| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2597686 = | NA (NA) | 8 (0.080) | 5/166 | NT | NA | noncoding (14/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 2597714 = | NA (NA) | noncoding (42/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 | atccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcatgaaaacgggattttagcggtaattctgacgaaatttgtttgtcggacggagtt < 1:571957‑M1/1‑1 (MQ=255)atccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtt < 1:2878065‑M1/1‑1 (MQ=255)atccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtt < 1:1520528‑M1/1‑1 (MQ=255) tccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTc > 2:2515213‑M1/99‑100 (MQ=255) tACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTc < 1:1410069/100‑1 (MQ=255) ccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCg > 1:863823‑M1/98‑100 (MQ=255) ccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCg > 2:30933‑M1/98‑100 (MQ=255) cggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCgg > 1:296784‑M1/97‑100 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCgg > 1:2361518/1‑100 (MQ=255) gATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgc > 2:238169/1‑100 (MQ=255) gATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgc > 2:2943255/1‑100 (MQ=255) tACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcg > 1:1156525/1‑99 (MQ=255) cAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggcg < 2:311221/100‑1 (MQ=255) tttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATACGGCGt > 1:1209666‑M1/88‑100 (MQ=255) aCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGta < 1:2022998/100‑2 (MQ=255) tCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGaa < 1:993419/100‑1 (MQ=255) gcttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACg > 1:30352/1‑99 (MQ=255) gcttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc > 1:723146/1‑100 (MQ=255) gcttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc > 1:2270248/1‑100 (MQ=255) gcttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc > 2:1990702/1‑100 (MQ=255) gcttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGGCGGATGCAGCGTGAACg < 2:2610152/99‑1 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcc > 1:1326707/1‑100 (MQ=255) ttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTCACGTTTTACAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt < 2:137488/100‑1 (MQ=255) gcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa < 2:1531136/100‑1 (MQ=255) tttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc < 2:518957/100‑1 (MQ=255) tttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGGGAATTAACGTTTTAAAATTCTTTGCTGTCTGGGGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc > 1:2488372/1‑93 (MQ=39) acgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 1:2335563‑M1/75‑100 (MQ=255) ttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCg > 2:948396/1‑100 (MQ=255) ttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCg < 1:446925/100‑1 (MQ=255) tGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGa < 2:2054997/100‑1 (MQ=255) tGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGa > 2:2032130/1‑100 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc < 2:973252/100‑1 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc > 2:2841192/1‑100 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTATGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGa > 1:2649962/1‑98 (MQ=255) aaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc > 2:2224970‑M1/71‑100 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGACTTAACGCTTTACAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt > 1:1282999/1‑100 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 2:1770241/100‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt > 1:1933550/1‑100 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 2:2328324/100‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 1:2183685/100‑1 (MQ=255) tCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTa < 2:302873/100‑1 (MQ=255) tCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTa > 1:2246012/1‑100 (MQ=255) tCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTGTGGCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGACt > 1:2859521/1‑99 (MQ=39) acgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTa > 1:2602945‑M1/69‑100 (MQ=255) cgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTAc > 1:2039543‑M1/68‑100 (MQ=255) tttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACg > 1:571857/1‑100 (MQ=255) tttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACg > 2:2197093/1‑100 (MQ=255) ttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGt > 1:2248293/1‑100 (MQ=255) tATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTc > 1:2805332/1‑100 (MQ=255) tCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCg > 1:892506/1‑100 (MQ=255) tCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCg < 2:348806/100‑1 (MQ=255) tCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCg < 1:3000437/100‑1 (MQ=255) cACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGa > 1:1025124/1‑100 (MQ=255) aCTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGac > 2:162420/1‑100 (MQ=255) cTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGaca > 2:2776402/1‑100 (MQ=255) cTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaac < 2:411327/100‑1 (MQ=255) cTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCAGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACATCCGacaaac > 1:2164493/1‑100 (MQ=255) gggTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAGCTACGTCCGacaaacaa > 1:37098/1‑100 (MQ=255) gggTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaacaa > 2:259879/1‑100 (MQ=255) ggTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGAcaaacaaa > 1:1655497/1‑100 (MQ=255) gtgtGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAAt < 1:746533/100‑1 (MQ=255) gtgtGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAAt > 2:1984159/1‑100 (MQ=255) gAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCg > 1:2741848/1‑100 (MQ=255) gAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCg > 2:300179/1‑100 (MQ=255) gAATTAACGTTTTAAAATCTTTTCGTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCTGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCg < 1:366051/100‑1 (MQ=255) 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1:2271415/100‑1 (MQ=255) tGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTcc < 2:1496335/100‑1 (MQ=255) tGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTcc < 2:1420559/100‑1 (MQ=255) ggTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCt < 2:1902155/100‑1 (MQ=255) ggTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCt < 2:829358/100‑1 (MQ=255) gtgtGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTg < 2:1326713/100‑1 (MQ=255) tgtgCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACACACAAATTTCGCGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCttc < 2:2065184/100‑3 (MQ=255) gtgCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCa > 2:347336/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGa > 1:433125/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCACGTTTTCCTGCAGa > 2:1281496/1‑100 (MQ=255) cGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACg > 1:501683/1‑100 (MQ=255) tttGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGt > 2:1833594/1‑100 (MQ=255) TCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGc > 1:1400996‑M1/1‑100 (MQ=255) | TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |