| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 73 (0.800) | 13 (0.160) | 8/156 | NT | 18.1% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 54 (0.670) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTA > NC_000913/1464993‑1465190 | ccATTGCGGGAAATTGAACCTGTCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATta < 2:528730/100‑1 (MQ=255)atataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatataataaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaa < 1:1868208‑M1/1‑1 (MQ=255) tataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaat < 1:1183319‑M1/2‑1 (MQ=255) tataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaat < 2:876861‑M1/2‑1 (MQ=255) tataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaat > 2:1573894‑M1/99‑100 (MQ=255) tataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaat > 2:2253224‑M1/99‑100 (MQ=255) ataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaata > 2:1620628‑M1/98‑100 (MQ=255) aTTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATtata > 2:1189283/1‑100 (MQ=255) taaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaataa < 2:1649856‑M1/4‑1 (MQ=255) aaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaataaa < 1:1961093‑M1/5‑1 (MQ=255) gCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAg > 2:1851607/1‑100 (MQ=255) gCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAg > 2:499124/1‑100 (MQ=255) aattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAg > 2:2278185‑M1/95‑100 (MQ=255) 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> 1:9171‑M1/66‑99 (MQ=255) accacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:1847605‑M1/63‑100 (MQ=255) tttGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg < 2:1066666/100‑1 (MQ=255) tttGATGAGAAGCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg < 2:320223/100‑1 (MQ=255) cacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg > 2:1579994‑M1/61‑100 (MQ=255) ttGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGATATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGa > 1:404494/1‑100 (MQ=255) tgatgaGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAg < 1:739189/100‑1 (MQ=255) tgatgaGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAg > 2:1844713/1‑100 (MQ=255) 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2:669431/100‑1 (MQ=255) ttATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTAGtttt > 1:1870651/1‑100 (MQ=255) tataAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTa < 2:2240407/100‑1 (MQ=255) tataAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTa > 2:1031299/1‑100 (MQ=255) ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTa < 1:65706‑M1/99‑1 (MQ=255) | CCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTA > NC_000913/1464993‑1465190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |