| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4421 | 109 (0.780) | 20 (0.150) | 6/168 | NT | 17.3% | coding (688/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase |
| ? | NC_000913 | = 4450 | 89 (0.680) | coding (717/1287 nt) | thrC | L‑threonine synthase | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCG > NC_000913/4352‑4549 | gggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACc > 1:3029325‑M2/1‑99 (MQ=255) ggTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACca < 1:2701415‑M2/100‑3 (MQ=255) gTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcag < 2:2993430‑M2/100‑4 (MQ=255) tAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTACTACTACTTTAAAGCTGTTACGCAGCTGCCGCAGGAAACGCGCAACcagct < 1:783363‑M2/100‑6 (MQ=255) aaaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTg > 2:1049668/1‑100 (MQ=255) aaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTgg > 2:2611713/1‑100 (MQ=255) aaCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGGTTGCTGGAGCAGATTTGCTACTAGTTTGCCGCTGTTGAGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAAGcag < 2:2975393‑M2/96‑4 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGTAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 2:2265838/100‑1 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTgg < 1:1842056/99‑1 (MQ=255) aCTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGt < 1:3879727/100‑1 (MQ=255) cTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTgg < 1:825150/98‑1 (MQ=255) ggCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtc < 1:491289/100‑1 (MQ=255) cTAACTCGATTAACATCAGACGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCACAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtct > 2:1178673/1‑99 (MQ=255) tAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGtctc < 1:30571/99‑1 (MQ=255) tAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCg < 1:2736097/100‑1 (MQ=255) aaCTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg > 2:357625/1‑100 (MQ=255) aaCTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCgg < 1:3892415/100‑1 (MQ=255) aCTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGt > 1:2413922/1‑100 (MQ=255) cTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg > 2:1779900/1‑100 (MQ=255) cTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg > 2:2821154/1‑100 (MQ=255) tCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGc < 1:2847578/100‑1 (MQ=255) cGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTg > 2:3360307/1‑98 (MQ=255) aTTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCaa > 1:1035340/1‑100 (MQ=255) ttAACATCAGCCTTTTGCTGGCACAGACTTGCGACTGCTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCaa < 2:1993809/99‑1 (MQ=255) tAATATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGTTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGc < 1:264552/100‑1 (MQ=255) tAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAAGCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAg > 2:3110083/1‑99 (MQ=255) aaCATCAGCCGTATGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCg > 1:2568373/1‑100 (MQ=255) aCATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTTCTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCgg < 1:215309/100‑1 (MQ=255) aCATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCgg > 1:3399366/1‑100 (MQ=255) aCATCAGACGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCgg > 1:2053935/1‑100 (MQ=255) aTCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCACGCGGaa > 2:3067562/1‑100 (MQ=255) gCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACtt > 2:282196/1‑100 (MQ=255) cGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCg < 1:2351234/100‑1 (MQ=255) gTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCgg < 1:1257000/100‑1 (MQ=255) tGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGAttt < 1:2944119/100‑1 (MQ=255) cgcAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGAc < 1:3188656/100‑1 (MQ=255) ggtttGCTACGACTTTGAAGCTGTTGAGCAGCCGGCTGAGGAGACAGATAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGAcggcg < 2:2319671/98‑1 (MQ=255) tttGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCggg < 1:924856/100‑1 (MQ=255) tttGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCggg < 1:1221136/100‑1 (MQ=255) ctactaCTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagt < 1:172032‑M2/100‑55 (MQ=255) tactacTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCggg > 2:305258/1‑95 (MQ=255) tactacTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTctgc > 1:423053/1‑100 (MQ=255) tactacTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTctgc < 1:3311455/100‑1 (MQ=255) actactTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTctgct > 2:3308523/1‑100 (MQ=255) actacgTTGATTCGGTTGCGCAGATCCCTGAGCAGGCGCACATTCAGCTGGTTGTTTCGGTGCCAAGCGGAATCTTCGGCGATTTGACGGCggg < 2:1118889/94‑1 (MQ=255) ctactTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTctgctg > 1:2926273/1‑100 (MQ=255) tactTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTAACGGCGGGTCTGCTgg < 1:180935/100‑1 (MQ=255) actTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTgg > 2:1690830/1‑99 (MQ=255) ctTTGAAGCTGTTGCGCAGTTGCCTCATGAGACGCGCAAGCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGc < 1:3876391/99‑1 (MQ=255) ctTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccg < 2:1362010‑M2/100‑61 (MQ=255) ctTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTctgc > 2:1050130/1‑95 (MQ=255) ctTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCg > 1:3208594/1‑100 (MQ=255) tttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccga < 1:2300100‑M2/100‑62 (MQ=255) tttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTAGATGTATCGGAGCCAAACGGAAACTACGGCGATTTAACGGCGGGTCTGCTGGCGa > 1:1035498/1‑100 (MQ=255) ttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgag < 1:1410158‑M2/100‑63 (MQ=255) ttGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTAACGGCGGGTCTGCTGGCGaa > 1:2170739/1‑100 (MQ=255) tGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAg < 1:1397295/100‑1 (MQ=255) tGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAg > 1:515417/1‑100 (MQ=255) 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cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACcagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaac < 1:1467803‑M2/100‑69 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaacc < 1:270257‑M2/100‑69 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaacc < 1:3903588‑M2/100‑69 (MQ=255) cTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACt > 1:443997/1‑100 (MQ=255) tGTTGCGCAGCTGTCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTc < 2:1978432/96‑1 (MQ=255) tGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgtgccagcaaaaggatgatgttaattgagttagcagagttta < 1:377338‑M2/96‑66 (MQ=255) ttGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCgg < 1:2011403/100‑1 (MQ=255) tGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTTCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGGGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGt > 2:3275864/1‑100 (MQ=255) tGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACAGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGt > 1:3415582/1‑100 (MQ=255) tGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTAACAAGCGAAAACTAAGACGATTTGACGGCGGGACTGCTGGCGAAGTCACTCGGt > 1:1007021/1‑100 (MQ=255) gcgcAGCTGCCGCAGGATACGCGCAATCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTc < 1:913469/100‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACagcttcaaagtagtagcaaatctgcgccagcaaacggctgatgttaatcgagttagccgagtttaaccagatc < 2:433530‑M2/100‑74 (MQ=255) cgcAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCt > 1:3763473/1‑100 (MQ=255) gcAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTg > 1:2463602/1‑100 (MQ=255) gCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCg > 2:1665131/1‑100 (MQ=255) 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2:317032/100‑1 (MQ=255) cgtgcAATCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGATTAAAATTCGGCGATTTGTCGGCGTTTATGCTGGCGAAGTCACTCGGACTGCCGGTGAAACGtttt < 1:1772613/95‑1 (MQ=255) cgcgCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTAt > 1:3001528/1‑100 (MQ=255) cgcgCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTAt > 1:56186/1‑100 (MQ=255) tgcAACCAGCTGGTTGTCTCGGCGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTTACGGCGGGTTTGCTGGCGATGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTAt < 2:954011/97‑1 (MQ=255) tcAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATtgc < 2:1267865/99‑1 (MQ=255) gcAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTAtt < 2:1541911/98‑1 (MQ=255) gcAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATtgc < 1:1465837/100‑1 (MQ=255) aCCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATtgctgc > 1:885096/1‑100 (MQ=255) aCCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATtgctgc > 2:2776782/1‑100 (MQ=255) ccAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCg < 1:2787282/100‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCg < 1:2821180/100‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCg < 2:423047/100‑1 (MQ=255) | GGGTTAAACTCGGCTAACTCGATTAACATCAGCCGTTTGCTGGCGCAGATTTGCTACTACTTTGAAGCTGTTGCGCAGCTGCCGCAGGAGACGCGCAACCAGCTGGTTGTCTCGGTGCCAAGCGGAAACTTCGGCGATTTGACGGCGGGTCTGCTGGCGAAGTCACTCGGTCTGCCGGTGAAACGTTTTATTGCTGCG > NC_000913/4352‑4549 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |