| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1165696 = | NA (NA) | 6 (0.070) | 5/156 | NT | NA | intergenic (+11/‑389) | ycfP/ndh | putative UPF0227 family esterase/respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase |
| ? | NC_000913 | 1165728 = | NA (NA) | intergenic (+43/‑357) | ycfP/ndh | putative UPF0227 family esterase/respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCA > NC_000913/1165629‑1165826 | tCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCt > 2:2083185/1‑100 (MQ=255) cAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTc > 1:634093/1‑100 (MQ=255) cAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTc > 1:1156074/1‑100 (MQ=255) cAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTc > 2:571822/1‑100 (MQ=255) caggcattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTcc > 1:2602099‑M1/65‑100 (MQ=255) aaGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTcc > 2:2547723/1‑100 (MQ=255) aaGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTcc > 2:801321/1‑100 (MQ=255) aaGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTcc < 1:1521029/100‑1 (MQ=255) cattgatgctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAAt > 2:1367738‑M1/61‑100 (MQ=255) atatCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAAt > 2:2001120/1‑100 (MQ=255) tatCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAAtt < 1:88716/100‑1 (MQ=255) tctcCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCt > 2:2563699/1‑100 (MQ=255) tctcCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCt < 2:2551398/100‑1 (MQ=255) tctcCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCt > 2:1061398/1‑100 (MQ=255) tctcCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCt > 2:1914032/1‑100 (MQ=255) ctcCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCtg < 2:2372467/100‑1 (MQ=255) ctcCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCtg < 2:1916571/100‑1 (MQ=255) tcCTCGCAGTTACAGCGCATTAAAGCGTTAAAACCCCTCGGCTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAATCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCtgt < 2:1578986/100‑1 (MQ=255) gctcgactgtcggatgcggcgtggacgccttatccgacccacagaattcggagCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTgg > 1:2394820‑M1/54‑100 (MQ=255) ccGCATTTACAGCGCATTAAAGCGGTCAAAACCCTAGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTgg < 2:2278132/99‑1 (MQ=255) cATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCg > 2:165002/1‑100 (MQ=255) tttACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGa < 1:965591/100‑1 (MQ=255) tACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATa < 1:1480824/100‑1 (MQ=255) aCAGCGCATTAAAGCGTTGAAAACCCTTGGGCAAATGCCCTCGTGGCATCAGGTAACCTTGCGGGTACCTGATGCGCGCCGAATTCtg < 2:1693102/88‑1 (MQ=255) aCAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATaa > 2:2158769/1‑100 (MQ=255) aGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAgg > 2:853745/1‑100 (MQ=255) gcgcATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGc > 2:1222938/1‑100 (MQ=255) gcATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGt > 2:1332231/1‑100 (MQ=255) cATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTc > 2:1258437/1‑100 (MQ=255) cATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGCCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTc > 2:1415635/1‑100 (MQ=255) aTTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCATGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTcc < 2:567802/100‑1 (MQ=255) tAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCTCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAc < 1:687921/100‑1 (MQ=255) aaaGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcg > 1:1241071/1‑100 (MQ=255) aaaGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCAAcg > 2:1873501/1‑100 (MQ=255) aaGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgc > 2:1311005/1‑100 (MQ=255) aaGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgc > 1:2575760/1‑100 (MQ=255) aaGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgc > 1:1479515/1‑100 (MQ=255) aGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCAGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgc > 1:2092083/1‑99 (MQ=255) gCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgccg < 2:2349294/100‑1 (MQ=255) gCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgccg < 2:970550/100‑1 (MQ=255) cGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgccgc < 1:1249248/100‑1 (MQ=255) cGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCAcgccgc > 1:2411426/1‑100 (MQ=255) ttCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGATAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCAt > 1:1875342/1‑100 (MQ=255) tCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATc > 1:1104087/1‑100 (MQ=255) cAAAACCCTCGTGTAAATGCCCTCGTCTTATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATcc < 1:390987/100‑1 (MQ=255) cAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATcc < 2:1531442/100‑1 (MQ=255) cccTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAg > 2:2133967/1‑100 (MQ=255) cccTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATACTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAg > 1:2113890/1‑100 (MQ=255) ccTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGt > 1:2307358/1‑100 (MQ=255) cTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTc > 2:341964/1‑100 (MQ=255) cGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGa > 1:872440/1‑100 (MQ=255) gggTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAg < 2:972837/100‑1 (MQ=255) gggTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAg > 1:2062255/1‑100 (MQ=255) ggTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTATGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGc > 1:89816/1‑100 (MQ=255) ccacagaattcggagcgcatcaggtaccggcaaggttacctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGc > 1:2394820‑M2/48‑100 (MQ=255) tAAATGGCCTCGTCTCATCTGTTAACGTTGCTGTTACCTGATGCGCTTCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGc < 1:2141202/98‑1 (MQ=37) aaaTGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATc < 2:1950005/100‑1 (MQ=255) tGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAAt > 2:1684154/1‑100 (MQ=255) attcggagcgcatcaggtaccggcaaggttacctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATg > 2:1367738‑M2/41‑100 (MQ=255) tcgtcgCATCAGTTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTACGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGcc < 1:277999/98‑1 (MQ=255) ggagcgcatcaggtaccggcaaggttacctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTg > 1:2602099‑M2/37‑100 (MQ=255) gtcgCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGAt < 1:1125935/100‑1 (MQ=255) gtcgCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGACGACCACGCCGCATCCGACAGTAGAGCATCAATGCCTGAt > 1:1109699/1‑100 (MQ=255) tcgCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATg < 2:344779/100‑1 (MQ=255) tcgCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCAGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATg < 2:1688568/100‑1 (MQ=255) gcatcaggtaccggcaaggttacctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATgcg > 1:908437‑M2/32‑100 (MQ=255) gcatcaggtaccggcaaggttacctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATgcg > 1:1004106‑M2/32‑100 (MQ=255) GCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATgcg > 2:2092060‑M1/1‑100 (MQ=255) CAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGcttc < 2:2304153‑M1/100‑1 (MQ=255) AGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGcttct < 1:1995135‑M1/100‑1 (MQ=255) AGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGcttct < 2:1787078‑M1/100‑1 (MQ=255) GGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGcttctt > 1:1914592‑M1/1‑100 (MQ=255) ccTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAg < 2:2307330/100‑1 (MQ=255) ccTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAg > 1:1004623/1‑100 (MQ=255) ccTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAg > 1:2421630/1‑100 (MQ=255) ccTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAg < 1:747333/100‑1 (MQ=255) ttgctgctaccggatgcgATCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACTCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCaggn < 2:710642‑M2/82‑2 (MQ=255) gCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATCACTGATGCGCTTCTTATCAGGCCt > 1:577208/1‑100 (MQ=255) ccGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTa > 1:1971436/1‑100 (MQ=255) cGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTAc < 2:353778/100‑1 (MQ=255) ggTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTAcc < 1:1609298/100‑1 (MQ=255) gTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCg < 1:2059535/100‑1 (MQ=255) gTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCg < 2:2575730/100‑1 (MQ=255) tacctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGa > 2:1132646‑M2/12‑100 (MQ=255) tACCTGTTGCGTTCCGAATTCTGTGTGTCTGTTAATGTGTCCATGCCGCAGCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGa < 1:1078938/100‑1 (MQ=255) cctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAAc < 1:361194‑M2/91‑1 (MQ=255) cctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAAc < 2:1286441‑M2/91‑1 (MQ=255) ctgatgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACg < 1:2547753‑M2/92‑1 (MQ=255) atgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGccc < 1:461069‑M2/95‑1 (MQ=255) tgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAAcgcctt < 1:1787095‑M2/96‑3 (MQ=255) tgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCt > 1:2472802‑M2/5‑100 (MQ=255) tgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCt < 2:1156064‑M2/96‑1 (MQ=255) tgcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCt > 1:1377855‑M2/5‑100 (MQ=255) gcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTg > 2:2063934‑M2/4‑100 (MQ=255) gcgCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTg < 1:569702‑M2/97‑1 (MQ=255) ngCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCNAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCACTg > 1:1057566‑M2/3‑99 (MQ=255) gcTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAAGCGTCCACGCCGCATACGACAGTCGAGCAACAATGCCTGATGCGCTTCTTATCATGCCTACCGAACGACCTGCa > 2:1431550/1‑100 (MQ=255) gCTCCGAATTCTGTGTGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCa > 2:1750212‑M2/2‑100 (MQ=255) gCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCa < 2:2651391‑M2/99‑1 (MQ=255) gCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCa > 2:134553‑M2/2‑100 (MQ=255) | TTCAAGAATATCTCCCCGCATTTACAGCGCATTAAAGCGTTCAAAACCCTCGGGTAAATGCCCTCGTCGCATCAGGTAACCTTGCCGGTACCTGATGCGCTCCGAATTCTGTGGGTCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGACAGTCGAGCATCAATGCCTGATGCGCTTCTTATCAGGCCTACCGAACGCCCTGCA > NC_000913/1165629‑1165826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |