| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3485379 | NA (NA) | 9 (0.100) | 6/162 | NT | NA | noncoding (8/22 nt) | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3485385 | NA (NA) | noncoding (14/22 nt) | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GGCAAAATGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAATATTCACCGCTTTTTCCAGCATCAACGCCACTG > NC_000913/3485282‑3485478 | ggcAAAATGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAGCTCTGCTATTACGCCGGATaaa > 2:2004641/1‑100 (MQ=255) gcAAAATGGGTCTGGCATTGGAATGAATTATGCTGCAGGTGGTGCAACGATTGATGGAAGGTTAGAACATCTGGAAACTGTGCTATTAGGCGGGATaa > 1:1970203/1‑98 (MQ=255) gcAAAATGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATaaaa > 2:1943773/1‑100 (MQ=255) cAAAATGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAAt > 2:192647/1‑100 (MQ=255) cAAAATGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAAt < 1:1714992/100‑1 (MQ=255) cAAAATGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAAt < 1:2510509/100‑1 (MQ=255) aaaTGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATAc < 1:1507744/100‑1 (MQ=255) gggTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatc > 2:1651088‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTCTGGGAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatcc < 2:1522175‑M2/100‑6 (MQ=255) ggTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatcc < 1:2265865‑M2/100‑6 (MQ=255) gTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccg < 2:1265249‑M2/100‑7 (MQ=255) gTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccg < 2:370780‑M2/100‑7 (MQ=255) tCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccgg > 2:2402276‑M2/1‑93 (MQ=255) cTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAgtattttatccggc < 1:2903973‑M1/100‑15 (MQ=255) cTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAgtattttatccggc < 1:228279‑M1/100‑15 (MQ=255) tGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCt > 2:1976893/1‑100 (MQ=255) tGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCt > 1:2578028/1‑100 (MQ=255) cttccgatctattaattatgctgccgctGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAgtattttatccggcg < 2:907637‑M1/90‑16 (MQ=255) ggCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCtt > 1:1503360/1‑100 (MQ=255) gtaacggAATTAATTATGCTGCCGCCGCTGCAACGATTGACCGCAGGAACGAAAGTCGCGGGGCTTTGTTACTACGCCGGCTAACGTTCTAGCCGGCTTc < 1:2424830/95‑1 (MQ=255) gCAATGGAATTTATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgt > 2:1899765‑M2/1‑89 (MQ=255) aTGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATTGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgtaat > 1:2474675‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgtaata > 1:1212061‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTcaca < 2:1427981/100‑1 (MQ=255) aTGGAATTAAGTATGCTGCCGCGGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTc < 1:2098185/97‑1 (MQ=255) tagaaTTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGTGAGGAAAGAAAATCGAGCAACTCTGCTATTACGCCGGATAgtattttatccggagtaatag < 1:157085‑M1/98‑22 (MQ=255) tGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACaa > 2:1204236/1‑100 (MQ=255) gAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACg > 2:2655667/1‑100 (MQ=255) aattaattATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACgg > 1:1729499/1‑100 (MQ=255) aattaattATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGATTCACAAcag < 1:1036736/100‑3 (MQ=255) aattaattATGCAGACGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgtaatagcag > 1:1974662‑M2/1‑82 (MQ=255) attaattaTGCTGCTGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAGAGAAAGTCGGGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATGCGGCTTCACAACgg > 1:326500/1‑99 (MQ=255) attaTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAg > 1:2382656/1‑100 (MQ=255) ttaTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTAGCCGGCTTCACAACGGGATAg < 2:514383/99‑1 (MQ=255) taTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGtt > 2:892499/1‑100 (MQ=255) taTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGtn < 2:1043923/100‑2 (MQ=255) tgctgcCGCTGGTGCAACGAGTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATACAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGATaa > 1:893537/1‑100 (MQ=255) gcCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCa > 2:731919/1‑100 (MQ=255) cGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGCTAGTTAAGTCAc > 1:1156113/1‑99 (MQ=255) gCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgc < 1:1644396/100‑1 (MQ=255) gCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgc > 1:1513544/1‑100 (MQ=255) cTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgcg < 2:1368416/100‑1 (MQ=255) cTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgcg > 1:1063846/1‑100 (MQ=255) tGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCgg < 2:1503363/100‑1 (MQ=255) ggTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGc > 1:1477227/1‑100 (MQ=255) ggTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGc > 1:1146840/1‑100 (MQ=255) tGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCaa > 2:2226668/1‑100 (MQ=255) cAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAAcc > 1:685298/1‑100 (MQ=255) aTTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTc < 2:1809223/100‑1 (MQ=255) ttGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCa < 1:2051956/100‑1 (MQ=255) gATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATa < 1:211662/100‑1 (MQ=255) gATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATa < 2:2830997/100‑1 (MQ=255) gATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATa > 1:2202004/1‑100 (MQ=255) tGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACg > 1:1973114/1‑100 (MQ=255) gaaggaaAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACgag > 2:2447386/1‑100 (MQ=255) gaaggaaAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACgag > 1:482903/1‑100 (MQ=255) aaggaaAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACgagt > 1:1533634/1‑100 (MQ=255) aggaaAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACgagtg < 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agaaaATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTaa > 2:1128201/1‑100 (MQ=255) aaaaTCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAata > 2:1242861/1‑100 (MQ=255) aaaTCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAatat > 2:1615607/1‑100 (MQ=255) aTCGAGTAACTCTGCTATTCCGCCGGATAAAATACTATCCAGCTTCACAACGGGCTAGATAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACgagtgagt > 1:1103962/1‑93 (MQ=255) gAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTTACGCGGCAACAACTTCATACGAGTGAGTAATATTCa > 1:2694317/1‑98 (MQ=255) gAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAATATTCAcc > 1:19899/1‑100 (MQ=255) cttccgatctcgccggataaaATACtatccggcgtaatagcagagttactcgattttctttccttccatcaatcgttgcaccagcggcagcataattaat > 1:907635‑M2/11‑25 (MQ=255) ctGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAATATTCACCGCTTTTTc > 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2:1822837‑M1/1‑8 (MQ=255) gCCGGATAgtattttatccggcgtaatagcagagttactcgattttctttccttccatcaatcgttgcaccagcggcagcataattaattccattgccag < 2:377939‑M1/100‑93 (MQ=255) gCCGGATAGTATTTTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAATATTCACCGCTTTTTCCAGCATCAAc > 2:363526/1‑100 (MQ=255) gCCGGATAAAATACtatccggcgtaatagcagagttactcgattttctttccttccatcaatcgttgcaccagcggcagcataattaattccattgccag < 2:343861‑M2/100‑87 (MQ=255) gCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAATATTCACCGCTTTTTCCAGCATCAAc < 1:2869642/100‑1 (MQ=255) cGGATAgtattttatccggcgtaatagcagagttactcgattttctttccttccatcaatcgttgcaccagcggcagcataattaattccattgccagac > 1:1943765‑M1/1‑6 (MQ=255) cGGATAgtattttatccggcgtaatagcagagttactcgattttctttccttccatcaatcgttgcaccagcggcagcataattaattccattgccagac < 2:1265249‑M1/100‑95 (MQ=255) cGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAATATTCACCGCTTTTTCCAGCATCAACGc < 1:184991/100‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |