| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4548883 = | 102 (1.120) | 7 (0.090) | 5/160 | NT | 7.8% | coding (76/903 nt) | fimH | minor component of type 1 fimbriae |
| ? | NC_000913 | 4548916 = | 73 (0.890) | coding (109/903 nt) | fimH | minor component of type 1 fimbriae | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGATC > NC_000913/4548784‑4548982 | gCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTaaaa > 2:475165/1‑100 (MQ=255) taatcgttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccAc < 2:1591776‑M1/2‑1 (MQ=255) tGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAAcc < 1:2527036/100‑1 (MQ=255) tGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAAcc > 2:2033968/1‑100 (MQ=255) aatcgttatggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccAcc > 1:975016‑M1/98‑100 (MQ=255) aCCCGAATAGATGATCGTAACGATACGAGTTATTACCCTGTTTGATGTACTGCTGATGTGCTGGTCGGTAAATGCCTTGTCATTCGCCTGTAAAACCg < 2:2152983/98‑1 (MQ=255) aCCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATTGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGcc < 1:515437/100‑1 (MQ=255) cccGAAGATGTGATTGTAATGAAGCGAGTTATTACCCGGTTGGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAGTGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGcc < 2:1480982/99‑1 (MQ=255) cccGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCa > 2:876052/1‑100 (MQ=255) cccGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACACTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCa > 2:1159216/1‑100 (MQ=255) cGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAAt < 1:881098/100‑1 (MQ=255) cGAAGAGATGAGTGTAATGAAACGAGTGATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGGCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGcc < 2:1203239/97‑1 (MQ=255) atggcaaaagatttgcgtcgaaagatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcggtggcAGCGCCAATg > 1:1065590‑M1/91‑100 (MQ=255) aaGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATgg < 2:2261919/100‑1 (MQ=255) gagaTGATTGTAATGAAGCTAGTTATTATCCTGTTTGCTGTACTTCTTATGGGCTGGTTGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGt > 2:1016393/1‑99 (MQ=255) gatgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTAcc > 1:1295121/1‑100 (MQ=255) gatgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTAcc < 1:2330896/100‑1 (MQ=255) gatgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTAATTCGCCTGTACAACCGCCAATGGTAcc > 2:1136277/1‑100 (MQ=255) atgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCg < 1:289293/100‑1 (MQ=255) tgatTGTAATGAAGCGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGc < 2:2338341/100‑1 (MQ=255) tgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGc < 1:2011826/100‑1 (MQ=255) tgatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGc < 2:2476268/100‑1 (MQ=255) gatTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCt > 1:1507140/1‑100 (MQ=255) tGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATc > 1:1298067/1‑100 (MQ=255) gTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATcc > 1:508032/1‑100 (MQ=255) tAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATccc < 1:521340/100‑1 (MQ=255) aTGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTTGGTAACTGCCTCGTAATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGCTACCGCTATCCCTa > 2:656729/1‑100 (MQ=255) aTGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCt > 1:275559/1‑99 (MQ=255) gAAACGAGTTATTACCCTGTTTGTTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTAtt > 1:371737/1‑100 (MQ=255) gAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTCAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTAtt > 2:1675532/1‑100 (MQ=255) gAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTAtt > 1:911174/1‑100 (MQ=255) gAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTAtt > 1:656022/1‑100 (MQ=255) gAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTAtt > 1:655606/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTg > 2:197874/1‑100 (MQ=255) agatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCgg > 1:766507‑M1/69‑100 (MQ=255) gatccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaacgtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGt > 1:1177450‑M1/68‑100 (MQ=255) aGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAACTGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTCTCCCTATTGGCgg > 2:1791832/1‑99 (MQ=255) gTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTg < 1:2375828/100‑1 (MQ=255) ttattaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTgg < 1:1774551/100‑1 (MQ=255) ttattaCCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTgg < 1:1136285/100‑1 (MQ=255) ccacgaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGc > 1:1831512‑M1/65‑100 (MQ=255) cacgaacaggtgttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCCATCCCTATTGGCGGTg > 1:809935‑M1/64‑97 (MQ=255) caccaccaggttttgccccacattcccgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATCGTACCGCTAGCCCTATTGGCGGt > 2:877569‑M1/64‑96 (MQ=255) gaccaggttttgccccacattcacgacgggcgcaaggtttacataaacattggcgctgccACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAgcg > 2:2099706‑M1/61‑100 (MQ=255) cccTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAgcgc > 1:1422040/1‑100 (MQ=255) gTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGCTGCCACCGCCAAt < 2:439236/100‑1 (MQ=255) gTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGCTGCCACCGCCAAt < 1:2075084/100‑1 (MQ=255) tGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGtt < 1:1289825/100‑1 (MQ=255) tGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGtt < 1:2309935/100‑1 (MQ=255) tGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGtt > 2:807312/1‑100 (MQ=255) tGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGCTGCCACCGCCAAtagg < 2:827622/100‑4 (MQ=255) gCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGttt > 1:293271/1‑100 (MQ=255) cTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTa < 1:1596574/100‑1 (MQ=255) gTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATg < 2:7825/100‑1 (MQ=255) ctgATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAAcc < 1:923782/100‑1 (MQ=255) aTGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTg > 1:200049/1‑100 (MQ=255) tGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTgc > 2:525146/1‑100 (MQ=255) tGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTgc > 1:1211183/1‑100 (MQ=255) tGGGCTGGTCGGTAAATGCCAGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTgc > 2:1564534/1‑100 (MQ=255) ggCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTgcgc > 1:2147698/1‑100 (MQ=255) gCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTAATGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGcc < 2:2238979/100‑1 (MQ=255) ggTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCcgt < 1:197876/100‑1 (MQ=255) gTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCcgtc < 1:139837/100‑1 (MQ=255) tCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATTGTACCGCTATCCCTATTGGCGGAGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCcgtcg < 2:1368427/100‑1 (MQ=255) tCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCcgtcg < 2:1876860/100‑1 (MQ=255) ggTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTg > 1:988389/1‑100 (MQ=255) ggTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTg > 1:788919/1‑100 (MQ=255) gTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGa > 2:400127/1‑100 (MQ=255) tAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGaa < 1:2079573/100‑1 (MQ=255) tAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGaa < 1:75379/100‑1 (MQ=255) tAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGaa < 1:75437/100‑1 (MQ=255) aaaTGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAAt > 1:1773105/1‑100 (MQ=255) tGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAAtgtg > 2:1750365/1‑100 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg > 1:359863/1‑100 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg < 1:2162978/100‑1 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg > 2:793063/1‑100 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg > 1:289956/1‑100 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCACGTCGTGAATGTggg > 1:2519503/1‑100 (MQ=255) ccTGGTCATTCGCCTCTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTggg < 1:2524832/100‑1 (MQ=255) cTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTgggg < 2:52139/100‑1 (MQ=255) cTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTgggg < 1:1421404/100‑1 (MQ=255) tGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTCAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGc > 2:717884/1‑100 (MQ=255) ggTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATACCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCa > 2:1367878/1‑100 (MQ=255) tCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCaga > 1:1320819/1‑98 (MQ=255) ttCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAAcc < 1:1792358/100‑1 (MQ=255) ttCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAAcc > 1:651228/1‑100 (MQ=255) gCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTgg < 2:2147684/100‑1 (MQ=255) gCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTgg < 2:1211175/100‑1 (MQ=255) gCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTgg > 1:45535/1‑100 (MQ=255) ccTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGt > 2:318961/1‑100 (MQ=255) ccTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGt < 1:850656/100‑1 (MQ=255) cTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTc > 1:1591787/1‑100 (MQ=255) tGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCg > 2:874593/1‑100 (MQ=255) tAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTg < 1:807319/100‑1 (MQ=255) aaaaCCGCCAATGGTACTGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTgg > 2:2003075/1‑100 (MQ=255) aaaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCCATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGttg < 2:682258/100‑3 (MQ=255) aaaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTgg > 2:1750947/1‑100 (MQ=255) aaaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATGGGAGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAAACTTGCGTTCGCCGTGAATGAGGGGCAAAAAATGGTCGt > 2:543039/1‑97 (MQ=255) aaCCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGAt > 1:314639/1‑100 (MQ=255) ACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGATc > 1:945445‑M1/1‑100 (MQ=255) | GCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCTGGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGCGGTGGCAGCGCCAATGTTTATGTAAACCTTGCGCCCGTCGTGAATGTGGGGCAAAACCTGGTCGTGGATC > NC_000913/4548784‑4548982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |