| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2971498 | 86 (0.940) | 20 (0.230) | 11/168 | NT | 19.2% | intergenic (+9/‑99) | ygdR/tas | DUF903 family verified lipoprotein/putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase |
| ? | NC_000913 | = 2971513 | 87 (1.010) | intergenic (+24/‑84) | ygdR/tas | DUF903 family verified lipoprotein/putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase | |||||
TGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2971396‑2971498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaggCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGATCGTGATAACTCAC < NC_000913/2971513‑2971415 TGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATA > 2:310357/1‑100TGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATA < 1:692588/100‑1 TGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGG > 1:681961/1‑100 GAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCT < 1:741476/100‑1 AGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTT < 2:859086/100‑1 GTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTA < 1:1733772/100‑1 GTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTA < 1:1829211/100‑1 TTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTAT < 1:1489364/100‑1 TTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTAT < 2:184578/100‑1 TATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATT < 1:2169208/100‑1 TATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATT < 2:2178832/100‑1 TATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATT < 2:1996751/100‑1 TATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATT < 2:1010731/100‑1 ATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTT < 1:1636739/100‑1 ATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTT < 2:1921100/100‑1 ACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTT < 2:1085152/100‑1 GATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAA < 2:163676/100‑1 GATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAA < 2:2134270/100‑1 GATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAAACGTGATAATGTTTCGCAAATTATGGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGT < 1:647445/97‑1 ATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAAC < 1:651082/100‑1 ATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGACGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAAC < 1:1365563/100‑1 GTTTCGCAAATTATTGATTGTTAACAAATAAGGCCAGACGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTG < 1:306479/99‑1 GTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGAT > 1:1866544/1‑100 TAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACCTCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTACTGATCGTGATAAC > 1:1824708/1‑100 TAAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGATCGTGATAAC < 2:2205724/100‑1 AAGGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGATCGTGATAACT > 1:1811133/1‑100 GGCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGATCGTGATAACT > 1:552443/1‑98 GCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGATCGTGATAACTCAC > 1:1952986/1‑100 GCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGATCGTGATAACTCAC > 1:2114456/1‑100 TGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2971396‑2971498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaggCCAGCCGGATGCTGACCTTATTTGTTAACGTTCAATAATTTGCGAAACATCATCACGGTTAATTTGCATCGCGTTACCTTGCTGATCGTGATAACTCAC < NC_000913/2971513‑2971415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |