| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2042116 = | 116 (0.740) | 22 (0.160) | 13/158 | NT | 17.7% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog |
| ? | NC_000913 | 2042149 = | 102 (0.730) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTG > NC_000913/2042050‑2042248 | ctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtat > 2:3571552‑M1/67‑100 (MQ=255)ctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtat > 1:2105699‑M1/67‑100 (MQ=255) tctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtata > 2:2085802‑M1/66‑100 (MQ=255) ccGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtata < 1:511863/100‑1 (MQ=255) ctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat > 2:4292764‑M1/65‑100 (MQ=255) cGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAATCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat < 1:2407222/100‑1 (MQ=255) cGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat < 1:1889479/100‑1 (MQ=255) cGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat > 1:410782/1‑100 (MQ=255) tgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATAtt > 2:2078005‑M1/64‑100 (MQ=255) tttAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaa < 1:111366/100‑1 (MQ=255) tggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaat > 2:1137285‑M1/61‑100 (MQ=255) tAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 1:1727193/1‑100 (MQ=255) aGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACTCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATCACGTGTCTGTATATtaataa < 1:4378632/100‑1 (MQ=255) aGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata < 1:2846517/99‑1 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg > 2:1656334/1‑100 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg > 1:3750529/1‑100 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg < 1:3683790/100‑1 (MQ=255) ccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg > 2:1740715‑M1/58‑100 (MQ=255) tAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGc > 1:2755533/1‑100 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGTTCCATACACAAACGCCACTGAACGCACGCTAGCTACAGACACGCTAATTACTATGACGTTTCGGTATATTAATAAGCt > 1:3600030/1‑100 (MQ=255) aaGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCt > 2:272742/1‑100 (MQ=255) gTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTaa > 1:3222014/1‑100 (MQ=255) ttATCATAACTGCGACTGGTACATGCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGATACAGACACGCTCATCACTAGGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAc < 1:1865622/100‑1 (MQ=255) ttATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAc < 2:1967405/100‑1 (MQ=255) tATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAcc < 1:2624019/100‑1 (MQ=255) tATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAcc < 1:2484956/100‑1 (MQ=255) aTCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAccc > 1:4328237/1‑100 (MQ=255) aTCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAccc > 2:1941179/1‑100 (MQ=255) cATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACAAGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGc > 2:3985485/1‑100 (MQ=255) aTAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCa > 2:2699928/1‑100 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAccc > 1:2076625/1‑96 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAt > 2:363453/1‑100 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAt > 1:2434574/1‑100 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACACGCATCACTATGACGTGTATGTATATTAATAAGCTAACCCGCAt > 1:3089385/1‑100 (MQ=255) gCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGt > 2:2245433/1‑100 (MQ=255) gCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGt < 2:2883083/100‑1 (MQ=255) tGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAAcc < 1:3056402/100‑1 (MQ=255) tGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAAcc < 2:3658615/100‑1 (MQ=255) ggTCCATCGACAATCACCACTGGACGGAAGCTAGCTACAGACACGCTCAGCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAAcc < 2:4125309/99‑1 (MQ=255) gTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCaa > 2:782119/1‑100 (MQ=255) tccatccaCAAACGCCAATGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAAt < 1:1983944/100‑1 (MQ=255) ccatccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTCTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATa > 2:2795529/1‑100 (MQ=255) ccatccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATa > 2:583468/1‑100 (MQ=255) ccatccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATa < 2:576420/100‑1 (MQ=255) ccatccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACACTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAAt > 1:883156/1‑99 (MQ=255) catccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATaa < 1:391292/100‑1 (MQ=255) atccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAAc > 1:755215/1‑100 (MQ=255) atccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAAc < 1:2699913/100‑1 (MQ=255) atccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAAc < 1:1625617/100‑1 (MQ=255) tcgacaAACGCCACTGAAAGCAAGCTAGCTAAAGACACGATCATCACTATGCTGGGTCTGTATATTAATAAGCTAACTAACATTGAGTTAAACaa > 1:427768/4‑95 (MQ=255) cacaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGa > 2:2708904/1‑100 (MQ=255) cGCCACTGAACGGAAGCTAACTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt < 1:1382262/100‑1 (MQ=255) cGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt < 2:3799085/100‑1 (MQ=255) cGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt > 2:2108322/1‑100 (MQ=255) gCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGATGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt < 1:2253567/99‑1 (MQ=255) ccACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATa < 1:1022779/99‑1 (MQ=255) aaCGCGCGCTCGCTACAGGCACTCTCATCTCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACTGATTCCATACACAATa > 1:2938200/1‑100 (MQ=255) aaCGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATa < 2:3327665/100‑1 (MQ=255) 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> 2:4112480/1‑100 (MQ=255) tacagacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAgaga > 2:1019845‑M2/34‑100 (MQ=255) tacagacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAgaga > 1:253064‑M2/34‑100 (MQ=255) acagacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGaa > 1:1646394‑M2/33‑100 (MQ=255) cagacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGaaa > 2:3053766‑M2/32‑100 (MQ=255) agacacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAg > 2:1825777‑M2/31‑100 (MQ=255) AGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCGAACAGAGAAAg < 1:3458850‑M1/100‑1 (MQ=255) GACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa < 2:2128003‑M1/100‑1 (MQ=255) GACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa < 2:2058996‑M1/100‑1 (MQ=255) GACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa < 1:385610‑M1/100‑1 (MQ=255) GACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGa > 1:1014883‑M1/1‑100 (MQ=255) cacgtcatagtgatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATa > 2:1209192‑M2/28‑100 (MQ=255) acgtcatagggatgagcgtgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATa > 1:2140351‑M2/27‑99 (MQ=255) cTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCtg < 2:2412990/100‑1 (MQ=255) cTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCtg < 2:222993/100‑1 (MQ=255) 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2:2978117‑M2/86‑3 (MQ=255) tgtctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGc > 2:39689‑M2/9‑100 (MQ=255) tctgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCtt < 2:158637‑M2/94‑1 (MQ=255) tgtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTtat > 1:555235‑M2/5‑100 (MQ=255) gtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTtata < 2:1646401‑M2/97‑1 (MQ=255) gtaTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTtata < 2:4316508‑M2/97‑1 (MQ=255) | GCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTG > NC_000913/2042050‑2042248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |