| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1486986 = | 114 (0.730) | 20 (0.150) | 8/156 | NT | 16.5% | intergenic (+23/‑249) | hrpA/ydcF | putative ATP‑dependent helicase/DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
| ? | NC_000913 | 1487021 = | 102 (0.740) | intergenic (+58/‑214) | hrpA/ydcF | putative ATP‑dependent helicase/DUF218 superfamily protein, SAM‑binding | |||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAG > NC_000913/1486922‑1487120 | gATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTtta < 1:1628313/100‑1 (MQ=255)gATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTtta < 2:3318355/100‑1 (MQ=255) tgcagcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttat > 2:3642670‑M1/64‑100 (MQ=255) tAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatt < 2:3522390/100‑1 (MQ=255) tAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatt < 2:514518/100‑1 (MQ=255) tAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatt < 1:1920988/100‑1 (MQ=255) tAAGCGTATTATGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCAGGTTTTttatt > 2:1784720/1‑100 (MQ=255) gcagcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatt > 2:2300907‑M1/63‑100 (MQ=255) gcagcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatt > 1:3636715‑M1/63‑100 (MQ=255) cagcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatta > 1:1442265‑M1/62‑100 (MQ=255) agcagagaattgtatttttcggattgcctgaatttttacccttaccgtgttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTttatta > 1:3771948‑M1/61‑99 (MQ=255) gcagagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAAt > 2:350235‑M1/60‑100 (MQ=255) gCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCTGGTTTTTTATTAAt > 1:2536117/1‑100 (MQ=255) gCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAAt > 2:1882390/1‑100 (MQ=255) gCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAAt > 2:1812861/1‑100 (MQ=255) cGTATTTTGCAGGCTATGGAGCAGATTAGCGGTTAACACTGCTATTTGCGTGATAAAGAAAAAAAGAGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAAt > 1:593447/1‑99 (MQ=255) agagaattgtatttttctgaattcctgaatttttacccttaccgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTc > 2:2842797‑M1/58‑100 (MQ=255) tATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCt > 2:3064333/1‑100 (MQ=255) gacaattgtatttttctgaagatctgaatttttacccttactgttttagaattaatAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTc > 1:1075200‑M1/57‑99 (MQ=255) ttGCAGGCGAGGGGGCAGATTAACTGTTAACCCTGCTATTTGTCGGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTATCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTaaaa < 2:4387464/100‑1 (MQ=255) tGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAAc > 1:1593325/1‑100 (MQ=255) tGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAAc < 1:497255/100‑1 (MQ=255) tGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAAc < 1:1812854/100‑1 (MQ=255) gCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACg < 2:3893500/100‑1 (MQ=255) gCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACg > 2:4176202/1‑100 (MQ=255) aTGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAggg < 2:827831/100‑1 (MQ=255) ggAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCACCGGGTTTTATATTAATTCTAAAACGGTAAgggca > 1:758303/1‑98 (MQ=255) gCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTaaaa > 2:4171310/1‑100 (MQ=255) cAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGTCGTGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTaaaaa < 1:428452/100‑1 (MQ=255) aGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGACGAGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAAt < 1:4272453/100‑1 (MQ=255) gATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAAtt > 2:2438873/1‑100 (MQ=255) gATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAAtt > 2:2870789/1‑100 (MQ=255) tAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAg < 2:765161/100‑1 (MQ=255) tAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGAGCCTGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAg < 1:649716/100‑1 (MQ=255) gCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGa > 2:4208248/1‑100 (MQ=255) gCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGa > 1:2670240/1‑100 (MQ=255) gCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGa < 1:292955/100‑1 (MQ=255) ggTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAAt > 1:228351/1‑100 (MQ=255) ggTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGCTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAAt > 1:3098561/1‑100 (MQ=255) gTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAAtt < 2:2586872/100‑1 (MQ=255) ttAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTc > 1:37927/1‑100 (MQ=255) tAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCa > 1:3620186/1‑100 (MQ=255) tGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGaaaaa < 2:2212914/100‑1 (MQ=255) tGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGaaaaa < 2:3620771/100‑1 (MQ=255) cTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATa > 1:1944012/1‑100 (MQ=255) tATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATAc < 2:10712/100‑1 (MQ=255) aTTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACa > 1:2384386/1‑100 (MQ=255) aTTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACa > 1:3331869/1‑100 (MQ=255) ttGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAAt < 2:4005177/100‑1 (MQ=255) cTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATtctc < 2:1138607/100‑1 (MQ=255) tGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATa < 2:118192/91‑1 (MQ=255) tGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCA‑TTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctg > 1:277444/1‑100 (MQ=255) gaattaataaaaaacccggcgctaaatgcttaccgggttttttATTAATTCTAAAACAGTAAGGGTAAAAATTCAGATCTTCAGAAAAATACAATtgtc > 1:1075200‑M2/44‑99 (MQ=255) attaataaaaaacccggcgctaaatgcttaccgggttttttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTAAGAAAAATACAATTCTctgc > 2:917054‑M2/42‑100 (MQ=255) aTAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgc < 2:169458/100‑1 (MQ=255) tAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgct > 2:1221887/1‑100 (MQ=255) tAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgct < 1:1653815/100‑1 (MQ=255) tAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgct > 1:4005199/1‑100 (MQ=255) aaaGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgctg < 1:2614661/100‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTctgctg > 2:2123220/1‑100 (MQ=255) aataaaaaacccggcgctaaatgcttaccgggttttttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCtgctgc > 1:3636715‑M2/39‑100 (MQ=255) aataaaaaacccggcgctaaatgcttaccgggttttttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCtgctgc > 1:3636771‑M2/39‑100 (MQ=255) ataaaaaacccggcgctaaatgcttaccgggttttttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCa > 1:132530‑M2/38‑100 (MQ=255) aGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCa > 2:1589389/1‑100 (MQ=255) aGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCa < 1:1748873/100‑1 (MQ=255) 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atcATTTAGCGCCGGGTTATTTATTAATTCTAAAACGGTAAGTGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGttt < 1:323880/98‑1 (MQ=255) gCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTa > 2:3448590/1‑100 (MQ=255) tttAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCt > 2:3143759/1‑100 (MQ=255) ttAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTa < 1:1278637/100‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACa < 2:3793476/100‑1 (MQ=255) gcgcCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAg > 1:2343604/1‑100 (MQ=255) gcgcCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAg > 1:156258/1‑100 (MQ=255) gttttttATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTcc < 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NC_000913/1486922‑1487120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |