| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2042116 = | 116 (0.740) | 22 (0.160) | 13/158 | NT | 17.7% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog |
| ? | NC_000913 | 2042149 = | 102 (0.730) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog | |||||
GTATCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2042222‑2042116‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATT > NC_000913/2042149‑2042247 GTATCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCG < 1:287330/99‑1 TATCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTG < 1:3166949/100‑1 TCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTC > 1:1014883/1‑100 TCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTC < 2:2128003/100‑1 TCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTC < 2:2058996/100‑1 TCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTC < 1:385610/100‑1 CTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCT > 1:2241506/1‑100 CTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCGTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCT < 1:2720782/100‑1 CTTTCTCTGTTCGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCT < 1:3458850/100‑1 TTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGT < 1:3632442/100‑1 CTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGG > 2:1740715/1‑100 CTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGG > 2:1283861/1‑100 CTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGG > 1:2780616/1‑100 TATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCC > 2:2299235/1‑100 ATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCA > 2:1137285/1‑100 AATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCTATACACAATACGGCCAACA > 1:1456157/1‑100 AATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACA > 2:2078005/1‑100 ATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAG > 2:4292764/1‑100 TATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGA > 2:2085802/1‑100 ATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAG > 1:2105699/1‑100 ATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAG > 2:3571552/1‑100 TACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGA > 1:2978099/1‑100 TACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGA > 1:253064/1‑100 TACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGA > 2:1019845/1‑100 ACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACTAATAAAGGATTACATACACAATACGGCCAACAGAGAA > 1:4325402/1‑100 ACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAA > 1:1646394/1‑100 CAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAA > 2:3053766/1‑100 CAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAA > 2:4073156/1‑100 CAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAA > 2:233387/1‑100 AGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAG > 2:1825777/1‑100 CACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATA > 2:1209192/1‑100 ACGTCATAGGGATGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATA > 1:2140351/1‑99 TGAGCGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATATGGCCAACAGAGAAAGATTCCTGTGCTCACtc < 2:2978117/100‑3 TGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGC > 2:39689/1‑100 TGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGC > 1:1866066/1‑100 GTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCT > 2:2036073/1‑100 TCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTT < 2:158637/100‑1 CTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTA < 1:4056171/100‑1 CTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTA < 2:553270/100‑1 TGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTAT > 1:1486546/1‑100 TGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTAT > 1:3581306/1‑100 TGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTAT > 1:555235/1‑100 GTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATA < 2:1646401/100‑1 GTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATA < 2:4316508/100‑1 ATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATT < 2:1590813/100‑1 GTATCTTTCTCTGTTGGCCGTATTGTGTATGGAATCCGTTATTGGTTAACTCAATGCGGGTTAGCTTATTAATATACAGACACGTCATAGTGATGAGCGTGTCTGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2042222‑2042116‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATT > NC_000913/2042149‑2042247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |