| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2971498 | 86 (0.940) | 20 (0.230) | 11/168 | NT | 19.2% | intergenic (+9/‑99) | ygdR/tas | DUF903 family verified lipoprotein/putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase |
| ? | NC_000913 | = 2971513 | 87 (1.010) | intergenic (+24/‑84) | ygdR/tas | DUF903 family verified lipoprotein/putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTA > NC_000913/2971399‑2971597 | tgatgatACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGG > 1:681961‑M1/1‑100 (MQ=255) gatgatACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGt > 1:1790785/1‑100 (MQ=255) atgatACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCACATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTc > 1:521470/1‑100 (MQ=255) atgatACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTc > 2:2310086/1‑100 (MQ=255) tACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCa > 1:1603635/1‑100 (MQ=255) ccGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATc > 2:1482467/1‑100 (MQ=255) gCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGc < 2:2266497/100‑1 (MQ=255) cTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCt < 2:1901375/100‑1 (MQ=255) ggTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTgg > 1:1485267/1‑100 (MQ=255) gTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGc > 1:1952986‑M2/1‑99 (MQ=255) gTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGc > 1:2114456‑M2/1‑99 (MQ=255) gAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgacct < 1:741476‑M1/100‑19 (MQ=255) aGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgacctt < 2:859086‑M1/100‑20 (MQ=255) aGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGcctt > 1:1811133‑M2/1‑96 (MQ=255) gTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgacctta < 1:1829211‑M1/100‑21 (MQ=255) gTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGcctta < 2:2205724‑M2/100‑6 (MQ=255) ttATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttat < 2:184578‑M1/100‑22 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatt < 2:1996751‑M1/100‑23 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatt < 2:2178832‑M1/100‑23 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatt < 2:1010731‑M1/100‑23 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatt < 1:2169208‑M1/100‑23 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAg > 2:2433884/1‑100 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAg < 2:2575224/100‑1 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAg > 1:358884/1‑100 (MQ=255) aTCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttattt < 1:1636739‑M1/100‑24 (MQ=255) aTCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttattt < 2:1921100‑M1/100‑24 (MQ=255) tCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTGTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAt > 1:609808/1‑100 (MQ=255) aCGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatttgtt < 2:1085152‑M1/100‑27 (MQ=255) aCGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAttt > 2:1663079/1‑100 (MQ=255) aCGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGAAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAttt > 1:9153/1‑100 (MQ=255) cGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAACTTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGACTTAAGAtttt > 1:222329/1‑100 (MQ=255) cGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAtttt < 2:1223457/100‑1 (MQ=255) cGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAtttt < 1:2187187/100‑1 (MQ=255) cGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAtt > 1:165816/1‑98 (MQ=255) gATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatttgttaa < 2:163676‑M1/100‑29 (MQ=255) gATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatttgttaa < 2:2134270‑M1/100‑29 (MQ=255) gATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAAACGTGATAATGTTTCGCAAATTATGGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatttgt < 1:647445‑M1/97‑26 (MQ=255) aTCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGccagccggatgctgaccttatttgttaac < 1:651082‑M1/100‑30 (MQ=255) aTCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTtc > 1:1490316/1‑100 (MQ=255) aTCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTtc < 2:434134/100‑1 (MQ=255) aTCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGAccttatttgttaac > 1:1866544‑M2/1‑86 (MQ=255) cAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTtctc > 1:688986/1‑100 (MQ=255) gCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtt > 2:539688/1‑100 (MQ=255) aaGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttc < 2:2473849/100‑1 (MQ=255) aaGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTAGAAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATACGGCTGGGCGTAAGATTTTTCTCtt > 1:1630410/1‑98 (MQ=255) cgcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttc > 2:2301462/1‑100 (MQ=255) gcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttcc < 2:150570/100‑1 (MQ=255) gcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttcc < 2:2443748/100‑1 (MQ=255) gcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttcc < 1:2053021/100‑1 (MQ=255) aaaTTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTtcccttccct > 1:1794533/1‑100 (MQ=255) aTTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCctct > 2:2492047/1‑100 (MQ=255) aTTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCctct < 2:1654742/100‑1 (MQ=255) ttAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTg < 2:866850/100‑1 (MQ=255) aaCCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGcc > 2:2083737/1‑100 (MQ=255) aaCCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGcc < 2:1544803/100‑1 (MQ=255) cGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACTAATAAGGTCAGCATCGGGCTCGCCTTAGGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCAtt < 1:27789/100‑1 (MQ=255) atgTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTatat > 1:2163632/1‑100 (MQ=255) tgTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAATTTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATAtt < 1:104098/100‑1 (MQ=255) gTTTCGCAAATTATTGATTGTTAACAAATAAGGccagacggatgctgaccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttg < 1:306479‑M1/99‑67 (MQ=255) gTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAAATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTc > 2:1197520/1‑100 (MQ=255) tttCGCAAATTATTTAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTcc > 1:1712556/1‑100 (MQ=255) cGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTa < 1:2380551/100‑1 (MQ=255) cGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTa < 2:476919/100‑1 (MQ=255) aaTTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGTCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTc < 1:821717/100‑1 (MQ=255) attattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCg < 2:1103714/100‑1 (MQ=255) attattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCg < 2:2553895/100‑1 (MQ=255) attattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCg < 2:2169181/100‑1 (MQ=255) tattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTg < 1:310355/100‑1 (MQ=255) tattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTg < 1:2268722/100‑1 (MQ=255) attGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGa > 2:687960/1‑100 (MQ=255) tGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGAt > 1:706885/1‑99 (MQ=255) gAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATta > 2:2273063/1‑100 (MQ=255) gAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATta < 2:1167939/100‑1 (MQ=255) gAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATta > 2:1515086/1‑100 (MQ=255) aCGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATtata < 2:156412/100‑1 (MQ=255) cGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATaa > 1:2203286/1‑100 (MQ=255) gTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcgtcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgat < 1:1365563‑M2/100‑72 (MQ=255) gTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgat < 1:651082‑M2/100‑72 (MQ=255) gTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATaaa < 1:2339773/100‑1 (MQ=255) ttAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatc < 2:163676‑M2/100‑73 (MQ=255) ttAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatc < 2:2134270‑M2/100‑73 (MQ=255) tAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTCTATTCCTTATGTCGTGATTATaaaaa > 2:108329/1‑100 (MQ=255) aaCAAATAAGGTAAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTCTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTTTGTCGTGACTATAAAAAg > 1:1271052/1‑100 (MQ=255) aCAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAgg < 1:1620657/100‑1 (MQ=255) cAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGa > 2:54742/1‑100 (MQ=255) aaTAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgata < 2:1996751‑M2/100‑79 (MQ=255) aaTAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGaaa > 2:971419/1‑100 (MQ=255) aTAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataa < 2:184578‑M2/100‑80 (MQ=255) aTAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataa < 1:1489364‑M2/100‑80 (MQ=255) tAAGGccagccggatgctgaccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacctcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttactgatcgtgataac > 1:1824708‑M1/1‑5 (MQ=255) tAAGGccagccggatgctgaccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataac < 2:2205724‑M1/100‑96 (MQ=255) tAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataac < 1:1829211‑M2/100‑81 (MQ=255) tAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataac < 1:1733772‑M2/100‑81 (MQ=255) aGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGc < 1:1331207/100‑1 (MQ=255) aGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTGCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGc < 1:1789716/100‑1 (MQ=255) ngTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCt > 2:1485453/2‑100 (MQ=255) ggccagccggatgctgaccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataact > 1:552443‑M1/1‑2 (MQ=255) ggTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCt > 1:1894446/1‑100 (MQ=255) gccagccggatgctgaccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataactcac > 1:2114456‑M1/1‑1 (MQ=255) gccagccggatgctgaccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataactcac > 1:1952986‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTA > NC_000913/2971399‑2971597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |