| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2597686 = | NA (NA) | 9 (0.110) | 7/166 | NT | NA | noncoding (14/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 2597714 = | NA (NA) | noncoding (42/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 | ttACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGt > 1:1938700/1‑100 (MQ=255)atccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtt < 2:1380358‑M1/1‑1 (MQ=255)atccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtt < 1:1687373‑M1/1‑1 (MQ=255) tccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTc < 2:1851570‑M1/2‑1 (MQ=255) ccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCg < 1:256243‑M1/3‑1 (MQ=255) aCCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCg < 1:2373219/100‑1 (MQ=255) cggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCgg < 2:2349477‑M1/4‑1 (MQ=255) cggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCgg > 1:2387281‑M1/97‑100 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCgg > 2:1919700/1‑100 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGAGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCg > 2:308107/1‑99 (MQ=255) cACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGa > 1:297567/1‑100 (MQ=255) aCGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGCTGTTTTGTCGGAt > 2:1953307/1‑100 (MQ=255) gATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgc > 1:203572/1‑100 (MQ=255) ttccgatctcttgcttTTACATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggc < 1:634059/91‑1 (MQ=255) cAACTCATCTTGCTTTTCCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggc < 2:2293674/99‑1 (MQ=255) cAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAGTCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggcg > 2:1528137/1‑100 (MQ=255) cAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggcg < 1:566913/100‑1 (MQ=255) aCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGAGTGAATTAACGTTTTCAAATCTTTTGCTGTCTGGTTTGCCGGATGTTTTGTCGGATg > 2:1160770/1‑93 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcc < 2:127286/100‑1 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcc < 1:1761332/100‑1 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcc > 2:2022/1‑100 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcc > 2:997591/1‑100 (MQ=255) cttgcttTTACATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggcagatcggaa > 2:634057/1‑91 (MQ=255) ttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt < 1:1785931/100‑1 (MQ=255) tgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCtt > 1:1837461‑M1/79‑100 (MQ=255) gcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa > 2:146983/1‑100 (MQ=255) gcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa < 2:1977949/100‑1 (MQ=255) cttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt > 1:1307318/1‑100 (MQ=255) tttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc < 1:1839230/100‑1 (MQ=255) acgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaagtttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 1:1372225‑M1/75‑100 (MQ=255) acgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 2:1807118‑M1/75‑100 (MQ=255) acgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGACGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 2:1456981‑M1/75‑100 (MQ=255) ttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCg > 2:2365220/1‑100 (MQ=255) cgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCg > 1:1705163‑M1/74‑100 (MQ=255) cgcaaacgtgtgcgtcggcaggaagactcgatttcagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgcagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 2:1169967‑M1/74‑99 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc > 1:344939/1‑100 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 2:1510997/100‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt > 1:170557/1‑100 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 1:2051534/100‑1 (MQ=255) tCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTa > 2:165299/1‑100 (MQ=255) tttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACg > 1:110267/1‑100 (MQ=255) tATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTc > 1:1425997/1‑100 (MQ=255) tATCAATCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTc < 1:2115843/100‑1 (MQ=255) aTCACTCCTGAGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTTTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTcc < 2:1821156/100‑1 (MQ=255) tCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTTTTGGGCCGGATTTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTGATCCGAACTACGTcc > 1:108637/1‑99 (MQ=38) tCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCg > 1:2170062/1‑100 (MQ=255) aCTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGac > 2:280408/1‑100 (MQ=255) aCTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGac > 1:467080/1‑100 (MQ=255) cTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGaca < 1:1157633/100‑1 (MQ=255) cTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGaca > 2:1766191/1‑100 (MQ=255) cTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGaca < 1:1919716/100‑1 (MQ=255) ccTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaa > 2:1450667/1‑100 (MQ=255) ccTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaa > 2:1367404/1‑100 (MQ=255) cTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaac < 1:274871/100‑1 (MQ=255) cTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaac < 1:1841540/100‑1 (MQ=255) gggTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaacaa > 1:843401/1‑100 (MQ=255) gAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCg < 1:2187083/100‑1 (MQ=255) cgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgccggatgttttgTCGGATGCGGCGTGATCGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTg > 1:1943113‑M1/47‑100 (MQ=255) aTTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTg > 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1:494031/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGa > 1:1599705/1‑100 (MQ=255) ccGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGAc > 1:2332428/1‑100 (MQ=255) cGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACg > 1:1829961/1‑100 (MQ=255) aTGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGcac < 1:29947/100‑1 (MQ=255) gTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCacac > 2:147713/1‑100 (MQ=255) ttttGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACg > 1:1380366/1‑100 (MQ=255) ttGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGtt > 1:300645/1‑100 (MQ=255) ttGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGtt > 1:80647/1‑100 (MQ=255) agtTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGtt < 2:486926‑M1/97‑1 (MQ=255) gTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTg > 2:1528866/1‑100 (MQ=255) TCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGTATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGc < 2:1521136‑M1/100‑1 (MQ=255) | TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |