New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4585553 = | 128 (1.040) | 2 (0.020) | 5/166 | NT | 1.8% | coding (1209/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme |
? | NC_000913 | 4585576 = | 101 (0.880) | coding (1186/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
ATCGGCAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGT > NC_000913/4585454‑4585652 | ggcaggacaccagcggcaaacaacggtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctg > 2:318046‑M1/100‑100 (MQ=255) tCGGCAAACCACGGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTCAGGCTTTCGACATATTGCgg > 1:2714584/1‑99 (MQ=255) gcaggacaccagcggcaaacaacggtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctgg < 2:2594367‑M1/2‑1 (MQ=255) caggacaccagcggcaaacaacggtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctGGt > 2:837930‑M1/98‑100 (MQ=255) caggacaccagcggcaaacaacggtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctGGt < 1:1180487‑M1/3‑1 (MQ=255) ngCAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTa > 1:1910719/2‑100 (MQ=255) aggacaccagcggcaaacaacggtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctGGTa < 1:866051‑M1/4‑1 (MQ=255) ggacaccagcggcaaacaacggtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctGGTAt < 2:575764‑M1/5‑1 (MQ=255) gCAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTCAGGCTTTCGACATATTGCGGGTAt > 1:2824196/1‑100 (MQ=255) gCAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTAt < 2:957007/100‑1 (MQ=255) naaaCCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGTCACTCGGGTAAAGCTTTCGACATATTGCggg > 1:2000342/2‑96 (MQ=255) cAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATc > 2:1347720/1‑100 (MQ=255) cAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATc < 1:722754/100‑1 (MQ=255) cAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATc > 2:6787/1‑100 (MQ=255) aaaCCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATca > 2:2963053/1‑100 (MQ=255) ccACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATcac < 1:2896359/98‑1 (MQ=255) ccACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGATTTCGACATATTGCGGGTATcacgc > 2:2876342/1‑100 (MQ=255) cACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATcacgca > 2:917580/1‑100 (MQ=255) cACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATcacgca > 1:1631110/1‑100 (MQ=255) gATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑c < 2:757230/100‑1 (MQ=255) gATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑c < 2:487114/100‑1 (MQ=255) aTTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑cg > 1:196039/1‑100 (MQ=255) tCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑cgcg > 1:2561073/1‑100 (MQ=255) cTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGa > 2:2178181/1‑100 (MQ=255) tGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGAt > 1:1801491/1‑100 (MQ=255) gTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGa > 1:3352477/1‑98 (MQ=255) gTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATa < 2:1494420/100‑1 (MQ=255) gTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATa > 1:1416271/1‑100 (MQ=255) ttttGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATAcc > 2:2615814/1‑100 (MQ=255) acggtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctGGTATCACGCACGT‑CGCGATAcc > 2:1935982‑M1/78‑100 (MQ=255) tttGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGCTACCa > 1:319779/1‑100 (MQ=255) ttGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCa < 2:1896290/99‑1 (MQ=255) ttGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAg < 2:304603/100‑1 (MQ=255) tGCGGTGCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAg < 1:3325893/99‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGc < 2:1168766/100‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGc < 1:915532/100‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGc > 2:2125628/1‑100 (MQ=255) gTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATg > 1:1086650/1‑98 (MQ=255) gTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGcc < 2:1616563/100‑1 (MQ=255) gCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCtt > 2:2024769/1‑100 (MQ=255) tGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCtttt < 1:3091567/100‑1 (MQ=255) gCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTg > 1:3389752/1‑100 (MQ=255) ccGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTgg < 2:3389781/100‑1 (MQ=255) ccGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTgg < 1:2550309/100‑1 (MQ=255) cGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGt > 2:2262049/1‑100 (MQ=255) aGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCt > 2:2566982/1‑100 (MQ=255) cATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTc < 2:445171/100‑1 (MQ=255) cATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTc < 1:1433265/100‑1 (MQ=255) cATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTc > 2:34049/1‑100 (MQ=255) aTTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCa < 1:841061/100‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTACCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTc > 1:1383588/1‑99 (MQ=255) tttCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCGCTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAt < 1:1328089/100‑1 (MQ=255) tttCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAt > 2:2449835/1‑100 (MQ=255) tttCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAt > 2:385919/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgt > 1:3280916/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgt > 2:3272158/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGAGGCCGCTTTTGGTCTTCAttgt > 1:2422733/1‑100 (MQ=255) cagcagCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgtt > 1:1005231/1‑100 (MQ=255) agcagcTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgttg < 1:36133/100‑1 (MQ=255) gcagcTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTgc > 2:2745580/1‑100 (MQ=255) nctctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGAGACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGcgcg > 1:1783002/2‑100 (MQ=255) ctctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTgcgctg < 2:1206158/100‑3 (MQ=255) ctctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCgg < 2:1965312/100‑1 (MQ=255) tctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGt > 2:1676366/1‑100 (MQ=255) ctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATCCCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTa > 1:2976318/1‑100 (MQ=255) ctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGTCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTa < 2:2729618/100‑1 (MQ=255) ttCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTAt > 1:227295/1‑100 (MQ=255) ccGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTc > 1:2940259/1‑100 (MQ=255) gCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCgcgc > 1:1260068/1‑100 (MQ=255) ctgTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGcc < 1:2304139/98‑1 (MQ=255) gTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCg < 1:1303640/100‑1 (MQ=255) gTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCg > 1:3106530/1‑100 (MQ=255) cACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTgg < 2:2854870/100‑1 (MQ=255) aCTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGt < 1:3143326/100‑1 (MQ=255) cTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTc < 2:1446786/100‑1 (MQ=255) tCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCg < 1:1019030/100‑1 (MQ=255) tCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCg < 2:683602/100‑1 (MQ=255) gggTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAg > 2:3056437/1‑100 (MQ=255) gTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTa < 1:1686848/100‑1 (MQ=255) ggCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAg > 1:1317512/1‑100 (MQ=255) ggCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAg > 2:1092806/1‑100 (MQ=255) gCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGa < 2:3108659/100‑1 (MQ=255) tCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAggg < 1:2497348/100‑1 (MQ=255) gACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGa > 2:1805184/1‑100 (MQ=255) gACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGa > 2:1503777/1‑100 (MQ=255) gACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGa > 1:2348146/1‑100 (MQ=255) gACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGGCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGa > 2:2461730/1‑100 (MQ=255) aCATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAt < 2:175454/100‑1 (MQ=255) aCATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAt < 2:608119/100‑1 (MQ=255) cATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAtt > 2:369921/1‑100 (MQ=255) atatTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAttt > 2:2315364/1‑100 (MQ=255) atTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTa > 1:2330117/1‑100 (MQ=255) catctGGTATCGCG‑ACGTGCGTGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAtttt < 1:388130‑M1/93‑1 (MQ=255) atctGGTATCGCG‑ACGTGCGTGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTaaa < 1:1155869‑M1/96‑1 (MQ=255) tctGGTATCGCG‑ACGTGCGTGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAAc < 1:1605474‑M1/97‑1 (MQ=255) gCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAAc > 2:1779234/1‑100 (MQ=255) gCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAAc < 1:2575186/100‑1 (MQ=255) gCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAAc < 1:3279691/100‑1 (MQ=255) cGGGTATCACGCCCGT‑CGCGATACCAGAGGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGGTGTATTGGCGCCATTAGGTCGAGTAGCAGAAGGGTATTTTAAAc < 1:1221075/99‑1 (MQ=255) GGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGACTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCgt < 1:2873624‑M1/100‑1 (MQ=255) | ATCGGCAAACCACTGATTCTGTTTTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGT > NC_000913/4585454‑4585652 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |