| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 884917 | 83 (0.800) | 17 (0.180) | 10/160 | NT | 17.3% | intergenic (+12/+29) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 884930 | 88 (0.940) | intergenic (+25/+16) | mdfA/ybjH | multidrug efflux system protein/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
CTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACA > NC_000913/884818‑885015 | ctTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGA > 1:321567‑M1/1‑100 (MQ=255) ttCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAc < 1:232444/100‑1 (MQ=255) cAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTg > 1:566369/1‑100 (MQ=255) ccTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCtt < 2:136600/100‑1 (MQ=255) cTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCttt < 1:1830048/100‑1 (MQ=255) tCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGc < 2:381223/100‑1 (MQ=255) tCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGATGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCAAAAAAGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTtgtg < 1:1125289/99‑1 (MQ=255) cGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtc < 2:1511415‑M2/100‑3 (MQ=255) ggAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtca < 2:1745575‑M2/100‑4 (MQ=255) ggAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtca > 2:1717547‑M2/1‑97 (MQ=255) ggAATTTTGTAGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAACCAGATGGGGAATTCTCCCGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTATGCGGtca < 1:552065‑M2/100‑4 (MQ=255) gAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcag < 2:405416‑M2/100‑5 (MQ=255) aaTTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcagg < 2:789078‑M1/100‑19 (MQ=255) aaTTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcagg > 2:2576777‑M2/1‑95 (MQ=255) aTTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggc < 1:1444348‑M1/100‑20 (MQ=255) aTTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggc > 2:2409689‑M2/1‑94 (MQ=255) aTTTTGTGGCTGTCGCGGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggc < 2:1902169‑M1/100‑20 (MQ=255) tgGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttt < 2:113658‑M1/100‑26 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg > 2:2318444/1‑100 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg < 2:1688552/100‑1 (MQ=255) ggCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCg > 2:382885/1‑100 (MQ=255) gCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttttt < 1:12819‑M1/100‑28 (MQ=255) cTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttttta < 2:2190172‑M1/100‑29 (MQ=255) cTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttttta < 2:2380372‑M1/100‑29 (MQ=255) cTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAAATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttt < 1:1413745‑M1/98‑27 (MQ=255) cTGTCGCTGATGGTTATATTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcattttttta < 1:1108966‑M1/100‑29 (MQ=255) tGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttac < 1:136198‑M1/100‑30 (MQ=255) tGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttac < 2:250896‑M1/100‑30 (MQ=255) gTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacc < 2:592754‑M1/100‑31 (MQ=255) gCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAAt > 2:521137/1‑100 (MQ=255) gCTGATGGTTATCTATTTAAAAGATAAACAGATGTGAAATTCTAAAAAAAGATAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAAt < 1:840857/100‑1 (MQ=255) cTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATg < 1:1305507/100‑1 (MQ=255) tGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATgg > 2:2335973/1‑100 (MQ=255) tGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATgg < 1:2127014/100‑1 (MQ=255) atctgtttATCTTTTAAAAAGATAAATAGATGGGAACTTCTCACGAAGGCTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAAACAATgg > 2:1772121/7‑100 (MQ=255) atctgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATgg > 2:2189425/7‑100 (MQ=255) ctgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGt > 1:2243964/5‑99 (MQ=255) ctgtttATCTTTTAAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTg > 2:1937954/5‑100 (MQ=255) ttATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATgg > 2:1552771/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGTCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgt < 1:802541/99‑1 (MQ=255) aTCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtc > 1:2376334/1‑100 (MQ=255) cTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcg > 1:2521453/1‑99 (MQ=255) tttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc > 2:2264020/1‑100 (MQ=255) tttgtAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc < 1:1088421/100‑1 (MQ=255) ttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGGTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGgtcgtc > 2:584691/1‑99 (MQ=255) ttttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCa < 1:2845545/100‑1 (MQ=255) tttAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCaa > 2:1813186/1‑100 (MQ=255) aaaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt > 1:2287472/1‑100 (MQ=255) aaaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt > 2:504035/1‑100 (MQ=255) aaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCt > 1:646362/1‑99 (MQ=255) aaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTg > 2:2100798/1‑100 (MQ=255) aaaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTg < 1:1808118/100‑1 (MQ=255) aaGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTgg < 2:2096070/100‑1 (MQ=255) gATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGgtg > 2:854980/1‑100 (MQ=255) tAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGtt > 1:2815585/1‑100 (MQ=255) ccgatcttGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTc < 1:1933941/93‑1 (MQ=255) aaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAATAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCg < 1:2034869/100‑1 (MQ=255) aaCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAACAATGCCTGACTGATTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTAAATCTGGTGTTCg > 1:1323595/1‑100 (MQ=255) aCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGa > 2:552109/1‑100 (MQ=255) aCAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGa > 2:2832133/1‑100 (MQ=255) cAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGAt > 2:1334886/1‑100 (MQ=255) aGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATa < 2:2198579/100‑1 (MQ=255) aGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATa < 1:900559/100‑1 (MQ=255) aTGGGAAATTCTCACGAAGAGTAAAAAAATGCCTGACTGCTGTGTGCGATCATGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAAc < 1:2319619/100‑1 (MQ=255) gAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATc < 1:2273366/100‑1 (MQ=255) aaTTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATccc > 2:855580/1‑100 (MQ=255) ttCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCtt > 2:2058768/1‑100 (MQ=255) ttCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATAGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCtt > 1:779375/1‑100 (MQ=255) gtgaggAAGGGGAAAAGAAGGCCGGGCTGCTTTGTGCGATCAGGCATGCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCGATCTGGTGTTCGATAACCATCCCt < 1:2740792/92‑1 (MQ=255) ccgatctggTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc < 1:539023/93‑1 (MQ=255) cACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc > 2:1998564/1‑100 (MQ=255) cACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAcc < 2:564786/100‑1 (MQ=255) 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< 2:2165127/100‑1 (MQ=255) tAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaatataaccatcagcgacag < 1:1108966‑M2/100‑73 (MQ=255) taaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCa < 2:1684824/99‑1 (MQ=255) aaaataaTGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGAATTCTCGAATTAATGGTGAGGGTCGTCAAGCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCAACTACGCTggaa < 1:1535723/100‑3 (MQ=255) aaaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagc < 1:12819‑M2/100‑74 (MQ=255) aaaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttattttttaaaaagataaccatcagcgacag < 1:1413745‑M2/98‑73 (MQ=255) aaaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagcca < 2:113658‑M2/100‑76 (MQ=255) aaaaTGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGa > 2:1194530/1‑100 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttgtcttttcaaaagataaccatcagcgactgccacaa < 1:1120092‑M2/100‑79 (MQ=255) aaTGCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttaccatctgtttattttttcaaaagataaccatcagcgacagccacaa < 1:904403‑M2/100‑79 (MQ=255) aTGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATgg > 1:2653342/1‑100 (MQ=255) gCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaat > 2:2409689‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaat > 1:2454483‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatccgcgacagccacaaaat < 2:1902169‑M2/100‑82 (MQ=255) ccTGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaatt > 2:2576777‑M1/1‑5 (MQ=255) ccTGATTGGTTTGTGCGATTAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTTGTCAATCTGGTGTGCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGcc < 1:1834868/99‑2 (MQ=255) ccTGACTGCTTTGTGCGAtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaatt < 2:788743‑M2/100‑83 (MQ=255) tGAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattcc > 2:1717547‑M1/1‑3 (MQ=255) tGAccgcataaagcagtcaggcatttttttacccttcgggagaattccccatctggttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagctacaaaattcc < 1:552065‑M1/100‑98 (MQ=255) tGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAAc < 1:893901/100‑1 (MQ=255) gAtcgcacaaagcagtcaggcatttttttacccttcgtgagaatttcccatctgtttatcttttaaaaagataaccatcagcgacagccacaaaattccg < 2:1511415‑M1/100‑99 (MQ=255) | CTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCTGACTGCTTTGTGCGATCAGGCATTCTCGAATTAATGGTGATGGTCGTCAATCTGGTGTTCGATAACCATCCCTTCACCTACGCTGGCAAGATGGCGAACA > NC_000913/884818‑885015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |