| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 73 (0.800) | 13 (0.160) | 8/156 | NT | 18.1% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 54 (0.670) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATA > NC_000913/1465026‑1465224 | taaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttatt > 2:364838‑M1/67‑100 (MQ=255)cTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttatt < 1:357989/100‑1 (MQ=255) aaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtattaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttattt > 1:1241072‑M1/66‑100 (MQ=255) aaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttatt > 1:9171‑M1/66‑99 (MQ=255) accacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:1847605‑M1/63‑100 (MQ=255) accacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 2:1844520‑M1/63‑100 (MQ=255) accacattctcagtataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTtatttatt > 1:1981562‑M1/63‑100 (MQ=255) tttGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg < 2:1066666/100‑1 (MQ=255) tttGATGAGAAGCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg < 2:320223/100‑1 (MQ=255) cacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg > 2:1579994‑M1/61‑100 (MQ=255) ttGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGATATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGa > 1:404494/1‑100 (MQ=255) tgatgaGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAg > 2:1844713/1‑100 (MQ=255) tgatgaGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAg < 1:739189/100‑1 (MQ=255) gatgaGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGt < 2:1678856/100‑1 (MQ=255) attctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGt > 1:448723‑M1/58‑100 (MQ=255) ttctaattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAATGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTg > 1:607697‑M1/57‑96 (MQ=255) agaATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTa > 1:1209266/1‑100 (MQ=255) tCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTc < 1:794122/100‑1 (MQ=255) cTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTAGGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAAttta > 2:2047463/1‑98 (MQ=255) ttcGACCGAAACAGTAACAGATGTAATATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATATTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCAt < 1:1967695/98‑1 (MQ=255) taaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCAt > 2:1190137‑M2/81‑100 (MQ=255) tGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCAt < 1:1314540/100‑1 (MQ=255) tGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATATTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTACTTc > 2:150925/1‑98 (MQ=255) gACCGAAACATTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATAcc < 1:225349/100‑1 (MQ=255) aCCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCg > 2:2303433/1‑100 (MQ=255) gTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcat < 1:2275241/100‑1 (MQ=255) gTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtca < 2:370630/99‑1 (MQ=255) aaCAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTtcatca < 1:1804446/100‑1 (MQ=255) cAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCata > 1:164984/1‑100 (MQ=255) aTGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATaa > 1:77066/1‑100 (MQ=255) tGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAat > 1:2438757/1‑100 (MQ=255) gTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAatt > 1:717441/1‑100 (MQ=255) tAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAatta > 2:1023859/1‑100 (MQ=255) tAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTAATTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAattc > 1:1658181/1‑99 (MQ=255) aaaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAattatt < 2:1482497/100‑1 (MQ=255) aaaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAattatt < 2:1482823/100‑1 (MQ=255) aaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAAttattt > 1:433371/1‑100 (MQ=255) attattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAAttattta > 2:2131574/1‑100 (MQ=255) atgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAAttattta > 2:1190137‑M1/21‑100 (MQ=255) ttattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAAttatttat < 2:1195254/100‑1 (MQ=255) tattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTtata < 1:70079/100‑1 (MQ=255) attTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTTTCTTATATTTATTGATaa > 1:974382/1‑100 (MQ=255) gTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATgaga > 2:2589118/1‑100 (MQ=255) cccTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAt > 2:847896/1‑100 (MQ=255) actcaaataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAt > 1:448723‑M2/44‑100 (MQ=255) ccTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAtg > 1:1098658/1‑100 (MQ=255) ccTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAt > 2:594338/1‑99 (MQ=255) cTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAtgt > 2:1224832/1‑100 (MQ=255) tttAATTATAACGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAtgt < 1:1325399/99‑1 (MQ=255) caaataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAtgtg > 2:1579994‑M2/41‑100 (MQ=255) caaataaataaagcagagcttaaacataactctgcattatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATTAGaa > 1:607697‑M2/41‑96 (MQ=255) ttAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTgg > 2:2571832/1‑100 (MQ=255) tAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGt < 1:107982/100‑1 (MQ=255) aataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATACTGAGAATGTGGt > 1:1981562‑M2/39‑100 (MQ=255) aataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGt > 2:1844520‑M2/39‑100 (MQ=255) aataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGt > 1:1847605‑M2/39‑100 (MQ=255) aTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGttt > 1:876858/1‑100 (MQ=255) ttATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGtttt < 2:669431/100‑1 (MQ=255) ttATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTAGtttt > 1:1870651/1‑100 (MQ=255) aaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTAATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGtttt > 1:1241072‑M2/36‑100 (MQ=255) tataAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTa > 2:1031299/1‑100 (MQ=255) tataAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTa < 2:2240407/100‑1 (MQ=255) aataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTa > 2:364838‑M2/35‑100 (MQ=255) ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTa < 1:65706‑M1/99‑1 (MQ=255) aaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTTTTTTATATTTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAAtt > 1:1647047‑M2/32‑100 (MQ=255) aaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAAtt > 2:1293338‑M2/32‑100 (MQ=255) AAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAAtt < 2:717791‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAAtt < 2:2140752‑M1/100‑1 (MQ=255) aagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAAttt > 1:1549402‑M2/31‑100 (MQ=255) GCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGt < 1:2548748‑M1/100‑1 (MQ=255) GCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGt < 1:416209‑M1/100‑1 (MQ=255) GAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAAt > 2:501013‑M1/1‑100 (MQ=255) gTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTAGTGTGTAGTTTTTATTTGtttttt > 1:643697/1‑95 (MQ=255) tATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttat > 1:355016/1‑100 (MQ=255) tGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTACTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatat > 2:1793906/1‑100 (MQ=255) gTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCTTTTTTTTATTATTTATAATAAGAATGTGGTTTTAATTTTTAATttatatt > 1:1064509/1‑100 (MQ=255) gTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatatt > 2:356812/1‑100 (MQ=255) gTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatatt > 1:1007807/1‑100 (MQ=255) gTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatatt < 1:100391/100‑1 (MQ=255) gTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATGATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatatt < 2:2132475/100‑1 (MQ=255) ttAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatattat > 2:267771/1‑100 (MQ=255) taatctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatattata < 1:2213296‑M2/85‑1 (MQ=255) tAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttatattata > 2:1884759/1‑100 (MQ=255) aactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATtatata < 2:448725‑M2/87‑1 (MQ=255) gCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTtatattatat > 2:2451982/1‑98 (MQ=255) ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATaca < 1:197955‑M2/89‑1 (MQ=255) ctctGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTATAATGAGAAATTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATaca > 1:2425907/1‑100 (MQ=255) tctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATacac > 2:86999‑M2/11‑100 (MQ=255) gctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAt > 2:121609‑M2/8‑100 (MQ=255) ctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAtt > 2:2278185‑M2/7‑100 (MQ=255) tttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAttt < 1:1961093‑M2/95‑1 (MQ=255) ttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTta < 2:1649856‑M2/96‑1 (MQ=255) tatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtat > 2:1620628‑M2/4‑100 (MQ=255) atTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtata < 2:876861‑M2/98‑1 (MQ=255) atTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtata < 1:1183319‑M2/98‑1 (MQ=255) atTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtata > 2:1573894‑M2/3‑100 (MQ=255) atTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtata > 2:2253224‑M2/3‑100 (MQ=255) tTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTATTATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtatat < 1:1868208‑M2/99‑1 (MQ=255) ttatttGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtatata < 2:71019/100‑1 (MQ=255) ttatttGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtatata > 1:454956/1‑100 (MQ=255) | CTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATA > NC_000913/1465026‑1465224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |