New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2971498 | 86 (0.940) | 20 (0.230) | 11/168 | NT | 19.2% | intergenic (+9/‑99) | ygdR/tas | DUF903 family verified lipoprotein/putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase |
? | NC_000913 | = 2971513 | 87 (1.010) | intergenic (+24/‑84) | ygdR/tas | DUF903 family verified lipoprotein/putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAATATCACCGT > NC_000913/2971414‑2971611 | ggTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTgg > 1:1485267/1‑100 (MQ=255) gTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGc > 1:2114456‑M2/1‑99 (MQ=255) gTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGc > 1:1952986‑M2/1‑99 (MQ=255) gTTATCACGATCAGTAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGAGGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGcctta > 1:1824708‑M2/1‑95 (MQ=255) gTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGcctta < 2:2205724‑M2/100‑6 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAg < 2:2575224/100‑1 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAg > 1:358884/1‑100 (MQ=255) tATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAg > 2:2433884/1‑100 (MQ=255) tCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTGTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAt > 1:609808/1‑100 (MQ=255) aCGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAttt > 2:1663079/1‑100 (MQ=255) aCGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGAAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAttt > 1:9153/1‑100 (MQ=255) cGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAtttt < 2:1223457/100‑1 (MQ=255) cGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAtttt < 1:2187187/100‑1 (MQ=255) cGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGAtt > 1:165816/1‑98 (MQ=255) aTCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTtc > 1:1490316/1‑100 (MQ=255) aTCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTtc < 2:434134/100‑1 (MQ=255) aTCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGCCAGCCGGATGCTGAccttatttgttaac > 1:1866544‑M2/1‑86 (MQ=255) cAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTtctc > 1:688986/1‑100 (MQ=255) cAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTtctc < 2:2011798/100‑1 (MQ=255) gCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtt > 2:539688/1‑100 (MQ=255) gCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtt > 2:2339787/1‑100 (MQ=255) aaGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttc < 2:2473849/100‑1 (MQ=255) aaGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttc < 2:1583480/100‑1 (MQ=255) aaGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTAGAAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATACGGCTGGGCGTAAGATTTTTCTCtt > 1:1630410/1‑98 (MQ=255) aaCGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttt < 2:681964/100‑1 (MQ=255) cgcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttc < 2:2294744/100‑1 (MQ=255) cgcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttc < 2:1654158/100‑1 (MQ=255) cgcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttc > 2:2301462/1‑100 (MQ=255) cgcgATGCAAAGTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACTTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttc < 1:2154513/100‑1 (MQ=255) gcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttcc < 1:2053021/100‑1 (MQ=255) gcgATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttcc < 2:2443748/100‑1 (MQ=255) tGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAACATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTttcccttc > 1:1790037/1‑100 (MQ=255) gCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTttcccttcc < 2:2158374/100‑1 (MQ=255) gCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTttcccttcc > 2:332878/1‑100 (MQ=255) aaaTTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTtcccttccct > 1:1794533/1‑100 (MQ=255) aTTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCctct > 2:2492047/1‑100 (MQ=255) aTTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCctct < 2:1654742/100‑1 (MQ=255) ttAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTg < 2:866850/100‑1 (MQ=255) aaCCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGcc < 2:1544803/100‑1 (MQ=255) aaCCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGcc > 2:2083737/1‑100 (MQ=255) cGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACTAATAAGGTCAGCATCGGGCTCGCCTTAGGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCAtt < 1:27789/100‑1 (MQ=255) tgatgaTGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCAtttt < 2:1489405/100‑1 (MQ=255) tgatgTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTtat > 2:1183071/1‑100 (MQ=255) tgTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAATTTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATAtt < 1:104098/100‑1 (MQ=255) gTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCTTCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTatat < 2:2450842/98‑1 (MQ=255) tttCGCAAATTATTTAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTcc > 1:1712556/1‑100 (MQ=255) ttCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCt < 1:1533102/100‑1 (MQ=255) cGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTa < 1:42274/100‑1 (MQ=255) cGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTa < 1:2380551/100‑1 (MQ=255) aaaTTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGt < 2:2216939/100‑1 (MQ=255) aaTTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGTCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTc < 1:821717/100‑1 (MQ=255) attattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCg < 2:2169181/100‑1 (MQ=255) attattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCg < 2:1103714/100‑1 (MQ=255) attattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCg < 2:2553895/100‑1 (MQ=255) attattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCg > 2:1856547/1‑100 (MQ=255) tattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTg < 1:310355/100‑1 (MQ=255) tattGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTg < 1:2268722/100‑1 (MQ=255) tGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGAt > 1:706885/1‑99 (MQ=255) gAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATta < 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tAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTCTATTCCTTATGTCGTGATTATaaaaa > 2:108329/1‑100 (MQ=255) tAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATaaaaa > 2:1342535/1‑100 (MQ=255) tAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATaaaaa < 2:539112/100‑1 (MQ=255) aaCAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgt < 2:1085152‑M2/100‑75 (MQ=255) aaCAAATAAGGTAAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTCTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTTTGTCGTGACTATAAAAAg > 1:1271052/1‑100 (MQ=255) aCAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttccataatttgcgaaacattatcacgtttaatttgcatcgcgttaccttgctgatc < 1:647445‑M2/97‑73 (MQ=255) aCAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAgg < 1:1620657/100‑1 (MQ=255) cAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGa > 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tAAGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataac < 1:1829211‑M2/100‑81 (MQ=255) aaGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataact < 2:859086‑M2/100‑82 (MQ=255) aGGTCAGCATCCGGCTGGccttatttgttaacgttcaataatttgcgaaacatcatcacggttaatttgcatcgcgttaccttgctgatcgtgataactc < 1:741476‑M2/100‑83 (MQ=255) aGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTGCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGc < 1:1789716/100‑1 (MQ=255) ngTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCt > 2:1485453/2‑100 (MQ=255) ggTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCt > 1:1894446/1‑100 (MQ=255) cAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTaag > 1:1571524/1‑98 (MQ=255) cAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATg < 2:1832482/100‑1 (MQ=255) aGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGc < 1:1134432/100‑1 (MQ=255) aGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGc > 2:2121728/1‑100 (MQ=255) aGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGc < 1:329097/100‑1 (MQ=255) gCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCa > 1:2042051/1‑100 (MQ=255) gCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCa > 1:1474550/1‑100 (MQ=255) tCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAata < 1:1224251/100‑1 (MQ=255) tCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAata < 1:1221528/100‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAATATCa > 2:904060/1‑100 (MQ=255) cTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAATATCAcc > 1:1763604/1‑100 (MQ=255) cTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAATATCAcc < 1:1341031/100‑1 (MQ=255) tGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAATATCACCg < 2:2096307/100‑1 (MQ=255) | GGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAATATCACCGT > NC_000913/2971414‑2971611 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |