| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2700077 | 129 (0.820) | 22 (0.160) | 13/154 | NT | 15.1% | intergenic (+154/+40) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 2700087 | 136 (1.000) | intergenic (+164/+30) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein/toxic membrane protein | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
TTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGG > NC_000913/2699988‑2700186 | ttaATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCAc < 2:712777/100‑1 (MQ=255)ttaATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCAc > 2:1241037/1‑100 (MQ=255) tAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACc < 2:401509‑M2/100‑2 (MQ=255) tAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACc < 2:1144847‑M2/100‑2 (MQ=255) tAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACc < 1:2856082‑M2/100‑2 (MQ=255) ttGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcgga < 1:4243567‑M2/100‑5 (MQ=255) tgatgaCATTAGCATAATCATTCACTGAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggac < 2:2680588‑M2/100‑6 (MQ=255) gatgaCATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacg > 2:3795017‑M2/1‑94 (MQ=255) aCATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacc < 2:3711021‑M2/100‑11 (MQ=255) aCATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacc > 1:485865‑M2/1‑90 (MQ=255) ttAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTa < 2:2834053/100‑1 (MQ=255) aGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAg > 2:4297849/1‑100 (MQ=255) aGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAg > 2:2629993/1‑100 (MQ=255) aGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAg < 2:854293/100‑1 (MQ=255) gCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGt > 1:2214271/1‑100 (MQ=255) gCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGt > 2:3585392/1‑100 (MQ=255) tAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCATACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACg < 1:245997/100‑1 (MQ=255) tAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataac < 2:636311‑M2/100‑20 (MQ=255) cATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTc > 2:1467892/1‑100 (MQ=255) ttCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGTTCCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCt < 1:1182429/100‑1 (MQ=255) ttCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCCCCTTAAGTACGTTTCCt < 1:3742654/100‑1 (MQ=255) ttCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCt < 2:23630/100‑1 (MQ=255) cACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg > 1:3168233/1‑100 (MQ=255) cACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg > 1:512965/1‑100 (MQ=255) cACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg > 2:548031/1‑100 (MQ=255) aCTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgt > 2:2740507/1‑100 (MQ=255) cTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgtg > 2:3152836/1‑100 (MQ=255) cTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtgtg < 1:638298/100‑1 (MQ=255) tAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTgtgt < 2:159377/100‑1 (MQ=255) tAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTgtgt < 1:2840187/100‑1 (MQ=255) tAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTgtgt < 1:1896468/100‑1 (MQ=255) aaGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTAGTGtt < 1:1003457/100‑1 (MQ=255) aGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTta > 2:60786/1‑100 (MQ=255) aGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATGAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTtg < 1:4308104/95‑1 (MQ=255) gTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGCTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtat < 1:2347550/100‑1 (MQ=255) gTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATATATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtat > 1:2648556/1‑100 (MQ=255) ttAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtata < 2:1881528/100‑1 (MQ=255) ttAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtata < 2:1312938/100‑1 (MQ=255) tAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATaa > 2:1203381/1‑100 (MQ=255) tAAATTATATACTATCTAACCAAACAATTATTAATAGTTATTAAAGGTGCGTTCGAATGATTGACCTGCCGCACCTTCAGTACGTTTCCTTGTGTtata > 1:185423/1‑99 (MQ=255) aaTTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAg < 2:3379522/100‑1 (MQ=255) aaTTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAg > 1:1315199/1‑100 (MQ=255) aaTTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAg < 2:3855810/100‑1 (MQ=255) aaTTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAg > 1:1498611/1‑100 (MQ=255) aTTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGa < 1:3787486/100‑1 (MQ=255) tttATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGaa > 2:3923414/1‑100 (MQ=255) ttATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAAc < 2:4117889/100‑1 (MQ=255) ttATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAAc < 1:2869215/100‑1 (MQ=255) atataGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAg > 2:684669/1‑100 (MQ=255) atataGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTAACCGGACGCACCGTAAGTACGTTTACTTGTGTTATAAGAACAg > 1:4073939/1‑100 (MQ=255) aGTATCTGCCCAGACGCTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCAGACTGGTTCAACGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAgg < 1:3683594/100‑1 (MQ=255) gTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGa < 1:4178529/100‑1 (MQ=255) tCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCa < 1:296235/100‑1 (MQ=255) tGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGc < 2:138217/100‑1 (MQ=255) tGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGc > 1:1384865/1‑100 (MQ=255) tGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGc < 2:3730226/100‑1 (MQ=255) tGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGc < 1:2040194/100‑1 (MQ=255) gCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCt < 2:1278002/100‑1 (MQ=255) 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attaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGAtttt < 2:1703305/100‑1 (MQ=255) ttaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgct < 1:1698990‑M2/100‑76 (MQ=255) ttaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGTGCAGCTGTAAAACAGCAatgttgatgttg < 1:807187/100‑1 (MQ=255) aaaGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtgtgggcagatactatataaattaatttagtgaatgcttatgctaa < 1:1128433‑M2/100‑78 (MQ=255) aaaGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGCTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtgat > 1:4321220/1‑100 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaat < 1:3595302‑M2/100‑79 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaat < 1:2086686‑M2/100‑79 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaat < 1:396405‑M2/100‑79 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtgatg < 2:2963366/100‑1 (MQ=255) aaGGTGCGTCCGACTGGTGCAACAGACGCACCATAAGTAAGTTACAATGTGTTATAAGAACAGAAAGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGAtttt < 1:906412/96‑1 (MQ=255) aGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatg < 2:4297678‑M2/100‑80 (MQ=255) ggTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgt < 1:3439974‑M2/100‑81 (MQ=255) ggTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgt < 1:4163989‑M2/100‑81 (MQ=255) gTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgcta < 1:1291964‑M2/95‑77 (MQ=255) 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2:1021536/100‑1 (MQ=255) ggTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCa > 1:2616872/1‑98 (MQ=255) ggTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAgg < 2:3180745/100‑1 (MQ=255) ggTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTACAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAgg < 1:1282131/100‑1 (MQ=255) ttCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTa > 2:3658857/1‑100 (MQ=255) cACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATc < 1:987839/100‑1 (MQ=255) | TTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGG > NC_000913/2699988‑2700186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |