| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3898636 | NA (NA) | 10 (0.080) | 6/162 | NT | NA | noncoding (6/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3898650 | NA (NA) | noncoding (20/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCT > NC_000913/3898537‑3898735 | cagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGa < 1:3541088‑M1/8‑1 (MQ=255) ggtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAg > 1:2594007/1‑100 (MQ=255) ggtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAg < 1:1299760/100‑1 (MQ=255) cATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGt < 1:2301574/100‑1 (MQ=255) tCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTc < 1:3361510/100‑1 (MQ=255) cAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTca < 2:2862334/100‑1 (MQ=255) cAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTca > 2:1344645/1‑100 (MQ=255) ggTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTcacac < 2:3237031/100‑1 (MQ=255) tATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtc > 1:2255042‑M2/1‑98 (MQ=255) ctctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccgg < 1:1073547‑M2/100‑6 (MQ=255) tctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccg < 2:2464604‑M2/98‑5 (MQ=255) catccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGc > 2:142763‑M1/73‑100 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGGGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgcgccggcc < 2:2305133‑M1/100‑22 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAAAACAAACCAAAAAGTAATTCACACAtccggcc < 1:1078701‑M2/100‑8 (MQ=255) atccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgtcgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGcc > 1:2707879‑M1/72‑100 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGTGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctg < 1:1463091‑M1/100‑24 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctg < 1:1655770‑M1/100‑24 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctg < 1:3002319‑M1/100‑24 (MQ=255) ccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCtt > 1:2123781‑M1/70‑100 (MQ=255) cttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCt > 2:1767054‑M1/69‑98 (MQ=255) ccGCTGTCTCCACTGCGGCAAGTTGAGACTGTGGTGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgt < 1:1688861‑M1/100‑25 (MQ=255) ccGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTa > 1:3097467/1‑100 (MQ=255) tGTCTCCATTCCTGCAAGCTGAGATTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGATAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACACCCGGCCTTATTTc < 2:419091/100‑1 (MQ=255) gTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCt > 1:3783473/1‑100 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTTTTATTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCtt > 2:336190/1‑99 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa < 1:1502200/100‑1 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa > 1:3058710/1‑100 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa > 2:3003941/1‑100 (MQ=255) tcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTaa > 2:464841/1‑100 (MQ=255) tcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTaa > 2:2821367/1‑100 (MQ=255) tcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTaa < 1:1138640/100‑1 (MQ=255) ccacggaaacAAGTTGAGACTGTGATGTGATTTCGGGTTGTTATTTATATAACGACAAAACGGCGAATCGTAATTCACACATGCGGCCCTATTTCGTAAg < 2:3264460/91‑1 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 1:3712685/1‑100 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 1:814055/1‑100 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg < 1:1344660/100‑1 (MQ=255) cACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAAGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGc > 1:1087391/1‑100 (MQ=255) aCTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCt > 2:1476938/1‑100 (MQ=255) cTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCtt < 1:3392459/100‑1 (MQ=255) tGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTa > 2:2908671/1‑100 (MQ=255) gCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTa < 2:1547556/99‑1 (MQ=255) ggCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAAcc > 1:3204210/1‑100 (MQ=255) gataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGt < 1:3761369‑M1/52‑1 (MQ=255) aGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGt < 1:2790744/100‑1 (MQ=255) ataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTg > 2:3761330‑M1/48‑100 (MQ=255) ttagaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATTAGAACAGGCCGGATCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGc < 1:487726/97‑1 (MQ=255) tGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCt < 1:2908697/100‑1 (MQ=255) gagaCTGTGGGGTGATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTCACCGAGTGCTa > 2:1332601/1‑100 (MQ=255) gagaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTa > 2:383054/1‑100 (MQ=255) gaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGCGCGTAATTCACACATCAGACATTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAAt > 2:1004461/1‑100 (MQ=255) aCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAAtt > 1:3023125/1‑100 (MQ=255) cTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTc < 2:2517037/100‑1 (MQ=255) tgtgGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCt > 2:359309/1‑100 (MQ=255) gtgGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTg > 2:3164168/1‑100 (MQ=255) gtgGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTg > 1:755117/1‑100 (MQ=255) tgGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGc < 2:1269841/100‑1 (MQ=255) ggggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCg < 1:1566829/100‑1 (MQ=255) ggggTGATTGTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGTCGCGTAATTCACACATAGGGTCTTATCTCTTATGCTTAACCGAGTGGTAATTCTGCg > 2:3626433/1‑100 (MQ=255) gggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCgg < 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tttCGTAGTTATTTATATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCt < 1:688753/100‑1 (MQ=255) cGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTATTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTa > 1:332825/1‑100 (MQ=255) tAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATc < 1:66175/100‑1 (MQ=255) gTTATTTAAATAATGATAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg < 1:612371/100‑1 (MQ=255) gTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg < 1:3570707/100‑1 (MQ=255) gTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg > 2:241439/1‑100 (MQ=255) ttATTTAAATAATGAGATCAGGCCTAAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTATCCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg < 2:3160727/99‑1 (MQ=255) ttATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGc < 2:3097439/100‑1 (MQ=255) tATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCg < 1:2741536/100‑1 (MQ=255) tATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCg > 2:1044647/1‑100 (MQ=255) tttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGAt < 2:672426/100‑1 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTATCCGAGTGCTAATTCTGCTGTAGCTGCTTTATCAGCGCTTa < 2:648686/100‑1 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTa > 1:2114086/1‑100 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTa > 2:3475891/1‑100 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTa > 1:408456/1‑100 (MQ=255) aataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTAcc < 1:2069587/100‑1 (MQ=255) ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCTGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa < 2:594320/100‑1 (MQ=255) ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa > 2:218128/1‑100 (MQ=255) aatGAGACCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGCGCTAATTCTGCGGCAACGGCTTTATCAGCGATTACCATc > 2:268040/1‑100 (MQ=255) aatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggag < 2:301153‑M2/100‑70 (MQ=255) aatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATc < 1:3161681/100‑1 (MQ=255) gaggACAGGCAGGAGCGTAATTCACACAtatggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgacgcagtggagaca < 2:1639790‑M2/100‑73 (MQ=255) gagaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGc < 1:1168819/100‑1 (MQ=255) gagaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGc < 1:1044658/100‑1 (MQ=255) agaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacag < 1:264812‑M2/100‑74 (MQ=255) agaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCg > 1:2269563/1‑100 (MQ=255) aCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAg < 2:1978701/100‑1 (MQ=255) aCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAg > 1:3467122/1‑100 (MQ=255) catGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATGTCTTAAGCTTAACCGATGGCTAATTCTGCTGCAGCGGTTTTATCAGCAATTACCATcaa > 2:3649862‑M1/4‑93 (MQ=255) ggCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag > 1:60867‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag < 2:154545‑M1/100‑94 (MQ=255) ggCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaa > 2:829985‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag < 2:2582267‑M2/100‑80 (MQ=255) GGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAt < 1:2183058‑M1/100‑1 (MQ=255) ggAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagagat < 1:1476605‑M1/100‑98 (MQ=255) | TGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCT > NC_000913/3898537‑3898735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |