| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3083831 = | 88 (0.960) | 16 (0.200) | 11/160 | NT | 17.2% | intergenic (‑34/+104) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding |
| ? | NC_000913 | 3083868 = | 75 (0.920) | intergenic (‑71/+67) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding | |||||
TAAGTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3083937‑3083831‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggaagggttGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTAC > NC_000913/3083868‑3083965 TAAGTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGG < 1:1192929/100‑1TAAGTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGG > 1:2413190/1‑100TAAGTCCTGAGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGG > 2:2513103/1‑100 AGTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAA > 2:2516811/1‑100 GTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAG < 1:30129/100‑1 GTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAG > 2:1477190/1‑100 GTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAG > 1:772248/1‑100 TCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGG > 2:982395/1‑100 CCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGG > 2:2411785/1‑100 TGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTT > 1:1894577/1‑100 CTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTG > 1:1456652/1‑100 CGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCGAACCCTTCCTCGTCGGGGCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATA > 1:545446/1‑100 GCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTA > 1:2043271/1‑100 CAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTATCAC > 1:763705/1‑100 CAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACAC > 1:763854/1‑100 ACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAG > 1:1396757/1‑100 ACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAG > 2:1440145/1‑100 CCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGG > 2:564778/1‑100 CCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGG > 1:1357550/1‑100 CCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGA > 2:2358261/1‑100 CCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGA > 1:1446863/1‑100 CTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGAC > 2:2237680/1‑100 CTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGAC > 1:2554848/1‑100 TTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACT > 1:415795/1‑100 TCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACT < 2:1357541/100‑1 GGGCCTAACGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCT > 2:1079307/1‑100 gaAAGGGTTGGATATGTCACAATAAATTGTGACGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATA > 1:1727963/3‑100 GGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATA > 1:651179/1‑100 GGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGT > 1:538010/1‑100 GGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGT > 1:453516/1‑100 TTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTAC < 1:629821/100‑1 TTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTAC < 2:1954497/100‑1 TTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTAC < 2:678127/100‑1 TAAGTCCTGTGTTACTTGAATCCGCTTAATTTAGCGGTGATAATCCGCCACAATTTATTGTGACAAATCCAACCCTTCCTCGTCGGGCCTAACGACGCGGAAGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3083937‑3083831‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggaagggttGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTAC > NC_000913/3083868‑3083965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |