| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4389174 = | 64 (0.750) | 10 (0.130) | 5/164 | NT | 16.3% | coding (197/3324 nt) | mscM | mechanosensitive channel protein, miniconductance |
| ? | NC_000913 | 4389211 = | 44 (0.560) | coding (160/3324 nt) | mscM | mechanosensitive channel protein, miniconductance | |||||
GCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCT > NC_000913/4389076‑4389273 | gCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGAt < 2:1355204/100‑1 (MQ=255) gcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATg < 2:1787851‑M1/3‑1 (MQ=255) cGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATg > 1:2034169/1‑100 (MQ=255) gACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATgc > 1:1694346/1‑100 (MQ=255) cccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATgc < 1:231564‑M1/4‑1 (MQ=255) acacGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATgcg > 1:1787866/1‑100 (MQ=255) ccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCt > 2:1542630‑M1/94‑100 (MQ=255) ccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCt > 1:262957‑M1/94‑100 (MQ=255) cGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTc < 1:1970462/100‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTc < 2:1994830/100‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTc > 1:1318087/1‑100 (MQ=255) tGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAg < 2:1437025/100‑1 (MQ=255) gcgcGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAgg < 1:1337941/100‑1 (MQ=255) gcgcGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAgg > 2:628800/1‑100 (MQ=255) cgGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGaa > 1:1396072/1‑100 (MQ=255) cgGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGaa > 1:1998736/1‑100 (MQ=255) cTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCt < 2:2087892/100‑1 (MQ=255) cGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCttt < 1:1173102/100‑1 (MQ=255) gTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCtttt > 2:1949759/1‑100 (MQ=255) gTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCtttt < 1:2149925/100‑1 (MQ=255) gTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCtttt > 1:1101796/1‑100 (MQ=255) cACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCg > 1:1285038/1‑100 (MQ=255) cACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCg < 2:60771/100‑1 (MQ=255) aCGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGt < 1:1961549/100‑1 (MQ=255) aCGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGt > 2:1601524/1‑100 (MQ=255) cGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGtt > 2:1205669/1‑100 (MQ=255) cGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGtt > 2:1014256/1‑100 (MQ=255) cGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGtt < 1:1376233/100‑1 (MQ=255) cGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGtt < 2:193152/100‑1 (MQ=255) cATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTcc < 2:580996/100‑1 (MQ=255) tgttgtTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTc > 1:1884433/1‑100 (MQ=255) tgttgtTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTc > 1:622822/1‑100 (MQ=255) tgttgtTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTc > 1:308645/1‑100 (MQ=255) tgttTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAg < 1:533039/100‑1 (MQ=255) tgttTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAg < 2:1208029/100‑1 (MQ=255) gttTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAgc > 1:1680384/1‑100 (MQ=255) gttTAATTGTGCGCACAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAgc > 1:358554/1‑100 (MQ=255) ctggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAgc < 1:337945‑M1/33‑1 (MQ=255) tAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCa < 2:1975156/100‑1 (MQ=255) ttGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCAttt < 1:394553/100‑1 (MQ=255) ttGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCCATAACTGGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGTAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCAttt < 2:388522/100‑1 (MQ=255) tgtgCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAATTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTa < 2:1523525/100‑1 (MQ=255) tgtgCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTa < 2:1169346/100‑1 (MQ=255) gtgCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTaa > 1:41712/1‑100 (MQ=255) ggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTaa > 1:852726‑M1/60‑100 (MQ=255) tgCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAg < 1:155756/100‑1 (MQ=255) tgCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCACTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAg < 2:587999/100‑1 (MQ=255) gcaaaagcggtgaaacccgcacagccggatgtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTaa > 2:822403‑M1/59‑99 (MQ=255) gcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgcagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGTATTTAAg > 2:1252373‑M1/59‑100 (MQ=255) gcgcgcAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAgg > 2:1869898/1‑100 (MQ=255) caaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAgg > 1:870289‑M1/58‑100 (MQ=255) caaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAgg > 1:936036‑M1/58‑100 (MQ=255) caaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAgg > 2:337943‑M1/58‑100 (MQ=255) caaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAgg > 2:2030791‑M1/58‑100 (MQ=255) caaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAgg > 1:533553‑M1/58‑100 (MQ=255) gcgcAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTTTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCa > 2:1947122/1‑100 (MQ=255) gcgcAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCa > 1:1153340/1‑100 (MQ=255) aaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCa > 1:1387155‑M1/56‑100 (MQ=255) cAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGa > 2:2170766/1‑99 (MQ=255) gTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGa > 2:1392093/1‑100 (MQ=255) gCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAgcg < 2:1515258/100‑1 (MQ=255) gCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAgcg < 2:110815/100‑1 (MQ=255) gTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTAc > 2:2217697/1‑100 (MQ=255) gTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTAc > 2:2032264/1‑100 (MQ=255) gTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTAc < 1:1197657/100‑1 (MQ=255) tttCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACg < 2:1865691/100‑1 (MQ=255) tCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGAc < 1:520774/100‑1 (MQ=255) cGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTTGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGGGCCTCTACGACt > 1:1300482/1‑100 (MQ=255) cGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACt > 1:2060048/1‑100 (MQ=255) cGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACt > 1:1355609/1‑100 (MQ=255) aaTTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCgg < 1:1181490/100‑1 (MQ=255) aTTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGc < 2:766643/100‑1 (MQ=255) aTTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGc < 2:766785/100‑1 (MQ=255) aTTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGc < 2:329364/100‑1 (MQ=255) ttATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCt > 1:1529762/1‑100 (MQ=255) aTCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCtgt > 1:869459/1‑100 (MQ=255) gATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCg > 2:1994774/1‑100 (MQ=255) aTAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCgg > 2:897096/1‑100 (MQ=255) aCTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGtt > 1:2225097/1‑100 (MQ=255) ttGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAGGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTc > 2:1521884/1‑100 (MQ=255) ttGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTc > 1:984011/1‑100 (MQ=255) ttGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCtttt > 1:81493/1‑100 (MQ=255) tttGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGcc < 1:530522/100‑1 (MQ=255) ttGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCt < 1:1736824/100‑1 (MQ=255) gATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGc > 1:1544638/1‑100 (MQ=255) gATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAAGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGc > 1:917080/1‑100 (MQ=255) ATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCt < 2:561693‑M1/100‑1 (MQ=255) | GCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCT > NC_000913/4389076‑4389273 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |