| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 774622 | 131 (0.830) | 23 (0.160) | 10/166 | NT | 15.9% | intergenic (+20/‑130) | ybgE/ybgC | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon/acyl‑CoA thioester hydrolase |
| ? | NC_000913 | = 774648 | 122 (0.830) | intergenic (+46/‑104) | ybgE/ybgC | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon/acyl‑CoA thioester hydrolase | |||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
CCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGAT > NC_000913/774549‑774746 | ccATTGCTGGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTGCCTTCTCCTTTTAAATCAGAAGTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATaaa < 2:1974803/100‑1 (MQ=255) cATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAt < 2:1959977‑M2/100‑2 (MQ=255) cATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAt < 2:393031‑M2/100‑2 (MQ=255) ttgcttgtCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtt > 1:1167317‑M2/1‑97 (MQ=255) tgcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTACATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttt > 2:3606837‑M2/1‑96 (MQ=255) tgcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttt > 2:4111022‑M2/1‑96 (MQ=255) tttaaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAATTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 2:2626508‑M1/37‑1 (MQ=255) gcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 2:1281970‑M2/100‑6 (MQ=255) gcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 1:2687036‑M2/100‑6 (MQ=255) cttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttta > 1:4390095‑M2/1‑94 (MQ=255) taaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTAc > 2:1533815‑M1/62‑100 (MQ=255) taaacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTAc > 1:134041‑M1/62‑100 (MQ=255) tgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACg < 1:3622273/100‑1 (MQ=255) tgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGACCATAAATTTTTACg > 2:4338751/1‑100 (MQ=255) aaacgctgctacaatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACg > 1:595540‑M1/61‑100 (MQ=255) aacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGc > 2:3525704‑M1/60‑100 (MQ=255) aacgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGc > 2:2449393‑M1/60‑100 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 2:3966742/1‑100 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 1:720529/1‑100 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 2:2713100/1‑100 (MQ=255) cgctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaaggagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTc > 1:1782751‑M1/58‑100 (MQ=255) gctgctactatacgcgcgcgattgaggtttgggaatgagggcaagttaagggagcgTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTcc > 2:3433045‑M1/57‑100 (MQ=255) gATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTcc < 2:1189568/100‑1 (MQ=255) gATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTcc > 2:3506525/1‑100 (MQ=255) tGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTaa > 2:479865/1‑100 (MQ=255) tGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTaa > 2:1623704/1‑100 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGcc > 1:2806777/1‑100 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGcc > 1:813295/1‑100 (MQ=255) aTTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACACTCCCTTAACTTGccc > 1:2269092/1‑100 (MQ=255) tGTCGGTCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATAATAATTCTCTTTAAAAAATTATTGGCCTCTCTTGGCCCATAAATTTTTTCGCTCCCTTa > 1:2183772/1‑90 (MQ=255) cGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCAtt > 2:2572591/1‑100 (MQ=255) ggCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTcc < 2:3900381/100‑1 (MQ=255) ggCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTcc < 2:1699478/100‑1 (MQ=255) cTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCa < 1:2949952/100‑1 (MQ=255) tGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaa < 1:1687389/100‑1 (MQ=255) aTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaaa > 1:1602804/1‑99 (MQ=255) aTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaaa < 1:1118321/99‑1 (MQ=255) tttCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCt > 1:3256039/1‑100 (MQ=255) ttcttcttcTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTc < 2:2327021/100‑1 (MQ=255) tcttcttctTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCa < 1:1435916/100‑1 (MQ=255) tcttcttctTTTAAATCAGAATTATCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCACACCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTc < 1:1981246/99‑1 (MQ=255) tcttcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGTCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTTCCCTCATTCCCAAACCTCAATc < 1:3867485/100‑1 (MQ=255) tcttcttTTAAACCATAATTCTCTCTCAAAAATTATGGCCCGCTCCAGGCCCATAACTTCTTACGCTCCCTTAACTCGCCCTCATTCCCAAACCTCAATc < 1:993973/100‑1 (MQ=255) tcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcg > 1:4094645/1‑100 (MQ=255) cttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgc > 1:2343872/1‑100 (MQ=255) cttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgc > 2:3201681/1‑100 (MQ=255) ttttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcg < 1:1153224/100‑1 (MQ=255) tttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgc < 1:3552804/100‑1 (MQ=255) ttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgcg < 1:1069078/100‑1 (MQ=255) ttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgcg < 1:4359104/100‑1 (MQ=255) tAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATTAATTTTTACGCTCCCTTAACTTACCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgctt > 2:4015906/1‑98 (MQ=255) aaaTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCTCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTAATTCCCAAATCTCAATCGCGCGCGta > 1:2100214/1‑100 (MQ=255) aaaTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGta > 1:2230574/1‑100 (MQ=255) aTCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGtata < 1:551122/100‑1 (MQ=255) tCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtag > 2:3858294/1‑100 (MQ=255) cAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagt < 1:1949305/100‑1 (MQ=255) aGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagta > 1:2760963/1‑100 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaa < 1:1796958‑M2/100‑59 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagtag > 2:2485075/1‑100 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagtag > 2:1452520/1‑100 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcg < 2:139452‑M2/100‑64 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcg < 2:3886212‑M2/100‑64 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaacaaaatcagcacgacaatgagaacaatatc < 1:1769449‑M2/99‑63 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCg < 2:2776062/100‑1 (MQ=255) tctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcgg < 2:749329‑M2/100‑65 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAATtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 2:473425‑M2/100‑66 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 2:3365546‑M2/100‑66 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttgttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaaaaatatcg < 1:760193‑M2/98‑64 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 2:133314‑M2/99‑66 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGttt < 1:1528777/100‑1 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGttt < 2:795722/100‑1 (MQ=255) attaAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAATtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggca < 2:1783942‑M2/99‑67 (MQ=255) ttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttgtaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaa < 2:3117003‑M2/100‑68 (MQ=255) ttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGATCATAAATTTTTACGCTCACTTAGCTTGCACTAATTACCAAAGCACAATATCGCGCGTATATTagcagc > 1:2563178/1‑95 (MQ=255) aaaaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagc < 2:444272‑M2/100‑70 (MQ=255) AAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaa < 2:2859614‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaa < 2:2947350‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaaa < 1:3086214‑M1/100‑1 (MQ=255) aaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaa < 1:162731‑M2/100‑72 (MQ=255) tccgatctggCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGc < 1:1370416/92‑1 (MQ=255) AAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGc > 2:3686602‑M1/1‑100 (MQ=255) AATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCt < 1:305110‑M1/100‑1 (MQ=255) aTTATGGGCTGCGCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCGTAAGTTGCTCTCGTTCCCAAACCTCAATCGCGCGGGTATAGTAGCAGGGTTTAAAAGcta < 2:4393730/100‑2 (MQ=255) aTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCTCGCGCGTATATTAGCAGCGTTTAAAAGctc > 2:2757825/1‑100 (MQ=255) aTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGctc < 2:2183164/100‑1 (MQ=255) tATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTa > 1:1876401/1‑100 (MQ=255) ggCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGcagatcgga > 2:1370421/1‑92 (MQ=255) ccGCTCCAGGCCCATAAATTTTGACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACtttt < 1:1814889/100‑1 (MQ=255) gCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTttgt < 2:1912711/100‑1 (MQ=255) cTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTttgtt < 2:1018734/100‑1 (MQ=255) cTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCCTAACTTGCCCCCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTttgtt < 1:515305/100‑1 (MQ=255) tCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTttgttg < 2:4033996/100‑1 (MQ=255) aGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCAt < 1:4221255/100‑1 (MQ=255) gCCCATAAATTTTTAAGCTCCGTTAACTTGCCCTCATTCCCCACCCTCAATCGCGTGCGTAGAGTAACAGCGTTTAAACCCTCTAACTTATGAAGCAtt > 1:3925217/1‑99 (MQ=255) cccATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTAc > 2:3297245/1‑100 (MQ=255) ccATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTAcc > 1:3899186/1‑100 (MQ=255) cATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCg < 1:1039435/100‑1 (MQ=255) tAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCggg < 2:4215619/100‑1 (MQ=255) aaaTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGa < 1:2322143/100‑1 (MQ=255) aaTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGAt < 2:2876010/100‑1 (MQ=255) | CCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGAT > NC_000913/774549‑774746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |