| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3485379 | NA (NA) | 9 (0.100) | 6/162 | NT | NA | noncoding (8/22 nt) | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3485385 | NA (NA) | noncoding (14/22 nt) | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP246 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AAATGGGTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCAACCACTTCATACGAGTGAGTAATATTCACCGCTTTTTCCAGCATCAACGCCACTGAACAA > NC_000913/3485286‑3485483 | gggTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatc > 2:1651088‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTCTGGGAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatcc < 2:1522175‑M2/100‑6 (MQ=255) ggTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatcc < 1:2265865‑M2/100‑6 (MQ=255) gTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccg > 1:1943765‑M2/1‑94 (MQ=255) gTCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccg < 2:370780‑M2/100‑7 (MQ=255) tCTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccgg > 2:2402276‑M2/1‑93 (MQ=255) cTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccggc > 2:1822837‑M2/1‑92 (MQ=255) cTGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACtatccggc < 2:377939‑M2/100‑9 (MQ=255) tGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCt > 1:2578028/1‑100 (MQ=255) tGGCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCt > 2:1976893/1‑100 (MQ=255) ggCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCtt > 1:1503360/1‑100 (MQ=255) gtaacggAATTAATTATGCTGCCGCCGCTGCAACGATTGACCGCAGGAACGAAAGTCGCGGGGCTTTGTTACTACGCCGGCTAACGTTCTAGCCGGCTTc < 1:2424830/95‑1 (MQ=255) gCAATGGAATTTATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgt > 2:1899765‑M2/1‑89 (MQ=255) gCAATGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTc < 2:1351949/100‑1 (MQ=255) aTGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATTGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgtaat > 1:2474675‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgtaata > 1:1212061‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTcaca < 2:1427981/100‑1 (MQ=255) aTGGAATTAAGTATGCTGCCGCGGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTc < 1:2098185/97‑1 (MQ=255) tGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgtaatag > 1:1466756‑M2/1‑85 (MQ=255) tGGAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACaa > 2:1204236/1‑100 (MQ=255) gAATTAATTATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACg > 2:2655667/1‑100 (MQ=255) aattaattATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACgg > 1:1729499/1‑100 (MQ=255) aattaattATGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGATTCACAAcag < 1:1036736/100‑3 (MQ=255) aattaattATGCAGACGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAGTATTTtatccggcgtaatagcag > 1:1974662‑M2/1‑82 (MQ=255) taattaTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGAt < 2:675733/100‑1 (MQ=255) attaTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAg < 2:2498859/100‑1 (MQ=255) ttaTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGt < 1:2806359/100‑1 (MQ=255) ttaTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTAGCCGGCTTCACAACGGGATAg < 2:514383/99‑1 (MQ=255) taTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGtt > 2:892499/1‑100 (MQ=255) taTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGtn < 2:1043923/100‑2 (MQ=255) aTGCTGCCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTa > 2:1906431/1‑100 (MQ=255) tgctgcCGCTGGTGCAACGAGTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATACAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGATaa > 1:893537/1‑100 (MQ=255) gctgcCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAg > 1:1280524/1‑100 (MQ=255) tgcCGCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGAATAGTTAAGTc < 1:1522171/100‑1 (MQ=255) gCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgc < 1:1644396/100‑1 (MQ=255) gCTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgc > 1:1513544/1‑100 (MQ=255) cTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAGCTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgcg < 1:2004634/100‑1 (MQ=255) cTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgcg < 2:1368416/100‑1 (MQ=255) cTGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCAcgcg > 1:1063846/1‑100 (MQ=255) tGGTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCgg < 2:1503363/100‑1 (MQ=255) ggTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGc > 1:1146840/1‑100 (MQ=255) ggTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGc > 1:1477227/1‑100 (MQ=255) gTGCAACGATTGATGGAAGGAAAGAAAATCGAGTAACTCTGCTATTACGCCGGATAAAATACTATCCGGCTTCACAACGGGATAGTTAAGTCACGCGGCa < 1:2564179/100‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |