| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4421 | 109 (0.780) | 20 (0.150) | 6/168 | NT | 17.3% | coding (688/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase |
| ? | NC_000913 | = 4450 | 89 (0.680) | coding (717/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCG > NC_000913/4324‑4520 | tgatgatgaAGCACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTAGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGt > 2:1107346/1‑99 (MQ=255) atgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgc > 1:3609879/1‑100 (MQ=255) tgatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAATTCTGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgcg < 1:1689344/100‑1 (MQ=255) gatgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTgcgc > 2:3563287/1‑100 (MQ=255) atgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCa < 1:2257024/100‑1 (MQ=255) tgaAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCa > 2:3892376/1‑99 (MQ=255) gaagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGc < 1:1341695/100‑1 (MQ=255) gaagaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGc > 2:629348/1‑100 (MQ=255) agaaCTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTg < 1:3518449/100‑1 (MQ=255) cTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGc > 2:2544967/1‑100 (MQ=255) tGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGc < 2:2743004/99‑1 (MQ=255) gAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGc > 2:1535427/1‑98 (MQ=255) gAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAg > 2:1414545/1‑100 (MQ=255) aaaGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAgg < 1:3094011/100‑1 (MQ=255) aaaGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAgg > 1:3873736/1‑100 (MQ=255) aaGTGGCGCTAGGGTTAAACTCTGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGga < 1:3230702/100‑1 (MQ=255) aaGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGga < 2:3244279/100‑1 (MQ=255) aGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgag < 2:1250836/100‑1 (MQ=255) aGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATGAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGgag > 2:2592199/1‑100 (MQ=255) ggCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGAcg > 1:450124/1‑100 (MQ=255) gcgcTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGAcgc < 2:2181462/100‑1 (MQ=255) gcTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACgcgc > 1:1957212/1‑100 (MQ=255) gatctggttaaaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgc < 2:433530‑M1/95‑27 (MQ=255) tAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCaa > 2:2847552/1‑100 (MQ=255) tAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCa < 2:3051025/99‑1 (MQ=255) gggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACc > 1:3029325‑M2/1‑99 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcagaac > 1:433536‑M1/1‑69 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacag < 1:3903588‑M1/100‑32 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacag < 1:3903505‑M1/100‑32 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacag < 1:270257‑M1/100‑32 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACca < 1:2701415‑M2/100‑3 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACca < 1:2986803‑M2/100‑3 (MQ=255) gTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcag < 2:2993430‑M2/100‑4 (MQ=255) tAAACTCTGCTAACTCAATTAACATCATCCTTTTGCTGGCACAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaaca < 1:377338‑M1/96‑31 (MQ=255) tAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagct < 1:69136‑M2/100‑6 (MQ=255) tAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagct > 1:1640462‑M2/1‑95 (MQ=255) tAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTACTACTACTTTAAAGCTGTTACGCAGCTGCCGCAGGAAACGCGCAACcagct < 1:783363‑M2/100‑6 (MQ=255) aaaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTg > 2:2976233/1‑100 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGTAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 2:2265838/100‑1 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTgg < 1:1842056/99‑1 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 1:3879727/100‑1 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 1:535871/100‑1 (MQ=255) cTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaa < 1:1410158‑M1/100‑39 (MQ=255) cTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagct < 2:1292200‑M1/96‑35 (MQ=255) cTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTgg < 1:825150/98‑1 (MQ=255) tCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaa < 1:1424614‑M1/100‑40 (MQ=255) tCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaa < 1:2300100‑M1/100‑40 (MQ=255) cGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaag < 2:1362010‑M1/100‑41 (MQ=255) ggCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtc < 1:491289/100‑1 (MQ=255) cTAACTCGATTAACATCAGACGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCACAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtct > 2:1178673/1‑99 (MQ=255) tAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtctc < 1:30571/99‑1 (MQ=255) tAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCg < 1:2736097/100‑1 (MQ=255) aaCTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg > 2:357625/1‑100 (MQ=255) cTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg > 2:1779900/1‑100 (MQ=255) cTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg > 1:2665434/1‑100 (MQ=255) cGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg > 2:3360307/1‑98 (MQ=255) aTTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCaa > 1:1035340/1‑100 (MQ=255) tAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAAGCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAg > 2:3110083/1‑99 (MQ=255) aaCATCAGCCGTATGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCg > 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ccGTTTGCTGGCGCAGATTTGATACTACTTTTTTGCTGTTGCGCAGTTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAAc < 2:2701391/97‑1 (MQ=255) cGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCg < 1:2351234/100‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGAtt < 1:2538089/100‑1 (MQ=255) tGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGAttt < 1:2944119/100‑1 (MQ=255) cgcAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGAc < 1:3188656/100‑1 (MQ=255) gcAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGAcg < 1:2819915/100‑1 (MQ=255) ggtttGCTACGACTTTGAAGCTGTTGAGCAGCCGGCTGAGGAGACAGATAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGAcggcg < 2:2319671/98‑1 (MQ=255) tttGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCggg < 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1:2198492‑M2/100‑65 (MQ=255) aGCTGgttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagttta < 1:69136‑M1/100‑96 (MQ=255) gCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 1:565691‑M2/100‑68 (MQ=255) gCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacgactgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 1:77625‑M2/100‑68 (MQ=255) cTGcttgcgcgtctcctgcggcagctgctcaacagcggcaaactagtagcaaatctgctccagcaaccggctgatgttaatcgagttagccgagtt < 2:2975393‑M1/96‑94 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 2:3913715‑M2/100‑69 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 1:1467803‑M2/100‑69 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaacc < 1:3903588‑M2/100‑69 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaacc < 2:648419‑M2/100‑69 (MQ=255) tGTTGCGCAGCTGTCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTc < 2:1978432/96‑1 (MQ=255) ggttgcgcgtctcctgcggcagctgcgcaacagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccc > 1:3029325‑M1/1‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccct < 2:1637150‑M2/100‑71 (MQ=255) | TGATGATGAAGAACTGAAAGTGGCGCTAGGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCG > NC_000913/4324‑4520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |