New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4585553 = | 128 (1.040) | 2 (0.020) | 5/166 | NT | 1.8% | coding (1209/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme |
? | NC_000913 | 4585576 = | 101 (0.880) | coding (1186/3513 nt) | hsdR | endonuclease R Type I restriction enzyme | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCA > NC_000913/4585477‑4585675 | tttGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCa < 1:2456818/100‑1 (MQ=255) tGCGGTGCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAg < 1:3325893/99‑1 (MQ=255) gtttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctggtatcacgcacgtcgcgataccAGa < 1:1605474‑M2/3‑1 (MQ=255) tttaaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctggtatcacgcacgtcgcgataccAGAt < 1:1155869‑M2/4‑1 (MQ=255) cGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATg > 1:1446780/1‑100 (MQ=255) ggTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGc < 2:1168766/100‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGc < 1:915532/100‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGc > 2:2125628/1‑100 (MQ=255) taaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctggtatcacgcacgtcgcgataccAGATGc < 2:73586‑M2/6‑1 (MQ=255) gTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATg > 1:1086650/1‑98 (MQ=255) aaaatccccttctgctactcgaccaacgggcgcgaataccgcgcaacaatgaagaccaaaagcggcatctggtatcacgcacgtcgcgataccAGATg < 1:388130‑M2/5‑1 (MQ=255) tCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGc > 2:2974064/1‑100 (MQ=255) gCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTg > 2:1663003/1‑100 (MQ=255) ccGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTgg < 1:2550309/100‑1 (MQ=255) ccGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTgg < 2:3389781/100‑1 (MQ=255) cGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGt > 2:2262049/1‑100 (MQ=255) aGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCt > 2:2566982/1‑100 (MQ=255) cATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTc < 1:1433265/100‑1 (MQ=255) cATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTc > 2:34049/1‑100 (MQ=255) aTTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCa < 1:841061/100‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTACCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTc > 1:1383588/1‑99 (MQ=255) tttCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAt > 2:2449835/1‑100 (MQ=255) tttCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAt > 2:385919/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCGCTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgt < 1:2697480/100‑1 (MQ=255) ccAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgt > 2:3272158/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGAGGCCGCTTTTGGTCTTCAttgt > 1:2422733/1‑100 (MQ=255) cagcagCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgtt > 1:1005231/1‑100 (MQ=255) agcagcTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgttg < 1:36133/100‑1 (MQ=255) agcagcTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCAttgt < 1:1335689/98‑1 (MQ=255) gcagcTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTgc < 1:38603/100‑1 (MQ=255) gcagcTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTgc > 2:2745580/1‑100 (MQ=255) nctctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGAGACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGcgcg > 1:1783002/2‑100 (MQ=255) gcTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGcgcg < 1:163837/100‑1 (MQ=255) ctctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTgcgctg < 2:1206158/100‑3 (MQ=255) ctctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCgg < 2:1965312/100‑1 (MQ=255) tctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGt > 2:1676366/1‑100 (MQ=255) ctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATCCCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTa > 1:2976318/1‑100 (MQ=255) ctTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGTCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTa < 2:2729618/100‑1 (MQ=255) ccGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTc > 1:2940259/1‑100 (MQ=255) gggCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTcgc > 2:1809799/1‑100 (MQ=255) gCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCgcgc > 1:1260068/1‑100 (MQ=255) ctgTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGcc < 1:2304139/98‑1 (MQ=255) gTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCg < 1:1303640/100‑1 (MQ=255) gTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCg > 1:3106530/1‑100 (MQ=255) gTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCg > 2:1786846/1‑100 (MQ=255) gCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGt > 1:884061/1‑99 (MQ=255) ccACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTg < 1:1838474/100‑1 (MQ=255) cACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTgg > 2:507068/1‑100 (MQ=255) aCTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGt < 1:3143326/100‑1 (MQ=255) cTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGt < 2:3119835/99‑1 (MQ=255) cTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTc < 2:1446786/100‑1 (MQ=255) tCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCg < 2:683602/100‑1 (MQ=255) tCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCg < 1:1019030/100‑1 (MQ=255) tCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCACTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCg < 1:338499/100‑1 (MQ=255) gggTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAg > 2:3056437/1‑100 (MQ=255) gggTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAg < 1:2551838/100‑1 (MQ=255) gTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTa > 2:2806039/1‑100 (MQ=255) ggCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAg > 2:1092806/1‑100 (MQ=255) ggCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAg > 1:1317512/1‑100 (MQ=255) gCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGa < 2:3108659/100‑1 (MQ=255) tCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAggg < 1:288127/100‑1 (MQ=255) gACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGa > 2:1503777/1‑100 (MQ=255) aCATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAt < 2:175454/100‑1 (MQ=255) aCATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAt < 2:608119/100‑1 (MQ=255) cATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAtt > 2:369921/1‑100 (MQ=255) atatTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAttt < 1:3192022/100‑1 (MQ=255) atatTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAttt > 2:2315364/1‑100 (MQ=255) tatTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGAtttt < 2:2539321/100‑1 (MQ=255) gcatctGGTATCGCG‑ACGTGCGTGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTa < 2:73586‑M1/94‑1 (MQ=255) atTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTa > 1:2330117/1‑100 (MQ=255) gCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAAc < 1:3279691/100‑1 (MQ=255) gCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAAc < 1:3279729/100‑1 (MQ=255) cGGGTATCACGCCCGT‑CGCGATACCAGAGGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGGTGTATTGGCGCCATTAGGTCGAGTAGCAGAAGGGTATTTTAAAc < 1:1221075/99‑1 (MQ=255) 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CACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGttt > 2:1802821‑M1/1‑100 (MQ=255) CACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGGATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGttt > 2:1432345‑M1/1‑100 (MQ=255) acgcacgT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTg < 2:1770285/100‑1 (MQ=255) acgcacgT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTg < 2:193401/100‑1 (MQ=255) gcacgT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGCTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGcc < 1:1805173/100‑1 (MQ=255) tctgcgATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTg < 1:1103957/97‑1 (MQ=255) t‑CGTGATACCAGGTGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGTGCTGTATTCGCGCCCGTTTGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTGAACCGTTGTTTGCCGCTgg < 1:2114488/100‑1 (MQ=255) t‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTAGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCCGACGGGGATTTTAAAACGTTGTTTGCCGc > 1:421444/1‑97 (MQ=255) gcgGTACCAGGTGCCGCTCTTGGTCTGGATTGGTAGGAGGTGTTTGTTTCCGTTGGTTGTGTACCAGTAGGGGTTTTTCACCCGTTGTTTGCCGCTgg < 1:3299160/98‑1 (MQ=255) gcgATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGgt > 2:1818037/1‑99 (MQ=255) cgATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGgtgt < 1:2661374/100‑1 (MQ=255) ataccAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTcc < 1:708786‑M2/95‑1 (MQ=255) taccAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCt < 2:462967‑M2/96‑1 (MQ=255) accAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTg < 1:1180487‑M2/97‑1 (MQ=255) accAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTg > 2:837930‑M2/4‑100 (MQ=255) ccAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAGCCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTg < 1:2216400‑M2/97‑1 (MQ=255) ccAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGc > 1:3292278‑M2/3‑100 (MQ=255) ccAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGc < 2:2594580‑M2/98‑1 (MQ=255) aGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCa < 2:2238737/100‑1 (MQ=255) aGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCa < 2:2910330/100‑1 (MQ=255) | TTTGCGGTTCGCTGCCGAGCATTTCCAGCAGCTCTTCCGGGCGGTGCCACTCGGGTAAGGCTTTCGACATATTGCGGGTATCACGCACGT‑CGCGATACCAGATGCCGCTTTTGGTCTTCATTGTTGCGCGGTATTCGCGCCCGTTGGTCGAGTAGCAGAAGGGGATTTTAAACCGTTGTTTGCCGCTGGTGTCCTGCCA > NC_000913/4585477‑4585675 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |