| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2700077 | 129 (0.820) | 22 (0.160) | 13/154 | NT | 15.1% | intergenic (+154/+40) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 2700087 | 136 (1.000) | intergenic (+164/+30) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAAT > NC_000913/2699978‑2700176 | ttATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCG < 2:2652396‑M1/100‑1 (MQ=255) tataTTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGa > 1:1757028/1‑100 (MQ=255) tatttattTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATATTATATGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCCTCCGAc > 1:923820/1‑99 (MQ=255) tttatttaATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTgg < 1:1775790/100‑1 (MQ=255) tttaATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCa < 2:1639448/100‑1 (MQ=255) ttaATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCAc > 2:1241037/1‑100 (MQ=255) tAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACc < 2:401509‑M2/100‑2 (MQ=255) tAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACc > 2:130433‑M2/1‑99 (MQ=255) aaTTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcg < 1:1890402‑M2/100‑3 (MQ=255) tgatgaCATTAGCATAATCATTCACTGAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggac < 2:2680588‑M2/100‑6 (MQ=255) tgaCATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgca < 1:860128‑M1/100‑19 (MQ=255) aCATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacc < 2:63627‑M1/100‑21 (MQ=255) aCATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacc < 1:3439974‑M1/100‑21 (MQ=255) cATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacct < 2:4297678‑M1/100‑22 (MQ=255) aTTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacctt < 1:3595302‑M1/100‑23 (MQ=255) aTTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacctt < 1:2086686‑M1/100‑23 (MQ=255) ttAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcaccttt < 1:1581746‑M1/100‑24 (MQ=255) ttAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcaccttt < 1:1128434‑M1/100‑24 (MQ=255) ttAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcaccttt < 2:3026670‑M1/100‑24 (MQ=255) ttAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTa > 2:2744991/1‑100 (MQ=255) ttAGCATAAGCATTCACTAAATTAATTTATATAGTATCTGCCCACACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcaccttt < 1:1128433‑M1/100‑24 (MQ=255) tAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcac < 1:1291964‑M1/95‑20 (MQ=255) aGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacctttaa < 1:1698990‑M1/100‑26 (MQ=255) aGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAg > 2:2629993/1‑100 (MQ=255) aGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAg > 2:4297849/1‑100 (MQ=255) gCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGt > 1:2214271/1‑100 (MQ=255) gCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGt > 2:3585392/1‑100 (MQ=255) tAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCATACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACg < 1:245997/100‑1 (MQ=255) tAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataac < 2:636311‑M2/100‑20 (MQ=255) tAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataac < 2:638010‑M2/100‑20 (MQ=255) tCATTCACCAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCTGCCTGGTTTACCGGAAGCACCTTAAGTACtttt > 1:3526421/1‑100 (MQ=255) cATTCACTCAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACATTAAGTACGttt > 1:988190/1‑99 (MQ=255) cATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTc < 2:3844851/100‑1 (MQ=255) ttCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGTTCCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCt < 1:1182429/100‑1 (MQ=255) ttCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCt < 2:23630/100‑1 (MQ=255) tCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCtt > 1:785725/1‑100 (MQ=255) cACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg > 1:3168233/1‑100 (MQ=255) cACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg < 2:191579/100‑1 (MQ=255) cACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg > 2:548031/1‑100 (MQ=255) cACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg > 1:512965/1‑100 (MQ=255) aCTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgt < 1:3851284/100‑1 (MQ=255) cTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgtg < 2:1391128/100‑1 (MQ=255) cTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgtg > 2:3152836/1‑100 (MQ=255) aaGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTAGTGtt < 1:1003457/100‑1 (MQ=255) aGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTta > 2:1337661/1‑100 (MQ=255) aGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATGAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg < 1:4308104/95‑1 (MQ=255) gTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGCTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtat < 1:2347550/100‑1 (MQ=255) tAAATTATATACTATCTAACCAAACAATTATTAATAGTTATTAAAGGTGCGTTCGAATGATTGACCTGCCGCACCTTCAGTACGTTTCCTTGTGTtata > 1:185423/1‑99 (MQ=255) ttATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAAc < 2:1559663/100‑1 (MQ=255) ttATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAAc < 2:4117889/100‑1 (MQ=255) tatataGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGTTTCACcggaatcaccttaaataactctaaataagtgtctgggga < 1:871654‑M2/99‑40 (MQ=255) tatataGTATCTCCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACa > 2:2904432/1‑100 (MQ=255) aGTATCTGCCCAGACGCTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCAGACTGGTTCAACGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAgg < 1:3683594/100‑1 (MQ=255) gTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGa < 1:4178529/100‑1 (MQ=255) tGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGc > 1:1384865/1‑100 (MQ=255) tGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGc < 2:3730226/100‑1 (MQ=255) gCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCt < 2:1278002/100‑1 (MQ=255) 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1:3628694/100‑1 (MQ=255) cacTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAAc < 1:129843/100‑1 (MQ=255) cTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAg < 1:1628087/100‑1 (MQ=255) cTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAg > 1:56889/1‑100 (MQ=255) cTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAg > 2:3747808/1‑100 (MQ=255) tatttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCa > 2:696078/1‑100 (MQ=255) tagttatAGTTATTAAAGGTGCGTGCGACTGGTTCACCTGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAATAACAGAAGTAGCAGCTGTAAAAc < 1:4026314/93‑1 (MQ=255) atttatACTTATTAAAAGTGCGTCCGACTGGTTCACCGTACTCACCTTAAGTACGTTTCCTTGGGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCaa < 1:2712946/100‑1 (MQ=255) tttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGGACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAat < 1:2617526/100‑1 (MQ=255) tataGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAatga > 2:1179183/1‑100 (MQ=255) gTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCAGAAGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATgatgat > 1:2899735/1‑100 (MQ=255) tattaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatg < 2:141463‑M2/100‑74 (MQ=255) tattaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGAttt < 2:3222573/100‑1 (MQ=255) attaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGAtttt < 2:1703305/100‑1 (MQ=255) aaaGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGCTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtgat > 1:4321220/1‑100 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaat < 1:396405‑M2/100‑79 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtgatg > 1:3086783/1‑100 (MQ=255) ggTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgt < 2:3711021‑M1/100‑91 (MQ=255) ggTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgt > 1:485865‑M1/1‑10 (MQ=255) ggTGCGTCCGgtgaaccagtcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactaaataaattaacttagtgaatgattatgct > 1:3165248‑M1/1‑10 (MQ=255) ggTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgt < 2:600543‑M2/100‑81 (MQ=255) gTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGAcc < 2:575599/100‑1 (MQ=255) gCGTCCGgttaaccagtcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgtcat < 1:1370921‑M1/100‑94 (MQ=255) 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NC_000913/2699978‑2700176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |