| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4555370 | 165 (1.210) | 20 (0.170) | 9/158 | NT | 11.3% | intergenic (+21/+120) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 4555379 | 167 (1.380) | intergenic (+30/+111) | uxuR/yjiC | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAT > NC_000913/4555280‑4555477 | ntgACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttg < 1:595601‑M2/99‑6 (MQ=255) tGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAGACGTTccttgc > 2:3800091‑M2/1‑94 (MQ=255) gACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcg > 2:731978‑M2/1‑93 (MQ=255) gACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcg > 1:527907‑M2/1‑93 (MQ=255) gACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGAATTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttg < 2:2201861‑M2/98‑6 (MQ=255) aCGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgc < 2:1760938‑M2/100‑9 (MQ=255) cGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGGTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAGGGGTAAACGTTccttgcgct < 1:136753‑M2/100‑10 (MQ=255) cGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgct > 1:2125026‑M2/1‑91 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 1:2162313/100‑1 (MQ=255) atttatttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCt < 2:1146257/100‑1 (MQ=255) ttttttttGGTGGCTATCTTTTTGATTCATAGATGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTGATTATAATAAGCGCAAGGGTACACGTTCCTTACGCTTTCtt > 2:3080184/1‑100 (MQ=255) atttTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTaaa > 1:3736056/1‑100 (MQ=255) ttttGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAt < 1:2823336/100‑1 (MQ=255) aTGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 2:3161224/100‑1 (MQ=255) tGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaagaa > 1:1006728/1‑100 (MQ=255) tGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGGCGACGCCTGACTTATTTTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTaaga < 2:1867930/99‑1 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTc > 2:707440/1‑100 (MQ=255) cTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTc < 1:63667/100‑1 (MQ=255) aTCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGc > 2:2231565/1‑100 (MQ=255) tCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCa < 1:3528044/100‑1 (MQ=255) tCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCa < 2:2640046/100‑1 (MQ=255) cTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCaa < 1:1156910/100‑1 (MQ=255) cTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCaa > 1:3465104/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg < 2:902749/100‑1 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATg > 2:2979245/1‑100 (MQ=255) gTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTAGCAAt > 2:3250291/1‑99 (MQ=255) tttGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGa > 1:1955341/1‑100 (MQ=255) tGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATTAGt > 2:2374315/1‑100 (MQ=255) tGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGt < 2:230108/100‑1 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt > 2:1098067/1‑100 (MQ=255) aTTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAt > 1:3113735/1‑100 (MQ=255) ttCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTAtt < 1:2085734/100‑1 (MQ=255) cATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTAc > 1:1488862/1‑100 (MQ=255) aTGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACt > 1:3154668/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACtt < 2:3705008/100‑1 (MQ=255) ggCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTAATTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACttt > 2:1315595/1‑100 (MQ=255) gccgccGGATAAATTCGACGCCTCACTTATTATAACAATCGCAACAATAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAAATAAGAAGTCGCAATACGTATTACttt < 2:235948/99‑1 (MQ=255) ccGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTGTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGGATTACTTTGt > 2:2517463/1‑100 (MQ=255) gCTGGATAAAGTCGATGCCTGACATACTCTTATAAGCGCAAGGGTACACGTTCTTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGCGTATTACttta < 2:63403/97‑2 (MQ=255) gCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTaa < 1:2066440/100‑1 (MQ=255) tGGATAAAGTCTACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAt < 2:1698317/100‑1 (MQ=255) ggATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAtt > 1:883736/1‑100 (MQ=255) gATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAAt > 2:2669106/1‑98 (MQ=255) gATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTg > 2:3267160/1‑100 (MQ=255) aGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg > 2:36707/1‑100 (MQ=255) gTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGt > 2:2901528/1‑100 (MQ=255) gTCGACCGCAGACTCATTATAATAAGTGCAAGTGTTAACGTTCTTTGCGCTTTCTTAAATTAAGACGTCGCAATGATTATTACTTTGTAAATTGCAggg < 2:2485319/99‑1 (MQ=255) tCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTa < 1:3138019/100‑1 (MQ=255) cGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTAt > 2:2005440/1‑100 (MQ=255) gACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTAtt > 1:2379432/1‑100 (MQ=255) aCGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAggg < 2:3373636/95‑1 (MQ=255) aCGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTg > 1:448673/1‑100 (MQ=255) cGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagata < 1:239662‑M2/100‑64 (MQ=255) gCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGtt < 1:2229441/100‑1 (MQ=255) ccTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGttt > 2:461637/1‑100 (MQ=255) ccTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGttt > 2:2785304/1‑100 (MQ=255) ccTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGAGTATTGttt > 2:3461626/1‑100 (MQ=255) ccTGACTTATTAAAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGttt < 2:358686/100‑1 (MQ=255) tGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg < 2:2972213/100‑1 (MQ=255) gcgcTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGGATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAg > 1:2244965/4‑100 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc > 1:3577740/1‑100 (MQ=255) gACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGc < 1:120988/100‑1 (MQ=255) cTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTa > 1:2315295/1‑100 (MQ=255) ttattaTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGTGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTAt > 2:1656686/1‑100 (MQ=255) ttattaTAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTAt < 2:496905/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAATGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc > 2:3030628/1‑100 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:133198/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:3053307/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 2:3261500/100‑1 (MQ=255) tattatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCACTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATc < 1:1316001/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 2:3591452/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 1:958519/100‑1 (MQ=255) ttatAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTg < 1:1091695/100‑1 (MQ=255) tataATAAGCGCACGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGATTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGATTAGCTATATg > 2:2366120/1‑99 (MQ=255) tataATAAGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaata < 1:77008‑M2/100‑76 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata < 1:305795/100‑1 (MQ=255) aataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGtata < 2:2161799/100‑1 (MQ=255) ataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 1:1060413/1‑100 (MQ=255) ataaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATaa > 1:2271679/1‑100 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatat < 1:3792182‑M2/100‑81 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatat < 1:3195953‑M2/100‑81 (MQ=255) taaGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTCGCTATCTGtctcac > 1:703416/1‑95 (MQ=255) aaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatc < 1:1647790‑M2/100‑82 (MQ=255) aaGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatc < 2:1046902‑M2/100‑82 (MQ=255) aGCGCAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatat < 2:2719426‑M2/98‑81 (MQ=255) aGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCt < 2:1494935/100‑1 (MQ=255) gcgcAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcgt < 1:3366573‑M2/100‑84 (MQ=255) cgcAAGGGTAAACGTTccttgcgcttattataataagtcaggcgtcgactttatccagcggccatgaatcaaacagatagccatcaaaataaatatcgtc < 1:1514839‑M2/100‑85 (MQ=255) cgcAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTg > 1:226510/1‑99 (MQ=255) gggTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGtt < 2:1443562/100‑1 (MQ=255) gggTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGtt < 2:1375199/100‑1 (MQ=255) ggTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTa > 2:3509737/1‑100 (MQ=255) ggTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTa > 1:1870179/1‑100 (MQ=255) gTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAg < 1:2709368/100‑1 (MQ=255) aaaCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTa > 2:11408/1‑100 (MQ=255) aaCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTAc > 2:192037/1‑100 (MQ=255) aCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACt > 1:273289/1‑100 (MQ=255) aCGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACt < 1:1767442/100‑1 (MQ=255) cGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTc > 2:3214524/1‑100 (MQ=255) tCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAt > 2:3404315/1‑99 (MQ=255) | GAACGTTGACGATATTTATTTTGATGGCTATCTGTTTGATTCATGGCCGCTGGATAAAGTCGACGCCTGACTTATTATAATAAGCGCAAGGGTAAACGTTCCTTGCGCTTTCTTAAATTAAGAAGTCGCAATGAGTATTACTTTGTAAATTGCAGGGTATTGTTTAGCTATCTGTATAACCTGAATGTTAGTACTCAT > NC_000913/4555280‑4555477 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |