| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 107 (0.720) | 15 (0.120) | 11/156 | NT | 15.0% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 76 (0.590) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATA > NC_000913/1465026‑1465222 | tagTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttatt < 2:611814/97‑1 (MQ=255) tGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttattt < 2:519274/100‑1 (MQ=255) aaaacacattatcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttattta > 2:3860737‑M1/65‑100 (MQ=255) tATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:1131110/1‑100 (MQ=255) tATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:648119/1‑100 (MQ=255) tATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt < 1:2729572/100‑1 (MQ=255) tATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:2353162/1‑100 (MQ=255) accacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:961596‑M1/63‑100 (MQ=255) accacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 2:1439584‑M1/63‑100 (MQ=255) accacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:2441714‑M1/63‑100 (MQ=255) tttGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg < 1:1012606/100‑1 (MQ=255) tgatgaGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAg < 1:4104625/100‑1 (MQ=255) cattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAg > 1:1762868‑M1/59‑100 (MQ=255) atgaGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTa > 2:4100473/1‑100 (MQ=255) agaATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTa > 1:3117874/1‑100 (MQ=255) gaATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTATGTCCCAAGAATTATAAATCAGATAGATGTGTAATCGCTGCGTTATTTATTTGAgtagta > 2:342335/1‑99 (MQ=255) ttataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAAtt > 1:736864‑M1/51‑100 (MQ=255) tgtgACCGAAAAATTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAAtt < 2:2774416/94‑1 (MQ=255) cGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATAc > 1:332915/1‑100 (MQ=255) gACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATAcc > 1:194248/1‑100 (MQ=255) ccGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGt > 1:621342/1‑100 (MQ=255) ccGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGATATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGt > 1:3201644/1‑100 (MQ=255) cGAAACATTAACAGATGTAAAGTAATATTGTCCCTTTGATTATAAAGCAGAGATATGTTTGAGCTCGGTTTTATTTATTTGAGTATTAATTAATACCGtt > 2:1020665/1‑100 (MQ=255) cGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGtt < 2:1746427/100‑1 (MQ=255) gAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGttt > 2:1833378/1‑100 (MQ=255) gAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGttt > 2:1919521/1‑100 (MQ=255) aCAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTATTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACTGtttttt < 2:2169690/100‑1 (MQ=255) gagtgaaaGATGTAAAATTATTGTTTTGCTTTAATTATAAAGCAGATCTACGTTTTACTTCTCTTTTCTTTCTTTGTGTATTATTTCTTACCtttctttc > 2:4005888/8‑100 (MQ=255) cAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtc > 1:3811853/1‑100 (MQ=255) aGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtca < 1:603785/100‑1 (MQ=255) aGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtca < 1:531463/100‑1 (MQ=255) gTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcat < 1:1679409/100‑1 (MQ=255) gTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcat < 1:508360/100‑1 (MQ=255) gTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcat < 1:1080559/100‑1 (MQ=255) gTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATACATACCGTTTTTtcat > 2:2420252/1‑100 (MQ=255) tAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcatc < 1:819363/100‑1 (MQ=255) aaCAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcatca < 1:1825498/100‑1 (MQ=255) aaCAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcatca < 1:3697661/100‑1 (MQ=255) aaCAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcatca < 1:3071120/100‑1 (MQ=255) aaCAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcatca > 1:2671127/1‑100 (MQ=255) gaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTcatcat > 1:1598732‑M2/65‑100 (MQ=255) cAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCata > 1:2478580/1‑100 (MQ=255) gATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCatat > 1:1372928/1‑99 (MQ=255) aTGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAATATTAATTCATACCGTTTTTTCATCAtata < 2:415489/99‑1 (MQ=255) tGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAat < 1:3999664/100‑1 (MQ=255) gTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAatt < 2:3931241/100‑1 (MQ=255) tAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACTGTTTTTTCATCATATAatt > 2:1226764/1‑99 (MQ=255) ggtatgaattaatactcaaataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAattat > 2:92353‑M2/57‑100 (MQ=255) aaaaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAattat > 2:4033568/1‑100 (MQ=255) aaaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAattatt > 2:2537759/1‑100 (MQ=255) aaaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAattatt > 1:3979705/1‑100 (MQ=255) ttattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAAttatttat > 2:2012596/1‑100 (MQ=255) ttattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAAttatttat < 2:2574809/100‑1 (MQ=255) tgttttGTCCCTTTAATTATAATGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAAttattta < 2:3993895/96‑1 (MQ=255) tattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTtata < 1:260459/100‑1 (MQ=255) tattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTtata < 1:3606549/100‑1 (MQ=255) tGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATgag > 1:1918159/1‑100 (MQ=255) gTCCTTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTATCATGATATAATTATTTATAATcag > 2:2959715/1‑99 (MQ=255) 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aataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATAATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGt > 2:1930818‑M2/39‑100 (MQ=255) aaTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGtt > 2:923678/1‑100 (MQ=255) AAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGAGGTTTTAAtt > 2:1586513‑M1/1‑100 (MQ=255) AAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAAttt < 2:1963293‑M1/100‑1 (MQ=255) AAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAAttt < 1:749667‑M1/100‑1 (MQ=255) agcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTg > 1:2186048‑M2/30‑100 (MQ=255) AGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTg < 1:1841922‑M1/100‑1 (MQ=255) GCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTg > 1:1532500‑M1/1‑99 (MQ=255) GAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAt > 2:1645288‑M1/1‑100 (MQ=255) GAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAt > 1:2875027‑M1/1‑100 (MQ=255) GTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAttt < 2:2323217‑M1/100‑1 (MQ=255) tGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatat < 1:923684/100‑1 (MQ=255) tttAATCTCTGCTTTAGTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatatta < 1:342338/100‑1 (MQ=255) tAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatattata < 1:1906516/100‑1 (MQ=255) aaGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTtatattatat < 1:2595519/100‑1 (MQ=255) aGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATtatata < 2:1175056/100‑1 (MQ=255) ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATaca > 1:158890‑M2/12‑100 (MQ=255) ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATaca < 1:1185062‑M2/89‑1 (MQ=255) gctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAt > 1:3726604‑M2/8‑100 (MQ=255) gctttatTTATTTGAGTATAAATTCATCCCGATTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGATTTTAATTTGTAATTTATATTATATaca > 2:1166513‑M2/8‑96 (MQ=255) gCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTCATTTGTAATTTATATtatata > 2:615227/1‑94 (MQ=255) tttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAttt > 1:3462432‑M2/6‑100 (MQ=255) tttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAttt < 1:3545186‑M2/95‑1 (MQ=255) ttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTta < 2:2264570‑M2/96‑1 (MQ=255) ttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTta < 1:3142714‑M2/96‑1 (MQ=255) tatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGTTTTTAATTTGTAATTTATATTACATACACAATTtat > 2:735208‑M2/4‑100 (MQ=255) atTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtata > 2:2816329‑M2/3‑100 (MQ=255) | CTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATA > NC_000913/1465026‑1465222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |