| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4449524 | 132 (1.030) | 6 (0.050) | 4/168 | NT | 4.6% | coding (129/531 nt) | ppa | inorganic pyrophosphatase |
| ? | NC_000913 | = 4449539 | 127 (1.050) | coding (114/531 nt) | ppa | inorganic pyrophosphatase | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
AGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGCAGATCT > NC_000913/4449425‑4449623 | aGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGG < 1:2580413‑M1/100‑1 (MQ=255) gTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGt > 2:945384/1‑100 (MQ=255) gTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGt > 1:3138078/1‑100 (MQ=255) gTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGt < 1:1689617/100‑1 (MQ=255) gTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGAGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGt > 1:1518549/1‑100 (MQ=255) tGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCa > 1:3049121/1‑100 (MQ=255) gACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACg < 1:2862469/100‑1 (MQ=255) ccAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGaa > 2:2076616/1‑100 (MQ=255) ccAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGaa > 2:343161/1‑100 (MQ=255) ccAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGaa > 2:447679/1‑100 (MQ=255) aGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACa > 1:1470598/1‑100 (MQ=255) aGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACa < 1:121337/100‑1 (MQ=255) gTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAg < 2:1143642/100‑1 (MQ=255) aCGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTg < 1:3326951/100‑1 (MQ=255) aCGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACAGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTg > 2:1343976/1‑100 (MQ=255) cGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGCACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTgc > 1:327103/1‑100 (MQ=255) cGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTgc > 2:1843069/1‑100 (MQ=255) cGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTgc > 2:2518318/1‑100 (MQ=255) cAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGc < 2:2490147‑M2/99‑2 (MQ=255) aCCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGccgc > 2:1014782‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGcgcactgttcgttgaccgcttca < 1:2982769‑M1/100‑24 (MQ=255) ggTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGctctc < 2:3171677/100‑1 (MQ=255) ggTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGctctc > 1:458834/1‑100 (MQ=255) gTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGcgcactgttcgttgaccgcttcat < 1:279333‑M1/100‑25 (MQ=255) tCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGcgcactgttcgttgaccgcttcatg < 2:3004891‑M1/100‑26 (MQ=255) tCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGcgcactgttcgttgaccgcttcatg < 2:602824‑M1/100‑26 (MQ=255) tCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCtt < 1:670250/100‑1 (MQ=255) tCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCtt > 2:1703170/1‑100 (MQ=255) aCCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTg > 1:820677/1‑100 (MQ=255) aCCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTg > 2:2040420/1‑100 (MQ=255) ccGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGt < 1:748253/100‑1 (MQ=255) tCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGa > 1:2309963/1‑100 (MQ=255) ccAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGAt < 2:2525989/100‑1 (MQ=255) cAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGAtt > 1:2665476/1‑100 (MQ=255) cAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGAtt > 1:438922/1‑100 (MQ=255) gagaCAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTc > 2:2931399/1‑100 (MQ=255) agaCAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCg < 2:313557/100‑1 (MQ=255) gaCAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGt > 1:2461026/1‑100 (MQ=255) gggTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTAttt > 1:3091126/1‑100 (MQ=255) gggTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTAtt > 1:3456764/1‑99 (MQ=255) gtgtGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGa < 1:2266816/100‑1 (MQ=255) gtgGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATc > 1:1333030/1‑100 (MQ=255) gtgGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATc < 1:1327279/100‑1 (MQ=255) tgGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCg < 2:2629739/100‑1 (MQ=255) tgGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCg < 1:2317399/100‑1 (MQ=255) tgGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCg < 2:2429092/100‑1 (MQ=255) tgGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCg < 2:1091171/100‑1 (MQ=255) ggTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCgg > 2:488889/1‑100 (MQ=255) ggTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCgg < 1:544999/100‑1 (MQ=255) ttGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGAt > 2:163217/1‑100 (MQ=255) gATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCt > 1:8018/1‑100 (MQ=255) gTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCg < 1:3124499/100‑1 (MQ=255) gTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCg < 2:246025/100‑1 (MQ=255) aaCCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGACAACGAACAGTGCGCCGCGCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCgct > 1:2903528/1‑98 (MQ=255) tAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCg < 1:2470589/100‑1 (MQ=255) gTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCggg < 2:2466041/100‑1 (MQ=255) gTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCggg < 2:3389654/100‑1 (MQ=255) ttGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGa < 2:2691891/100‑1 (MQ=255) ttGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGa < 2:317071/100‑1 (MQ=255) tGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGAt > 2:1244581/1‑100 (MQ=255) aTGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGAtctc < 2:165678/100‑1 (MQ=255) aTGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGAtctc < 2:2869096/100‑1 (MQ=255) gATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAAt > 2:2245609/1‑100 (MQ=255) gATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAAt < 2:1764187/100‑1 (MQ=255) gATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAAt < 2:2837738/100‑1 (MQ=255) aTAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATa > 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1:3199517/1‑100 (MQ=255) ggACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCt > 1:2482992/1‑100 (MQ=255) tctaTGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGAGCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTc < 1:3353368/95‑1 (MQ=255) aCATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGccgcttcatgtccaccgcgatgttctatccatgcaactacggttacatcaaccacaccctgtctctggacggtg < 1:1175479‑M2/100‑75 (MQ=255) cATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGccgcttcatgtccaccgcgatgttctatccatgcaactacggttacatcaaccacaccctgtctctggacggtga < 2:602824‑M2/100‑76 (MQ=255) cATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGccgcttcatgtccaccgcgatgttctatccatgcaactacggttacatcaaccacaccctgtctctggacggtga < 2:965600‑M2/100‑76 (MQ=255) tGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGccgcttcatgtccaccgcgatgttctatccatgcaactacggttacatcaaccacaccctgtctctggacggtgacc < 1:2982769‑M2/100‑78 (MQ=255) tGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCgg > 2:1120139/1‑100 (MQ=255) tGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCgg > 2:683962/1‑100 (MQ=255) tGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATGTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTcctg > 1:2773893/1‑98 (MQ=255) gAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGc < 2:1470611/100‑1 (MQ=255) gAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGc > 1:1143080/1‑100 (MQ=255) gAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATATGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGc > 1:2210505/1‑100 (MQ=255) aaGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGCa > 2:3229082/1‑100 (MQ=255) cggcgcactgttcgttgaccgcttcatgtccaccgcgatgttctatccatgcaactacggttacatcaaccacaccctgtctctggacggtgacccggtt < 1:1104687‑M1/100‑98 (MQ=255) ggcgcactgttcgttgaccgcttcatgtccaccgcgatgttctatccatgcaactacggttacatcaaccacaccctgtctctggacggtgacccggttg > 2:147041‑M1/1‑2 (MQ=255) ggTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGCAGATc > 2:1958830/1‑100 (MQ=255) ggTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGCAGATc < 2:3199541/100‑1 (MQ=255) gcgcattgttcgttgaccgcttcatgtccaccgcgatgttctatccatgcaactacggttacatcaaccacaccctgtctctggacggtgacccggttg < 1:1283250‑M1/99‑99 (MQ=255) gTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGCAGATCt < 2:2483011/100‑1 (MQ=255) | AGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGCAGATCT > NC_000913/4449425‑4449623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |