| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2042116 = | 116 (0.740) | 22 (0.160) | 13/158 | NT | 17.7% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog |
| ? | NC_000913 | 2042149 = | 102 (0.730) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGA > NC_000913/2042017‑2042213 | aatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaatat < 2:1590813‑M1/1‑1 (MQ=255) cttaTTGAATCTGCTCATGATAACGCCTCGAGGCTGCTTCAGTAAGTTATCATAACGGCCACTGGTCAATCCACAAGCGCCACTGAACGCAAgctagcta < 1:1141685/97‑1 (MQ=255) tcATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAgctagcta > 1:1465202/1‑99 (MQ=255) tcATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTAc < 1:3771792/100‑1 (MQ=255) tcATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTAc < 2:4333555/100‑1 (MQ=255) tataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTAc < 2:4316508‑M1/3‑1 (MQ=255) cATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACa < 2:1294975/100‑1 (MQ=255) cATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACa > 2:2624033/1‑100 (MQ=255) ataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACa > 1:555235‑M1/97‑100 (MQ=255) ataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACa > 1:1486546‑M1/97‑100 (MQ=255) ataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACa > 1:3581306‑M1/97‑100 (MQ=255) taagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAg < 2:553270‑M1/5‑1 (MQ=255) aTTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTAc < 1:1028483/98‑1 (MQ=255) aTTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAg < 1:868597/100‑1 (MQ=255) ttGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGa > 2:2294959/1‑100 (MQ=255) gcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGaca > 1:1866066‑M1/93‑100 (MQ=255) gcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGaca > 2:39689‑M1/93‑100 (MQ=255) aTTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCt < 1:1953322/100‑1 (MQ=255) ttCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtc > 2:2729520/1‑100 (MQ=255) tctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtca < 2:3093038/100‑1 (MQ=255) gagtgagcacaggaatctttctctgttggccatattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCtca < 2:2978117‑M1/14‑1 (MQ=255) tcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatc < 2:2452501/100‑1 (MQ=255) tcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatc < 2:2149011/100‑1 (MQ=255) tcATGATAACGCCCGGATGCCGCTTGAGTAAGTTACCATAACTGCCACTGGTCCATACACAAACGCCACTGAAAGCAAGCTACCCACAGACACGCtcatc < 1:1078550/100‑1 (MQ=255) aTGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAGGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCAc < 2:4409361/100‑1 (MQ=255) tGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt < 1:3476221/100‑1 (MQ=255) tGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt < 2:1279301/100‑1 (MQ=255) aCGCCTCGATGCCGCTTTATTAAGTTATCATCACTGCCACTGGTCTCTCCACAAAGGCGACTGAACGCAACCTAGCTACAGACACGCTCATCAc > 1:2852398/1‑94 (MQ=255) tatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCCCTATGACgt > 1:2140351‑M1/74‑99 (MQ=255) tatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACgtg > 2:1209192‑M1/74‑100 (MQ=255) tCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTc < 1:4278919/100‑1 (MQ=255) ctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCt > 2:1825777‑M1/71‑100 (MQ=255) cGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCt > 2:4268378/1‑100 (MQ=255) cGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCt > 2:71783/1‑100 (MQ=255) tttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg > 2:4073156‑M1/70‑100 (MQ=255) tttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg > 2:3053766‑M1/70‑100 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg < 2:2642195/100‑1 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg < 2:377151/100‑1 (MQ=255) gATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg > 1:905023/1‑100 (MQ=255) ttctctgttggccgtattgtgtatgtaatcctttattagttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGt > 1:4325402‑M1/69‑100 (MQ=255) ttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGt > 1:1646394‑M1/69‑100 (MQ=255) tctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGta > 2:1019845‑M1/68‑100 (MQ=255) tctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGta > 1:2978099‑M1/68‑100 (MQ=255) tGCCGCTATAGTAAGGGATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACCCGCGCATCACTATGACCTGTCtcca < 1:4191292/100‑4 (MQ=255) ctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGtat > 2:3571552‑M1/67‑100 (MQ=255) cGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAATCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat < 1:2407222/100‑1 (MQ=255) cGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTatat > 1:410782/1‑100 (MQ=255) tgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATAtt > 2:2078005‑M1/64‑100 (MQ=255) tAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 2:2495373/1‑100 (MQ=255) tAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 1:1727193/1‑100 (MQ=255) ggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 2:2299235‑M1/60‑100 (MQ=255) aGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACTCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATCACGTGTCTGTATATtaataa < 1:4378632/100‑1 (MQ=255) aGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata < 1:2846517/99‑1 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg > 1:3750529/1‑100 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg < 1:3683790/100‑1 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg < 1:2487345/100‑1 (MQ=255) gTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg > 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ttATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAc < 2:1967405/100‑1 (MQ=255) tATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAcc < 1:2624019/100‑1 (MQ=255) tATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAcc < 1:1308477/100‑1 (MQ=255) aTCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAccc > 1:4328237/1‑100 (MQ=255) cATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACAAGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGc > 2:3985485/1‑100 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAt > 1:2434574/1‑100 (MQ=255) tAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACACGCATCACTATGACGTGTATGTATATTAATAAGCTAACCCGCAt > 1:3089385/1‑100 (MQ=255) aaCTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAtt < 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1:2699913/100‑1 (MQ=255) cacaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGa < 1:2084166/100‑1 (MQ=255) cacaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGa > 2:2708904/1‑100 (MQ=255) cacaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACACACACACTCATCACTATGACGTGTCTTTATATTAATTAGCTAACCCCCATTCACTTAACCAATaa > 1:2456365/1‑96 (MQ=255) aaaCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTc < 2:2205300/100‑1 (MQ=255) cGCCACTGAACGGAAGCTAACTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt < 1:1382262/100‑1 (MQ=255) cGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt > 2:1946690/1‑100 (MQ=255) cGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt > 2:2108322/1‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |