| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3241195 = | 139 (0.880) | 23 (0.160) | 16/162 | NT | 16.3% | coding (550/552 nt) | ygjV | Imp‑YgjV family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 3241224 = | 110 (0.770) | coding (521/552 nt) | ygjV | Imp‑YgjV family inner membrane protein | |||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGC > NC_000913/3241125‑3241323 | tgaatggcctgaatatcattcgtttctggcggatacataaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGttt > 1:3589383‑M1/71‑100 (MQ=255)gTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGTTCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGttt < 2:3230933/100‑1 (MQ=255)gTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGttt > 2:3743357/1‑100 (MQ=255) ttCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGtttt > 2:2769655/1‑100 (MQ=255) aatggcctgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtc > 2:856509‑M1/69‑100 (MQ=255) cACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtct > 1:2018482/1‑100 (MQ=255) cACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtct < 1:3031948/100‑1 (MQ=255) atggcctgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtct > 1:484473‑M1/68‑100 (MQ=255) tggcctgaatatcattcgtttctgggggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtctc > 1:3351897‑M1/67‑100 (MQ=255) tggcctgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagtttagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtctc > 1:3000878‑M1/67‑100 (MQ=255) tggcctgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTtctc > 2:2476662‑M1/67‑100 (MQ=255) ggcctgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaactgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCa > 1:2819166‑M1/66‑100 (MQ=255) ctacGGCACCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAACGAGCGCCCTGCGTAATTACTTGTTTAACCCCTCTCGACTACGGCCGAAAGCGGTTtc > 1:1853503/4‑97 (MQ=255) cTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCa > 2:530173/1‑100 (MQ=255) cTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGACCTGCGTAATTAATTGTTTAACCACTTTCGTCCACGGCGCAAGCGCttt > 1:4407799/1‑95 (MQ=255) gcctgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCaa > 2:1728267‑M1/65‑100 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc < 1:2202581/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc > 2:4142792/1‑100 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc < 2:663475/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc < 1:1369060/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTCTCTCAAc < 2:2321746/100‑1 (MQ=255) cctgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAAc > 2:4306540‑M1/64‑100 (MQ=255) tgaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACtt > 2:848070‑M1/62‑100 (MQ=255) gccgCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACttt < 1:1119668/97‑1 (MQ=255) gaatatcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACttt > 2:3449782‑M1/61‑100 (MQ=255) gCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACttt > 2:3138118/1‑100 (MQ=255) cTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAc > 1:748380/1‑100 (MQ=255) atcattcgtttctggcggatgcagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAc > 1:331122‑M1/57‑100 (MQ=255) ttGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACg < 2:2421536/100‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTAGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAAc < 1:2127799/99‑1 (MQ=255) gCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGa < 2:3495236/100‑1 (MQ=255) gCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGa < 2:3891115/100‑1 (MQ=255) ccAGGCAGAAGACGATCGTCTTGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACggtt > 1:1638812/1‑98 (MQ=255) ccAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGAt < 2:1750612/100‑1 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCTCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAAGGGTTTTCTCACCTTTAACCGGATc > 1:2717245/1‑100 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATc < 1:3239012/100‑1 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATc < 2:1699417/100‑1 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATc > 2:2550353/1‑100 (MQ=255) cAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATc < 1:2584262/100‑1 (MQ=255) ggCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCaa > 1:4299056/1‑100 (MQ=255) cAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAAtt < 1:2431187/100‑1 (MQ=255) gaagaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTTTGTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcc < 1:4337606/100‑1 (MQ=255) agaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcccc > 2:3945701/1‑100 (MQ=255) gaCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTcccc < 1:1051496/99‑1 (MQ=255) aCGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCtt > 1:2828632/1‑100 (MQ=255) aCGATCGTCTGGCAAATACCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGACAGAAGGGGTTCACCCAACTTTAAACCGCTCAATTCCCCtt > 1:4174598/1‑100 (MQ=255) cGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCttt > 1:341788/1‑100 (MQ=255) gATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCtttt < 1:3218805/100‑1 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 1:3162576/100‑1 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 2:962441/100‑1 (MQ=255) cGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTg < 2:942249/100‑1 (MQ=255) cagaaaaggggaattgatccgtttaaagttgagaaaaccccttacgccgtagacgaaaggggttTTCTCCACTTTAAACGGATCAATTAACCTTTTCt > 1:246399‑M2/65‑98 (MQ=255) tGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATc > 2:2841079/1‑100 (MQ=255) gCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTTCATcc > 1:3892191/1‑99 (MQ=255) cAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGc > 2:1756065/1‑100 (MQ=255) aTAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAg < 2:1641997/100‑1 (MQ=255) aTAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCGACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGcc < 1:282968/98‑1 (MQ=255) aTAGCGCCCTGCGTAAGTAATTCTTTATCCCCTTTCGGCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAGCTTTAAACGGTTCAATACTCCGTTTCTGCCTCCGCCat < 1:3648440/100‑2 (MQ=255) tAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGa < 1:2536919/100‑1 (MQ=255) tAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGa < 2:1590008/100‑1 (MQ=255) tAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGa > 2:722038/1‑100 (MQ=255) gcgcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGaaa > 1:2120243/1‑100 (MQ=255) gcgcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCACCTTTTCTGCATCCGCCAGaaa > 1:2933637/1‑100 (MQ=255) gcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGCAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCACTTCCCCTTTTCTTCATCCGCCAGAAAc > 1:834837/1‑99 (MQ=255) gcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACg < 2:2746020/100‑1 (MQ=255) gcCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACg > 2:2143270/1‑100 (MQ=255) tccgtttaaagttgagaaaaccccttccgccgtagacgaaaggggttTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAAt < 1:1997957‑M2/53‑1 (MQ=255) cTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAAt < 2:341789/100‑1 (MQ=255) cTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAAt < 1:1090203/100‑1 (MQ=255) cTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAAt < 1:1591129/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATTAATTGTTTACCCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATg < 2:1320445/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATg > 2:4351039/1‑100 (MQ=255) gCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGa > 1:4228044/1‑100 (MQ=255) 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ttAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTc < 1:3062578/100‑1 (MQ=255) ttAACCCCTTTCGTCTACGGCAAAAAGAGATTTCTCAACTTTAAAGGGATCAATTCCCCTTTTCTCTATCTGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTc > 1:9968/1‑100 (MQ=255) tAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCa > 2:3375972/1‑100 (MQ=255) aaccccttccgccgtagacgaaaggggttTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCAt > 2:3470915‑M2/30‑100 (MQ=255) AACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCAt < 2:2913035‑M1/100‑1 (MQ=255) ACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATa < 2:1073878‑M1/100‑1 (MQ=255) ACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATa > 1:2769638‑M1/1‑100 (MQ=255) CCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTGAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCAGCCAGACACGAATGATATTCAGGCCATTCATa < 2:3039975‑M1/98‑1 (MQ=255) CCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGc < 2:2045032‑M1/100‑1 (MQ=255) tCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGTATCAATTCCCCTTTTCTGTATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAAc > 1:725708/1‑100 (MQ=255) tCTACGGCGGAAGGCTTCTCCTCAACCTTAAACGGCTCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAAAGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGaac > 1:1196167/1‑97 (MQ=255) tACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTa > 2:3843746/1‑100 (MQ=255) naCGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGaaaa > 1:3799802/2‑97 (MQ=255) aCGGCGGCAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAc > 2:2320652/1‑100 (MQ=255) aCGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTAc < 2:395678/100‑1 (MQ=255) aCGGCGGAAGGGGATTTCTCAACGTTAAACGGATTAATTCCCCTTCTCTGCATGCGCCAGAAACGGATGATATTCAGGCCACTCaga < 1:396906/87‑3 (MQ=255) ggAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCa > 2:2490904/1‑100 (MQ=255) ggggtcTTCTCAACTTTAAACGGATCTATCCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTc < 1:2893948‑M2/89‑1 (MQ=255) ttTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTGTTCTGCATCCGCCAGAAACGGATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACGATCCTCAATCATCg < 1:1286701‑M2/97‑1 (MQ=255) tTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTg < 2:225362‑M2/99‑1 (MQ=255) | GTTCACTGCGGCAGCTTGCCAGGCAGAAGACGATCGTCTGGCAAATAGCGCCCTGCGTAATTAATTGTTTAACCCCTTTCGTCTACGGCGGAAGGGGTTTTCTCAACTTTAAACGGATCAATTCCCCTTTTCTGCATCCGCCAGAAACGAATGATATTCAGGCCATTCATAAGCAGAAAACTACCCTCAATCATCGTGC > NC_000913/3241125‑3241323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |