| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3083831 = | 88 (0.960) | 16 (0.200) | 11/160 | NT | 17.2% | intergenic (‑34/+104) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding |
| ? | NC_000913 | 3083868 = | 75 (0.920) | intergenic (‑71/+67) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTAC > NC_000913/3083769‑3083965 | gtgttacttgaatccgcttaatttagcggtgataatccgccacaatttattgtgacaaatccAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTg > 1:763854‑M1/63‑100 (MQ=255)gtgatacttgaatccgcttaatttagcggtgataatccgccacaatttattgtgacaaatccAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTg > 1:763705‑M1/63‑100 (MQ=255) tCGTAGTGATGACCTAAGGTGCTCAGGGATGGACTCCTATTACAAAGACGATATGAAAAGGCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGAt < 2:2017916/100‑1 (MQ=255) cttgaatccgcttaatttagcggtgataatccgccacaatttattgtgacaaatccaacccttcctcgtcgggcctaacgacgcggaagggttGGATTTg > 1:1456652‑M2/94‑100 (MQ=255) ttGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTc < 2:630476/100‑1 (MQ=255) ttGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTc < 1:2543867/100‑1 (MQ=255) tgatgaCCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTGAGGCCCGACGGGGAAGGGTTGGATTTGTca > 2:605235/1‑100 (MQ=255) gatgaCCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTcac > 2:1256030/1‑100 (MQ=255) atgaCCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTcaca < 2:789331/100‑1 (MQ=255) tgaCCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACaa > 2:1170227/1‑100 (MQ=255) cgcttaatttagcggtgataatccgccacaatttattgtgacaaatcgaacccttcctcgtcggggctaacgacgcggaagggttGGATTTGTCACAATa > 1:545446‑M2/86‑100 (MQ=255) ccTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATaa > 2:518526/1‑100 (MQ=255) ccTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATaa > 2:1815184/1‑100 (MQ=255) 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1:263155/100‑1 (MQ=255) tagcggtgataatccgccacaatttattgtgacaaatccAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGc > 1:2043271‑M1/40‑100 (MQ=255) gCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGc > 1:1254280/1‑100 (MQ=255) cATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGa > 1:1844923/1‑100 (MQ=255) tggatggaCTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGAtt > 1:943598/1‑100 (MQ=255) tggatggaCTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGAtt > 2:375361/1‑100 (MQ=255) gatggaCTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTAt > 1:164497/1‑100 (MQ=255) ggaCTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCAc > 2:1523265/1‑100 (MQ=255) ggaCTCCTACTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGACCCTACGAGGAAGGGTTGGATTTGTTACAATAAATTGTGGCGGATTATCAc < 1:2549623/100‑1 (MQ=255) gaCTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCAcc < 1:1170235/100‑1 (MQ=255) gaCTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCAcc > 2:2553257/1‑100 (MQ=255) aCTCCTATTACAAAGTCGATATAAACAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCg > 2:2377331/1‑100 (MQ=255) gccacaatttattgtgacaaatccaacccttcctcgtcgggcctaacgacgcggaagggttGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTa > 1:2043271‑M2/62‑100 (MQ=255) ccTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCAACGc > 2:1023135/1‑98 (MQ=255) ccTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCCGATAATCACCGCTa > 1:605775/1‑100 (MQ=255) atctACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTaaa < 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tattgtgacaaatccAACCCTTCCGCGTCGTTAGCCCCGACGAGGAAGGGTTCGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCg > 1:545446‑M1/16‑100 (MQ=255) cGATATAGAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGAtt < 1:943019/100‑1 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa > 1:1674601/1‑100 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa > 2:201604/1‑100 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa < 2:2347574/100‑1 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa > 2:314976/1‑100 (MQ=255) caaatccAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAg > 1:1456652‑M1/8‑100 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGt > 2:133833/1‑100 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGt < 1:1268308/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTa > 2:159356/1‑100 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTa < 2:2279809/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTa > 1:703177/1‑100 (MQ=255) aaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTaa > 1:2295908/1‑100 (MQ=255) aaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAac > 2:229431/1‑100 (MQ=255) aaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAac > 1:1056790/1‑100 (MQ=255) 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NC_000913/3083769‑3083965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |