| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2972673 | 100 (1.090) | 18 (0.200) | 14/172 | NT | 15.0% | coding (1190/1194 nt) | lplT | lysophospholipid transporter |
| ? | NC_000913 | = 2972702 | 107 (1.210) | coding (1161/1194 nt) | lplT | lysophospholipid transporter | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGCCAGCGAGTAAATGCCCAGCATCAACAA > NC_000913/2972604‑2972797 | ggTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTa < 1:803641‑M2/100‑2 (MQ=255)ggTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTa > 1:1648049‑M2/1‑99 (MQ=255) gTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTat > 2:92465‑M2/1‑98 (MQ=255) gCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTg < 2:1947100/100‑1 (MQ=255) gCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTg < 1:2184754/100‑1 (MQ=255) gCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTg > 1:1649999/1‑100 (MQ=255) aTCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGcc > 1:2468553/1‑100 (MQ=255) cAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAg < 2:2374597/100‑1 (MQ=255) ggTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAgcg > 1:1052544/1‑100 (MQ=255) ggTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAgcg > 1:1052464/1‑100 (MQ=255) tttATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCa > 2:86689/1‑100 (MQ=255) tataCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCaaa > 2:2044355/1‑100 (MQ=255) tataCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCaaa > 2:125255/1‑100 (MQ=255) taCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCaaa < 1:1574910/98‑1 (MQ=255) taCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACa < 2:987431/100‑1 (MQ=255) taCTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACa > 1:348051/1‑100 (MQ=255) cTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAgc < 1:711498/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAgc > 2:2167188/1‑100 (MQ=255) cTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAgc < 1:1904035/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCACAATAAGATTAACGCTGGTTAAAATCGGCGATAAATATTAATGTCGGCGCTGCCAGATTCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCACACAg > 1:454634/1‑99 (MQ=255) aTCCGGCACCATAAGATTAACGGCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAAGAgcgc < 1:2169047/99‑1 (MQ=255) aTCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCa > 2:850482/1‑100 (MQ=255) ccGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCAcc < 1:450034/100‑1 (MQ=255) ccGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTGAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCAcc > 1:1583563/1‑100 (MQ=255) cGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCg > 2:1440158/1‑100 (MQ=255) cGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCg > 2:1909396/1‑100 (MQ=255) gCACCATAAGATTAACGCCGGTCAAAACCGGCGTTAACTATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGaa < 1:1749483/100‑1 (MQ=255) ccATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgcc < 2:149259/100‑1 (MQ=255) tAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATGGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaat > 2:514995/1‑100 (MQ=255) aatatttAACGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaat > 2:125825/6‑100 (MQ=38) atatttAACGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaa > 1:49936/5‑98 (MQ=255) atatttAACGCCGGTTTTAAACGGCGTTAAATATTAATGACCGCGCTGCCAGATCCACAGCACCGTTATTGCCAGCGCACCCAGCGCACCGAAgccaatg > 1:1585563/5‑100 (MQ=37) aaGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaatg < 2:296744/100‑1 (MQ=255) aGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaatgc < 1:2401419/100‑1 (MQ=255) gATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAACACACCGAAgccaatgcc > 1:1269505/1‑100 (MQ=255) tAACGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAgccaatgccaat > 2:1418650/1‑100 (MQ=255) aaCGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGccaatgccaatg > 2:297362/1‑100 (MQ=255) aaCGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGccaatgccaatg > 1:182088/1‑100 (MQ=255) aggCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATgg > 2:1746546/3‑100 (MQ=255) aCGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATgg > 2:878466/1‑100 (MQ=255) aCGCCGGTTTTAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATgg > 2:62682/1‑100 (MQ=255) aCGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATgg > 1:1356085/1‑100 (MQ=255) aCGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATgg > 1:1640738/1‑100 (MQ=255) gCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGc < 1:1429421/100‑1 (MQ=255) ccGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCa > 2:1331895/1‑100 (MQ=255) ccGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCa < 2:2575559/100‑1 (MQ=255) ggttttaaCCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACg > 2:403485/7‑100 (MQ=255) ttAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGAc > 2:181672/1‑100 (MQ=255) tAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGAcc > 2:1402559/1‑100 (MQ=255) aaaCCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCCCGACCgg > 1:257751/1‑100 (MQ=255) aaCCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCggg < 1:25401/100‑1 (MQ=255) cGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATg > 2:1788562/1‑100 (MQ=255) ggCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGc > 2:1481847/1‑100 (MQ=255) gCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatgtgccggataagtata < 1:2134589‑M2/100‑57 (MQ=255) gCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGcc < 2:1011852/100‑1 (MQ=255) gCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGcc < 1:2330920/100‑1 (MQ=255) gTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGcc > 1:687019/1‑98 (MQ=255) gTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGCTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTa < 1:2250244/100‑1 (MQ=255) ctaAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaa > 1:2374662‑M2/2‑41 (MQ=255) tAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATc < 2:200644/100‑1 (MQ=255) aaaTATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaaag < 2:2374677‑M2/100‑62 (MQ=255) aaaTATGAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATGGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCa < 1:1529948/100‑1 (MQ=255) aaTATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacct < 1:1087172‑M2/100‑63 (MQ=255) atatTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCAtt > 1:746924/1‑100 (MQ=255) tatTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacctga < 2:1812316‑M2/100‑65 (MQ=255) atTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggggttaatcttatggtaccggggaagtataagctga < 1:1488895‑M2/98‑64 (MQ=255) ttAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTAcc > 2:2000016/1‑100 (MQ=255) tAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCg < 1:1859492/100‑1 (MQ=255) aaTGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacctgatgca < 2:1767693‑M2/100‑69 (MQ=255) aaTGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTAcccc > 1:868957/1‑98 (MQ=255) aaTGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGc > 1:164259/1‑100 (MQ=255) aTGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTattaatatttaacgccggttttaaccggcgttaatcttatggtgccggataagtataaacctgatgcac < 2:2369319‑M2/100‑70 (MQ=255) aTGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGcc < 2:658393/100‑1 (MQ=255) aTGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGcc 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1:1229876/100‑1 (MQ=255) aGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGCCAGCGAGTAAATGCCCAGCATca < 1:654424/100‑1 (MQ=255) cgcCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGCCAGCGAGTAAATGCCCAGCATcaac > 2:1517372/1‑100 (MQ=255) gcCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGCCAGCGAGTAAATGCCCAGCATcaaca < 2:2468570/100‑1 (MQ=255) ccGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGCCAGCGAGTAAATGCCCAGCATccac > 1:1207551/1‑98 (MQ=255) | GGTGCATCAGGTTTATACTTATCCGGCACCATAAGATTAACGCCGGTTAAAACCGGCGTTAAATATTAATGACGGCGCTGCCAGATCCACAGCGCCGTTATTGCCAGCGCAAACAGCGCACCGAAGCCAATGCCAATGGGCACGACCGGGATGCCTATCATTACCGCCAGCGAGTAAATGCCCAGCATCAACAA > NC_000913/2972604‑2972797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |