| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4611259 = | 102 (1.180) | 4 (0.050) | 3/162 | NT | 4.2% | intergenic (+256/‑137) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/salt‑inducible putative ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 4611304 = | 89 (1.130) | intergenic (+301/‑92) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/salt‑inducible putative ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAACCTCGTGTTGCC > NC_000913/4611160‑4611358 | tagtcatcgatttattcctgtatgtttgctcgtaattttaggctggcatcacgaggttgcattggggaatagggagtgacttcaccctctacagaagtca > 2:449776‑M1/100‑100 (MQ=255)tagtcatcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtca < 1:2015603‑M1/1‑1 (MQ=255)tagtcatcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagaatggcaacacgaggttgcattgctgaataggtagagacttcaccatctacagaagtca < 2:191209‑M1/1‑1 (MQ=255)cATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTa > 2:2357161/1‑100 (MQ=255)cATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTa > 2:1145887/1‑100 (MQ=255) gtcatcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcaa > 1:1894420‑M1/98‑99 (MQ=255) gtcatcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAAt > 2:842869‑M1/98‑100 (MQ=255) gtcatcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAAt < 2:2300335‑M1/3‑1 (MQ=255) gtcatcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAAt < 2:2299820‑M1/3‑1 (MQ=255) tcatcgatttattcgtgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATg > 2:1633373‑M1/97‑100 (MQ=255) tCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATgg < 1:1282811/100‑1 (MQ=255) tCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATgg > 2:1748856/1‑100 (MQ=255) catcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATgg < 1:1114525‑M1/5‑1 (MQ=255) catcgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATgg < 2:2255664‑M1/5‑1 (MQ=255) cTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGt > 2:401306/1‑100 (MQ=255) tGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTc < 1:2372835/100‑1 (MQ=255) gACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCg < 2:1178346/100‑1 (MQ=255) gACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCg < 2:596116/100‑1 (MQ=255) cgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgtattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATGGTCg < 2:874478‑M1/8‑1 (MQ=255) cgatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATGGTCg > 2:1855335‑M1/93‑100 (MQ=255) cgattcattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATGGTCg > 2:2401141‑M1/93‑100 (MQ=255) gatttattcctgtatgtttgctcgtaatttgagcctggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATg < 1:334909‑M1/4‑1 (MQ=255) gCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTAt < 2:1084429/100‑1 (MQ=255) tAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATtcat > 1:2307863/1‑100 (MQ=255) aTACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCAc > 1:2288098/1‑100 (MQ=255) tACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACt < 1:1171654/100‑1 (MQ=255) ccGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCa < 2:784810/100‑1 (MQ=255) gTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATc > 2:39997/1‑100 (MQ=255) ttCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCg > 2:802395/1‑100 (MQ=255) atctaTGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCg < 2:1412456/96‑1 (MQ=255) tCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGc < 1:2355088/100‑1 (MQ=255) aTGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCgagat > 1:1412471/1‑96 (MQ=255) aTGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCttt < 2:612882/100‑1 (MQ=255) aTGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCCTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTTATGGTCGTTATTCATCACTCATCga < 2:829781/97‑2 (MQ=255) gCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTTAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTtg < 2:370690/100‑1 (MQ=255) cGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTtgt > 2:599407/1‑100 (MQ=255) ctAGATCTCAGTATCTAAAGCCGTCAATTGCCATCCTACCCAAATTAACAACCGATCTCGACCCTGTAACAGCCGTTATTCACCCCTcct > 2:1597250/2‑88 (MQ=255) atatCAGTATCTAAAGCCTTCGATTGTCATTCTACCGATATTCATAACTGATTCAGTGGCTGTAATGGGCGTTATTCATCCCTCATCGCTTTTGTGATg < 2:115874/99‑1 (MQ=255) tatCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGc < 1:401309/100‑1 (MQ=255) tatCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGc < 2:1600545/100‑1 (MQ=255) atCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCg > 2:410788/1‑100 (MQ=255) atCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCg < 1:542149/100‑1 (MQ=255) cAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAc > 2:1739734/1‑100 (MQ=255) cAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAc < 1:1479467/100‑1 (MQ=255) cAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAc < 2:1007227/100‑1 (MQ=255) cAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAc < 1:835654/100‑1 (MQ=255) cAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAc < 1:686021/100‑1 (MQ=255) cAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAc < 1:579925/100‑1 (MQ=255) aGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACACATCGCTTTTGTGATGGCGAcc > 1:100049/1‑100 (MQ=255) ggcaacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCAtt > 1:935065‑M1/56‑100 (MQ=255) tCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTg > 1:932781/1‑100 (MQ=255) cTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGa < 1:245194/100‑1 (MQ=255) tAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGAc > 1:1181237/1‑100 (MQ=255) tAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGAc > 1:1271269/1‑100 (MQ=255) tAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATGAAAAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGAGACCATTGAc > 2:1579364/1‑100 (MQ=255) tAAAGCCGTCGATGGGCATTCTACCGATATTAATAACTTATTCAGAGGCTGTAATGGTCGGTAGTGATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGAc > 2:1914624/1‑100 (MQ=255) aacacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGAc > 1:1129210‑M1/53‑100 (MQ=255) acacgaggttgcattgctgaatagggagagacttcaccctctacagaagtcAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACt > 1:778382‑M1/52‑100 (MQ=255) aaaGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATTACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGAc < 2:1488898/99‑1 (MQ=255) aaaGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACt < 2:1533251/100‑1 (MQ=255) aaaGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACt < 2:1793571/100‑1 (MQ=255) aaGCTGTCGATTGTCATGCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATTACTCATCGCTTTTGTGATGGAGACCATTGAc < 2:434429/98‑1 (MQ=255) gCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCt > 1:655872/1‑100 (MQ=255) gTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGATGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTTATGGCGACCATTGACTTCTGTa < 2:455530/100‑1 (MQ=255) ttttCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCTCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAgg < 2:83420/96‑1 (MQ=255) ttGTCATTCTACCGATATTAATAACTTATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAggg < 1:2124483/100‑1 (MQ=255) ttGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAggg < 2:742765/100‑1 (MQ=255) ttGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAggg > 1:684929/1‑100 (MQ=255) tGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGt < 1:387697/100‑1 (MQ=255) cATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAAAGGGTGaa > 1:51250/1‑100 (MQ=255) aTTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTTTAGAGGGTGa > 1:2150354/1‑98 (MQ=255) aTTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAg < 1:1309347/100‑1 (MQ=255) tCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTTTGTAGAGGGTGAAGtc > 1:188106/1‑100 (MQ=255) tCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGtc < 1:1922869/100‑1 (MQ=255) gATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATTGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTcct < 2:426600/100‑2 (MQ=255) gATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTccc > 1:2052419/1‑100 (MQ=255) gATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTccc < 1:1739755/100‑1 (MQ=255) ttAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTAtt > 1:485965/1‑100 (MQ=255) ttAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTAtt > 1:1855436/1‑100 (MQ=255) taataaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTc > 1:192697/1‑100 (MQ=255) taataaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTGATTCATCACTCATCGCTTTTGGTATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTccc < 1:2174916/95‑1 (MQ=255) aataaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCa > 1:2211379/1‑100 (MQ=255) aataaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCa < 2:1957174/100‑1 (MQ=255) aataaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCa < 2:1533156/100‑1 (MQ=255) ataaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAg < 2:2172183/100‑1 (MQ=255) taaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGc < 1:570048/100‑1 (MQ=255) aaCTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCa < 1:1411837/100‑1 (MQ=255) cTGATTCAGAGGCTGTAATGGTAGGGATGAATAACTCATCGATGTGGTGAGGGCGACGGTGGACTTCTGTAGAGGTTGAATGCGCTCCCTATTCAGCaa > 2:1393851/1‑99 (MQ=255) tGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATg < 2:653983/100‑1 (MQ=255) gATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGc > 2:1710933/1‑100 (MQ=255) gATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGc > 1:1212599/1‑100 (MQ=255) ttCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCaa > 1:1589931/1‑100 (MQ=255) cAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAAcc < 1:1771119/100‑1 (MQ=255) cAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAAcc > 2:143490/1‑100 (MQ=255) gagGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAACCTc > 2:1293810/1‑100 (MQ=255) tGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGAATTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAAcacgaggtt < 2:728864/100‑9 (MQ=255) gTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAACCTCGTGTTg > 1:1538840/1‑100 (MQ=255) tAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCACCCTATTCAGCAATGCAACCTCGTGTTg > 2:953951/1‑99 (MQ=255) AATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTTACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAACCTCGTGTTGcc < 2:1352778‑M1/100‑1 (MQ=255) AATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGTGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAACCTCGTGTTGcc > 2:1117777‑M1/1‑100 (MQ=255) | CATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGCAACCTCGTGTTGCC > NC_000913/4611160‑4611358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |