| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 774622 | 131 (0.830) | 23 (0.160) | 10/166 | NT | 15.9% | intergenic (+20/‑130) | ybgE/ybgC | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon/acyl‑CoA thioester hydrolase |
| ? | NC_000913 | = 774648 | 122 (0.830) | intergenic (+46/‑104) | ybgE/ybgC | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon/acyl‑CoA thioester hydrolase | |||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
AGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCT > NC_000913/774523‑774721 | acatcccggtaatgcaacaaaagttagagcttttaaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTaaaaa > 2:1593387‑M1/95‑100 (MQ=255)acatcccggtaatgcaacaaaagttagagcttttaaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTaaaaa > 1:3513595‑M1/95‑100 (MQ=255)aGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAA > 1:1811007‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTaaaaaa > 2:797145/1‑100 (MQ=255) ggTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTaaaaaa > 2:4393567/1‑100 (MQ=255) tttGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTAt > 2:940150/1‑99 (MQ=255) ggCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATgtg > 1:350417/1‑97 (MQ=255) cAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCg > 2:3165246/1‑100 (MQ=255) cAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCg < 1:2683087/100‑1 (MQ=255) aGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAACCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCg > 2:968782/1‑98 (MQ=255) gggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGCTATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAACTCAGAATTCTCTTTAAAAtattatcg > 1:1077127/1‑91 (MQ=255) ggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCttc < 2:2990877/100‑3 (MQ=255) gATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCa < 1:2954503/100‑1 (MQ=255) tttttGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGc < 2:3417696/100‑1 (MQ=255) ttttGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGcc < 2:4360668/100‑1 (MQ=255) ttttGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGcc < 1:2985592/100‑1 (MQ=255) agttagagcttttaaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAATTTATGGGCCGCTCCAGGcc > 1:1343452‑M1/74‑99 (MQ=255) ttGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCa < 2:3153819/100‑1 (MQ=255) ttagagcttgtaaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCAt > 1:502060‑M1/72‑100 (MQ=255) gCCCATTGCTTGCCGTTATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccata < 1:1611179‑M1/100‑25 (MQ=255) gCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATa > 1:3180803/1‑100 (MQ=255) cccATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATaa > 2:551124/1‑100 (MQ=255) cATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAt < 2:1959977‑M2/100‑2 (MQ=255) ttgcttgtCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtt > 1:1167317‑M2/1‑97 (MQ=255) tttaaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAATTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 2:2626508‑M1/37‑1 (MQ=255) gcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataatttttt < 2:444272‑M1/100‑32 (MQ=255) gcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 1:2687036‑M2/100‑6 (MQ=255) gcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 2:1281970‑M2/100‑6 (MQ=255) cttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttta > 2:2828394‑M2/1‑94 (MQ=255) cttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttta > 1:4390095‑M2/1‑94 (MQ=255) cttgcAGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttta > 1:1391663‑M2/1‑94 (MQ=255) ttggCGAGATTGTTCTCATTGTCGGGCTTTTTTTTTACGTCTTTGGAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGTGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTa < 1:4179192/99‑1 (MQ=255) tgtcGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 1:2022761/94‑1 (MQ=255) tgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAattatgggcctggagcggcccataattttttaat < 2:1783942‑M1/100‑35 (MQ=255) tgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACg < 1:3622273/100‑1 (MQ=255) aaacgctgctacaatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACg > 1:595540‑M1/61‑100 (MQ=255) aacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGc > 2:2449393‑M1/60‑100 (MQ=255) aacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGc > 2:3525704‑M1/60‑100 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaaga < 2:749329‑M1/100‑37 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAattatgggcctggagcggcccataattttttaaaga < 2:1931779‑M1/100‑37 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 1:720529/1‑100 (MQ=255) cGATATTTTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAACAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaag < 1:760193‑M1/98‑36 (MQ=255) cGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagag < 2:139452‑M1/100‑38 (MQ=255) cGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagag < 2:3886212‑M1/100‑38 (MQ=255) gctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 1:787546‑M1/57‑98 (MQ=255) gctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTcc > 2:1186508‑M1/57‑100 (MQ=255) gATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTcc > 2:3506525/1‑100 (MQ=255) ttGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattc < 1:1796958‑M1/100‑43 (MQ=255) aTTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACACTCCCTTAACTTGccc > 1:2269092/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATAATAATTCTCTTTAAAAAATTATTGGCCTCTCTTGGCCCATAAATTTTTTCGCTCCCTTa > 1:2183772/1‑90 (MQ=255) cGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCAtt > 2:2572591/1‑100 (MQ=255) gggCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTc > 2:1541129/1‑100 (MQ=255) ggCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTcc < 2:3900381/100‑1 (MQ=255) ggCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTcc < 2:1699478/100‑1 (MQ=255) gCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTccc < 2:4326591/100‑1 (MQ=255) tGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaa < 1:2852923/100‑1 (MQ=255) gATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaaa > 1:3870156/1‑100 (MQ=255) aTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaaa < 1:1118321/99‑1 (MQ=255) aTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAAc < 1:1629735/100‑1 (MQ=255) ttttCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAAcc < 2:3724093/100‑1 (MQ=255) ttcttcttcTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTc < 2:2327021/100‑1 (MQ=255) cttcttcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATCGGCCGCTTCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTGAACTTGCCCACATTCCCAGACCTc > 1:1438117/1‑98 (MQ=255) tcttcttTTAAACCATAATTCTCTCTCAAAAATTATGGCCCGCTCCAGGCCCATAACTTCTTACGCTCCCTTAACTCGCCCTCATTCCCAAACCTCAATc < 1:993973/100‑1 (MQ=255) tcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcg > 1:4094645/1‑100 (MQ=255) cttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgc > 1:2343872/1‑100 (MQ=255) ttttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcg < 1:1153224/100‑1 (MQ=255) aaaTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGta > 1:2230574/1‑100 (MQ=255) aaTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGtat > 1:1572485/1‑100 (MQ=255) aaTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGtat > 2:1353733/1‑100 (MQ=255) aTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGtata > 2:3319492/1‑100 (MQ=255) tCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtag > 2:3858294/1‑100 (MQ=255) cAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagt < 1:1949305/100‑1 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagtag > 2:2485075/1‑100 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagtag > 2:1452520/1‑100 (MQ=255) ttCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatat < 2:1875273‑M2/100‑62 (MQ=255) ttCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTagcag > 1:1041434/1‑100 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcg < 2:121087‑M2/100‑64 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCg < 2:2776062/100‑1 (MQ=255) atcttTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatc < 1:565392‑M2/98‑63 (MQ=255) tctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcgg < 2:2743411‑M2/100‑65 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAATtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 2:473425‑M2/100‑66 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 2:772203‑M2/100‑66 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 2:3365546‑M2/100‑66 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 1:527011‑M2/100‑66 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGtt > 2:1971979/1‑100 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTGACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCACCCGCGCGCGTATACTAGCAGCGtt > 1:3859534/1‑99 (MQ=255) ttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGATCATAAATTTTTACGCTCACTTAGCTTGCACTAATTACCAAAGCACAATATCGCGCGTATATTagcagc > 1:2563178/1‑95 (MQ=255) tAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaag < 2:3685612‑M1/100‑95 (MQ=255) tAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaag < 2:1751416‑M1/100‑95 (MQ=255) AAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaa < 1:1781637‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaa > 2:4027973‑M1/1‑100 (MQ=255) AAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaa < 2:2947350‑M1/100‑1 (MQ=255) aaaatttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagca > 2:4111022‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaatttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatgtaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagca > 2:3606837‑M1/1‑4 (MQ=255) AAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaaa < 1:3086214‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaaa < 2:3997350‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaaa < 1:1754552‑M1/100‑1 (MQ=255) AAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGc > 1:435630‑M1/1‑100 (MQ=255) atttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaatg < 2:393031‑M1/100‑100 (MQ=255) AATTATGGCCCGCTCCATGCCCATAAACTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGc > 1:4367140‑M1/1‑99 (MQ=255) | AGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCT > NC_000913/774523‑774721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |