑100 (MQ=255) gatctgggTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCAcc < 2:322647/95‑1 (MQ=255) gcgggGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCg < 1:2027964/100‑1 (MQ=255) ggggTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGATCCGTTCACCGTCa > 2:796024/1‑100 (MQ=255) gggTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCAccagatc > 1:322649/1‑95 (MQ=255) ggtaTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCCGCCTGa > 2:1209441/1‑100 (MQ=255) ggtaTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGa > 1:1453509/1‑100 (MQ=255) ggtaTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGa > 2:2610436/1‑100 (MQ=255) aaccgccgcaccactaaaccgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGa > 1:1687515‑M2/51‑100 (MQ=255) taTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCAGCGTCAGGCTGATc > 2:1338737/1‑100 (MQ=255) taTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATc < 1:2582691/100‑1 (MQ=255) aTTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATcc < 1:2286131/100‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTTAACCCGCTCGCCGCACTAGATTATGCGGCCAGCGGTTTAGTCGTGCGGCGGTCCAGTATTGCGGTTCCGTTCCCCGGCAGCCTGATc < 2:1293910/98‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATc < 2:1235868/98‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCg < 1:1685793/100‑1 (MQ=255) tCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTCCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGcc > 2:1963294/1‑100 (MQ=255) ggtggtTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGcccc > 1:732895/1‑100 (MQ=255) ccactaaaccgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTGCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGccccc > 2:2429021‑M2/41‑99 (MQ=255) gtTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGc < 2:1240508/100‑1 (MQ=255) gtTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGc > 2:1707488/1‑100 (MQ=255) ttAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGc > 2:963961/1‑99 (MQ=255) ttAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCa < 2:2603409/100‑1 (MQ=255) ctaccgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCAcc < 2:1581959‑M2/65‑1 (MQ=255) aaaccgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCAcc > 1:61376‑M2/36‑100 (MQ=255) aCCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCg > 1:190792/1‑100 (MQ=255) tccgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGc > 2:151580‑M2/34‑100 (MQ=255) accgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGcaccag > 1:1581972‑M2/34‑98 (MQ=255) accgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGc > 1:917964‑M2/34‑100 (MQ=255) ccgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCCCCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGcc > 2:2580976‑M2/33‑100 (MQ=255) ccgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGcc > 2:3052655‑M2/33‑100 (MQ=255) ccGCTCACCGCACTAGAGTATGCGGCAAGCGGTCTAGTGGTGCGGCAGCTCAGTCTTGCGGTTCCGTTCACCGTCCGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGcc > 2:992931/1‑100 (MQ=255) CCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGcc > 1:1707503‑M1/1‑100 (MQ=255) cgcttgccgcataatctagtgcggtgagcggGTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGccc > 2:1802874‑M2/32‑100 (MQ=255) ttgccgcaaaatctagtgcggcaagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGGTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGAACCCAGCa > 2:2283506‑M2/29‑91 (MQ=255) tgccgcataatctagtgcggtgagcggGTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtca > 1:1676405‑M2/28‑100 (MQ=255) cACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtca > 2:2655894/1‑100 (MQ=255) gccgcataatctagtgcggtgagcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtcat > 2:1221257‑M2/27‑100 (MQ=255) aCCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtcat > 1:2736612/1‑100 (MQ=255) ccGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtcatc > 2:969948/1‑100 (MQ=255) ccGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtcatc < 2:2002686/100‑1 (MQ=255) cGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtcatca < 1:1379840/100‑1 (MQ=255) cGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGtcatca > 2:57161/1‑100 (MQ=255) gCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAg > 1:3020343/1‑100 (MQ=255) gCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAg < 2:2356684/100‑1 (MQ=255) cACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAgc < 1:827899/100‑1 (MQ=255) aCTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAgcg < 2:1639373/100‑1 (MQ=255) aCTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAgcg < 1:989983/100‑1 (MQ=255) aCTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTAAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGCTCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATAAgcg < 2:1231994/100‑1 (MQ=255) aGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTg < 1:33758/100‑1 (MQ=255) gATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTgg > 2:1390744/1‑100 (MQ=255) gATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTg < 2:56069/99‑1 (MQ=255) aTTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTgg < 2:2947972/99‑1 (MQ=255) ttATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGtt > 1:460485/1‑100 (MQ=255) tttGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTc < 2:280487/98‑1 (MQ=255) tATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTc > 2:106557/1‑100 (MQ=255) gCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAgg < 2:2999099/100‑1 (MQ=255) gCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAgg < 2:63731/100‑1 (MQ=255) gCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGt > 2:68766/1‑100 (MQ=255) cAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGtt > 2:1779821/1‑100 (MQ=255) aaGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGttt < 1:1147661/100‑1 (MQ=255) gcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAg > 1:917124‑M2/5‑100 (MQ=255) gcggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAg > 2:1369301‑M2/5‑100 (MQ=255) cggTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGt > 1:877910‑M2/4‑100 (MQ=255) gTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGcgtttcg > 2:2523994‑M2/2‑95 (MQ=255) gTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTgg < 2:2564502‑M2/99‑1 (MQ=255) gTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTgg > 1:537249‑M2/2‑100 (MQ=255) tttAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCGCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTAAGGCGTTTAGTggg < 2:1214331/100‑1 (MQ=255) | AGAAACCCACAGCGCCGCGTCAGTCTGCGCAATGGTACGGGCGGGGGTAGGTATTTCGGTGGTTAACCCGCTCACCGCACTAGATTATGCGGCAAGCGGTTTAGTGGTGCGGCGGTTCAGTATTGCGGTTCCGTTCACCGTCAGCCTGATCCGCCCCCTGCACCGCCCGTCATCAGCGCTGGTTCAGGCGTTTAGTGGG > NC_000913/2979686‑2979884 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |