| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3299608 | 122 (0.890) | 20 (0.170) | 7/158 | NT | 15.0% | coding (308/444 nt) | yhbP | UPF0306 family protein |
| ? | NC_000913 | = 3299630 | 118 (0.970) | coding (286/444 nt) | yhbP | UPF0306 family protein | |||||
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TGTTGTCGGTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAAC > NC_000913/3299531‑3299729 | tgttgtCGGTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAg < 1:855253/100‑1 (MQ=255) ttgtCGGTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCATACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgt > 2:2226899‑M2/1‑98 (MQ=255) ttgtCGGTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgt > 1:589395‑M2/1‑98 (MQ=255) tgtCGGTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtc > 2:2821326‑M2/1‑97 (MQ=255) tgtCGGTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtc < 1:237481‑M2/100‑4 (MQ=255) gtCGGTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcg < 2:2429723‑M2/100‑5 (MQ=255) gTGAATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcgcttt > 1:2399716‑M2/1‑92 (MQ=255) cggtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctgggaggtgaGGATAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTtcn > 1:1475021‑M1/59‑99 (MQ=255) cggtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTcc > 1:2166482‑M1/59‑100 (MQ=255) ggtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCt > 1:1066066‑M1/58‑100 (MQ=255) ggtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCt > 1:2823945‑M1/58‑100 (MQ=255) ggtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGACGTCCCTTTCCt > 2:2006777‑M1/58‑100 (MQ=255) gtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTc > 1:3293724‑M1/57‑100 (MQ=255) gtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTc > 1:1914351‑M1/57‑100 (MQ=255) aTTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTc < 2:2067360/100‑1 (MQ=255) aTTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTc < 2:1279243/100‑1 (MQ=255) tttGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCa < 1:402928/100‑1 (MQ=255) ttGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCAc < 2:1297720/100‑1 (MQ=255) tGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCAc < 2:2330732/99‑1 (MQ=255) aTTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCtt < 1:954412/100‑1 (MQ=255) tttCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTc > 1:3365312/1‑100 (MQ=255) ttCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTcc > 2:2010572/1‑100 (MQ=255) taattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTcc > 2:138112‑M1/50‑100 (MQ=255) cATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCACCCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCCGCTTCCAg > 2:1095229/1‑100 (MQ=255) cATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCa > 1:2077927/1‑99 (MQ=255) cATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAg < 2:52958/100‑1 (MQ=255) cATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAg > 1:2546960/1‑100 (MQ=255) aTCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAg < 1:3032698/99‑1 (MQ=255) tCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGcc < 1:3788099/100‑1 (MQ=255) gAGCCGGCTTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTg > 1:1998864/1‑100 (MQ=255) gCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCg < 2:348108/100‑1 (MQ=255) ccGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCg > 2:1029008/1‑99 (MQ=255) cGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGa > 1:134535/1‑100 (MQ=255) tttCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGAtctc < 1:1982230/100‑1 (MQ=255) ttCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCa < 2:172154/100‑1 (MQ=255) cccACGCCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTCCGCCCTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCAc < 2:3446658/99‑1 (MQ=255) cccACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCAcc > 1:1109588/1‑100 (MQ=255) ccACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCt < 1:941428/100‑1 (MQ=255) ccACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGAAACCGGAAAGCGCCGATTGTACGCCTAGCGCGCGAGGTCGCTGTACTACCCTTCCAGCCTCCGGacc > 2:1307184/1‑92 (MQ=255) ccACACCGGGGCCGACAGCATTCAGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCt < 2:1571947/100‑1 (MQ=255) cacaCCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCtt < 1:1313569/100‑1 (MQ=255) acacCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCttt > 2:1978806/1‑100 (MQ=255) cacCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTa < 1:3432047/100‑1 (MQ=255) ccGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTaaa > 2:2811436/1‑100 (MQ=255) cGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAAc < 1:636855/100‑1 (MQ=255) ggggCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACt > 2:3529937/1‑100 (MQ=255) ggCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGc < 1:121555/100‑1 (MQ=255) gCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGca > 2:1330061/1‑100 (MQ=255) cGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcgctttccggttgccagaatgctgtcggccccggtgtgggaaatccg < 1:2493118‑M2/100‑50 (MQ=255) cGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGcaca > 1:3540800/1‑100 (MQ=255) gACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCacac > 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ccGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcgctttccggttgccagaatgctgtcggccccggtgtgggaaatccggctcgatgaaatcaaat < 2:3148077‑M2/100‑67 (MQ=255) ccGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcgctttccggttgccagaatgctgtcggccccggtgtgggaaatccggctcgatgaaatcaaat < 1:26682‑M2/100‑67 (MQ=255) ccGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTAc > 1:2885040/1‑100 (MQ=255) cGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcgctttccggttgccagaatgctgtcggccccggtgtgggaaatccggctcgatgaaatcaaatt < 2:3794880‑M2/100‑68 (MQ=255) ggAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcgctttccggttgccagaatgctgtcggccccggtgtgggaaatccggctcgatgaaatcaaattc < 1:723098‑M2/100‑69 (MQ=255) ggAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGgtcgctttccggttgccagaatgctgtcggccccggtgtgggaaatccggctcgatgaaatcaaattc < 1:2733423‑M2/100‑69 (MQ=255) GGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCg > 2:1791066‑M1/1‑100 (MQ=255) 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AAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGttt < 2:2563371‑M1/100‑1 (MQ=255) AAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGttt > 2:60824‑M1/1‑100 (MQ=255) CGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCg < 1:233798‑M1/100‑1 (MQ=255) CGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCg > 1:2945636‑M1/1‑100 (MQ=255) GACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCgg < 2:480811‑M1/100‑1 (MQ=255) ACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGc > 1:261517‑M1/1‑100 (MQ=255) CGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCt < 1:322863‑M1/100‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |