| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4555370 | 165 (1.210) | 20 (0.170) | 9/158 | NT | 11.3% | intergenic (+21/+120) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 4555379 | 167 (1.380) | intergenic (+30/+111) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTA > NC_000913/4555271‑4555469 | aTTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTa > 1:3720215/1‑100 (MQ=255) ctcGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAAc > 2:359469/1‑100 (MQ=255) gAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGtt < 1:494436/100‑1 (MQ=255) aCGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTcc > 1:577821‑M2/1‑98 (MQ=255) gTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTcctt < 1:630086‑M2/100‑5 (MQ=255) tGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgc < 2:3590443‑M2/100‑7 (MQ=255) gACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcg < 1:1514839‑M1/100‑17 (MQ=255) aCGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcgc < 1:3366573‑M1/100‑18 (MQ=255) aCGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcgc < 1:1929821‑M1/100‑18 (MQ=255) aCGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgc < 2:1760938‑M2/100‑9 (MQ=255) cGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcgct < 1:3443102‑M1/100‑19 (MQ=255) atatTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcgctta < 1:3494722‑M1/100‑21 (MQ=255) atatTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcgct < 2:2719426‑M1/98‑19 (MQ=255) tatttattTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcgcttat < 2:3522383‑M1/100‑22 (MQ=255) tatttattTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTc > 1:2166917/1‑100 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 2:1146257/100‑1 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGCTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTc < 1:1234689/99‑1 (MQ=255) tatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGaacgtttacccttgcgcttattata < 1:77008‑M1/100‑26 (MQ=255) tatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTa > 2:1109794/1‑99 (MQ=255) ttttGGCGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCGGGAGAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAGTAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAt < 2:3083718/100‑1 (MQ=255) ttttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAt < 1:2823336/100‑1 (MQ=255) ttttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAt < 1:2140802/100‑1 (MQ=255) tGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaa > 2:2205648/1‑100 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 2:3161224/100‑1 (MQ=255) tGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaa > 2:3079503/1‑100 (MQ=255) tGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaa > 1:1006728/1‑100 (MQ=255) tGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGGCGACGCCTGACTTATTTTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 2:1867930/99‑1 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTc > 2:707440/1‑100 (MQ=255) aTCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGc < 2:369730/100‑1 (MQ=255) tCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCa < 1:3528044/100‑1 (MQ=255) cTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCaa < 1:1156910/100‑1 (MQ=255) cTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCaa > 2:860833/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 2:3706050/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 1:1572814/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTAGCAAt > 2:3250291/1‑99 (MQ=255) tttGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGa > 1:1955341/1‑100 (MQ=255) tGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATTAGt > 2:2374315/1‑100 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt > 1:3113735/1‑100 (MQ=255) cATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTAc > 2:1961115/1‑100 (MQ=255) aTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACt > 1:3154668/1‑100 (MQ=255) ggCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTAATTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACttt > 2:1315595/1‑100 (MQ=255) gccgccGGATAAATTCGACGCCTCACTTATTATAACAATCGCAACAATAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAATAAGAAGTCGCAATACGTATTACttt < 2:235948/99‑1 (MQ=255) ccGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTGTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGGATTACTTTGt > 2:2517463/1‑100 (MQ=255) gCTGGATAAAGTCGATGCCTGACATACTCTTATAAGCGCAAGGGTACACGTTCTTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGCGTATTACttta < 2:63403/97‑2 (MQ=255) tGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAt > 1:686947/1‑100 (MQ=255) ggATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTTCGCTTTCTTAAATTAAGAATTCGCAATGAGTATGACTTTTTAAAt > 2:3184353/1‑99 (MQ=255) ggATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAtt > 1:883736/1‑100 (MQ=255) ggATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAtt < 1:1685062/100‑1 (MQ=255) gATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAt > 2:2669106/1‑98 (MQ=255) tAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCa < 2:3001205/100‑1 (MQ=255) aaaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAg < 2:2561222/100‑1 (MQ=255) aaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAgg < 2:3402544/100‑1 (MQ=255) aaGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAACTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAgg < 2:3815864/100‑1 (MQ=255) aGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg > 2:3282898/1‑100 (MQ=255) gTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGt > 2:2901528/1‑100 (MQ=255) gTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGt > 1:2070175/1‑100 (MQ=255) tCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTa < 1:3138019/100‑1 (MQ=255) gACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTAtt > 1:2379432/1‑100 (MQ=255) cGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagata < 1:239662‑M2/100‑64 (MQ=255) cGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGt > 1:2957333/1‑100 (MQ=255) gCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatag < 1:315723‑M2/100‑65 (MQ=255) ccTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGttt > 2:2785304/1‑100 (MQ=255) ccTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGAGTATTGttt > 2:3461626/1‑100 (MQ=255) gcgcTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGGATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg > 1:2244965/4‑100 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 1:120988/100‑1 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc > 1:3577740/1‑100 (MQ=255) cTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTa > 1:2315295/1‑100 (MQ=255) cTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTa > 1:1413039/1‑100 (MQ=255) ttattaTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGTGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTAt > 2:1656686/1‑100 (MQ=255) ttattaTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTAt < 2:496905/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAATGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc > 2:3030628/1‑100 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:3261500/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:133198/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 1:958519/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 1:1091695/100‑1 (MQ=255) tataATAAGCGCACGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGATTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGATTAGCTATATg > 2:2366120/1‑99 (MQ=255) tataATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcgtccatgaatcaaacagatagccatcaaaata < 2:1093442‑M2/100‑76 (MQ=255) tataATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGt < 2:3536662/100‑1 (MQ=255) ataataAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGta < 2:2200204/100‑1 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata > 1:2627736/1‑100 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata < 2:2161799/100‑1 (MQ=255) ataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 1:1060413/1‑100 (MQ=255) ataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 1:2124491/1‑100 (MQ=255) ataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 1:2271679/1‑100 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatccaacagatagccatcaaaataaatat < 1:705721‑M2/100‑81 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatat < 1:3195953‑M2/100‑81 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatat < 1:3792182‑M2/100‑81 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatat < 1:3779045‑M2/100‑81 (MQ=255) aaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatc < 1:1846952‑M2/100‑82 (MQ=255) aaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatc < 2:1046902‑M2/100‑82 (MQ=255) aGCGCAAGGaacgtttacccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcg > 1:2266519‑M1/1‑9 (MQ=255) aGCGCAAGGaacgtttacccctgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaaccaaacagatagccatcaaaataaatatcg < 1:136753‑M1/100‑92 (MQ=255) cgcAAGGaacgtttacccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcgtc > 1:527907‑M1/1‑7 (MQ=255) cgcAAGGaacgtttacccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcgtc > 2:731978‑M1/1‑7 (MQ=255) cgcAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGa > 2:1720847/1‑100 (MQ=255) gcAAGGaacgtttacccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcgtca > 2:1635025‑M1/1‑6 (MQ=255) gcAAGGaacgtctacccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcgtca > 2:3800091‑M1/1‑6 (MQ=255) cAAGGaacgtttacccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcgtcan < 1:595601‑M1/100‑96 (MQ=255) gggTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGtt < 2:1375199/100‑1 (MQ=255) gggTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAATATTAGTTTGTAAATTGCAGGGTGTTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGt > 2:2272903/1‑99 (MQ=255) | GGAATTCTCGAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTA > NC_000913/4555271‑4555469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |