| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2972673 | 100 (1.090) | 18 (0.200) | 14/172 | NT | 15.0% | coding (1190/1194 nt) | lplT | lysophospholipid transporter |
| ? | NC_000913 | = 2972702 | 107 (1.210) | coding (1161/1194 nt) | lplT | lysophospholipid transporter | |||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
AAGCGAAGACGTATTAGCTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGCCA > NC_000913/2972574‑2972772 | aaGCGAAGACGTATTAGCTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAAT < 2:2311835‑M1/100‑1 (MQ=255) gagAAGGCGTATTAGCTGAAATTAACGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATTCGGCATCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATg < 1:1801894/97‑1 (MQ=255) gAAGACGTATTAGCTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACg < 2:638221/100‑1 (MQ=255) aaGACGTATTAGCTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACgg < 1:1338735/100‑1 (MQ=255) aaGACGTATTAGCTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACgg < 2:2579212/100‑1 (MQ=255) gACGTATTAGCTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCTGTGAAAACCGGCGTTGAATATGAATGACGgcg > 2:1777738/1‑100 (MQ=255) aCGTATTAGCTGACATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAAACGGCGTTAAATATTAATGACGgcgc < 1:876546/100‑1 (MQ=255) gCTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGGTGCCAGAt > 2:2342528/1‑100 (MQ=255) cTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATc < 1:1183818/100‑1 (MQ=255) cTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATc > 1:2088093/1‑100 (MQ=255) cTGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATc > 2:2301338/1‑100 (MQ=255) tGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATcc < 2:110744/100‑1 (MQ=255) tGAAATTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATcc > 2:1743665/1‑100 (MQ=255) aaTTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtggatctggca > 2:1972620‑M1/1‑79 (MQ=255) aaTTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCAGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCcaca > 1:815968/1‑100 (MQ=255) aTTGAAGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAg > 2:1904045/1‑100 (MQ=255) aaGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtggatctggcagcgcc < 2:2184343‑M1/100‑27 (MQ=255) aaGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAgcgc > 1:1197241/1‑99 (MQ=255) aaGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGcc > 2:691892/1‑100 (MQ=255) aaGCGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGcc > 1:2562573/1‑100 (MQ=255) cGGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACTATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATgacggcgctgtggatctggcagcgccgtc < 2:353263‑M1/100‑30 (MQ=255) ggTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtggatctggcagcgccgtca < 1:2091814‑M1/100‑31 (MQ=255) ggTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTa > 1:1648049‑M2/1‑99 (MQ=255) tGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtggatctggcagcgccgtcatt < 2:1767693‑M1/100‑33 (MQ=255) gCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTg < 1:2184754/100‑1 (MQ=255) cATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATgacggcgctgtggatctggcagcgccgtcattaa < 2:275272‑M1/100‑35 (MQ=255) aTCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGcc > 1:2468553/1‑100 (MQ=255) tCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtggatctggcagcgccgtcattaata < 2:1812316‑M1/100‑37 (MQ=255) cAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAg < 2:2374597/100‑1 (MQ=255) aGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtggatctggcagcgccgtcattaatatt < 1:1087172‑M1/100‑39 (MQ=255) ggTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAgcg > 1:1052544/1‑100 (MQ=255) ggTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAgcg > 1:2267904/1‑100 (MQ=255) ggTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAgcg > 1:1052464/1‑100 (MQ=255) ttatccttatccTCCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAACCCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACATCGCCGTTATTGCCAgcgc < 1:1605352/98‑1 (MQ=255) ttATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCTGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtgcatctggcagcgccgtcattaatatt < 1:632741‑M1/96‑39 (MQ=255) tataCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCaaa > 2:2044355/1‑100 (MQ=255) tataCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCaaa > 2:125255/1‑100 (MQ=255) ataCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATaacggcgctgtggatctggcagcgccgtcattaatatttaacgc < 1:404979‑M1/100‑45 (MQ=255) taCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCaaa < 1:1574910/98‑1 (MQ=255) taCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACa < 2:987431/100‑1 (MQ=255) taCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACa > 1:348051/1‑100 (MQ=255) cTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAgc < 2:2413537/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAgc > 2:2167188/1‑100 (MQ=255) cTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAgc < 1:1904035/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCACAATAAGATTAACGCTGGTTAAAATCGGCGATAAATATTAATGTCGGCGCTGCCAGATTCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCACACAg > 1:454634/1‑99 (MQ=255) aTCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCa > 2:850482/1‑100 (MQ=255) aTCCGGCACCATAAGAATAACGCCGGTTAAAACTGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGcaca > 1:711116/1‑100 (MQ=255) ccGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCAcc < 1:450034/100‑1 (MQ=255) ccGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTGAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCAcc > 1:1583563/1‑100 (MQ=255) cGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCg > 2:1440158/1‑100 (MQ=255) cGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCg > 2:1909396/1‑100 (MQ=255) gCACCATAAGATTAACGCCGGTCAAAACCGGCGTTAACTATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGaa < 1:1749483/100‑1 (MQ=255) ccATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgcc < 2:149259/100‑1 (MQ=255) tAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaat < 1:2182264/100‑1 (MQ=255) tAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATGGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaat > 2:514995/1‑100 (MQ=255) aaGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaatg < 2:296744/100‑1 (MQ=255) aGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaatgc < 1:2401419/100‑1 (MQ=255) tttAACGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaatgcca > 2:778925/2‑100 (MQ=255) 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1:1640738/1‑100 (MQ=255) gCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGc < 1:1429421/100‑1 (MQ=255) gCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGCCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCTAATGGGc > 1:833267/1‑100 (MQ=255) ccGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCa > 2:1331895/1‑100 (MQ=255) ccGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCa < 2:2575559/100‑1 (MQ=255) cGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCAc < 1:2536963/100‑1 (MQ=255) ggttttaaCCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACg > 2:403485/7‑100 (MQ=255) ggTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACg > 2:1440115/1‑100 (MQ=255) 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tatTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacctga < 2:1812316‑M2/100‑65 (MQ=255) atTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggggttaatcttatggtaccggggaagtataagctga < 1:1488895‑M2/98‑64 (MQ=255) ttAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTAcc > 2:2000016/1‑100 (MQ=255) tAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCg < 1:1859492/100‑1 (MQ=255) ataacggcgctgtggatctggcagcgccgtcattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacctgatgcac > 2:1903733‑M1/1‑2 (MQ=255) ataacggcgctgtggatctggcagcgccgtcattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacctgatgcac > 2:92465‑M1/1‑2 (MQ=255) aTGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacctgatgcac < 2:2369319‑M2/100‑70 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |