| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 73 (0.800) | 13 (0.160) | 8/156 | NT | 18.1% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 54 (0.670) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein | |||||
ATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465199‑1465092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATAT > NC_000913/1465125‑1465223 ATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTC > 2:501013/1‑100 ACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGC < 1:2548748/100‑1 ACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGC < 1:416209/100‑1 AATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTT < 2:717791/100‑1 AATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTT < 2:2140752/100‑1 TAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT < 1:65706/99‑1 TAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCAT > 2:1190137/1‑100 ACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAT > 1:448723/1‑100 CAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTG > 2:1579994/1‑100 CAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCATTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATTAGAA > 1:607697/1‑96 AATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATACTGAGAATGTGGT > 1:1981562/1‑100 AATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGT > 1:1847605/1‑100 AATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGT > 2:1844520/1‑100 AAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTAATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTT > 1:1241072/1‑100 AATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTA > 2:364838/1‑100 AATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTT > 1:9171/1‑99 AAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTTTTTTATATTTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATT > 1:1647047/1‑100 AAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATT > 2:1293338/1‑100 AAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTT > 1:1549402/1‑100 taatCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATA < 1:2213296/96‑1 AACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATA < 2:448725/100‑1 CTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACA < 1:197955/100‑1 TCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACAC > 2:86999/1‑100 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAT > 2:121609/1‑100 CTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATT > 2:2278185/1‑100 TTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTT < 1:1961093/100‑1 TTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTA < 2:1649856/100‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTAT > 2:1620628/1‑100 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATA < 2:876861/100‑1 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATA < 1:1183319/100‑1 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATA > 2:2253224/1‑100 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATA > 2:1573894/1‑100 TTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTATTATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATAT < 1:1868208/100‑1 ATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465199‑1465092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATAT > NC_000913/1465125‑1465223 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |