| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3666120 = | 183 (1.340) | 32 (0.280) | 11/148 | NT | 18.5% | intergenic (‑310/+60) | gadX/gadA | acid resistance regulon transcriptional activator; autoactivator/glutamate decarboxylase A, PLP‑dependent |
| ? | NC_000913 | 3666163 = | 131 (1.160) | intergenic (‑353/+17) | gadX/gadA | acid resistance regulon transcriptional activator; autoactivator/glutamate decarboxylase A, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
ATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGT > NC_000913/3666064‑3666262 | atatatCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGttt < 1:1280291/100‑1 (MQ=255) agggtattgcccagcagaacagctttaaactgacctgataccataacgttgtaaaAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGtttt > 2:1963108‑M1/56‑100 (MQ=255) agggtattgcccagcagaacagctttaaacacacctgataacataacgttgtaaaAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGtttt > 2:2791869‑M1/56‑100 (MQ=255) atatCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGttttt < 2:2931313/100‑1 (MQ=255) tatCTTATCAACACGATGAATATACAGCCAATATATTTTTTCGATTAATGAGCGTCCGTTTGCTCAGCTGTTGTTTTAAAGGTTGGGCATTCGGttt < 2:590776/97‑1 (MQ=255) tatCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATCTATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTa < 2:563759/100‑1 (MQ=255) atCTTATCAACAAGATTAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTAc < 2:1624191/100‑1 (MQ=255) tcatATCAACACTATGGATATACATCCAAGATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGATGTTTTTTTAAAGACTGGGCATCCGGtctttcaa > 2:703226/4‑97 (MQ=255) cTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACaa > 1:2311115/1‑100 (MQ=255) ttATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAAc < 2:1918288/100‑1 (MQ=255) ttATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAACGCCCAGCTGTTTTTTTTAATGTTGGTCATTCGGgtttt > 2:784264/1‑95 (MQ=255) aTCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgt < 2:394486/100‑1 (MQ=255) tCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTGATAAGCAACCGAATGCCCAGATGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTGTTACAACgtt > 2:2500064/1‑100 (MQ=255) tCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgtt > 1:524884/1‑100 (MQ=255) cAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgtta > 1:805692/1‑100 (MQ=255) cAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgtta < 1:2333392/100‑1 (MQ=255) aaCACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttat > 1:1488666/1‑100 (MQ=255) aaCACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttat > 2:3775295/1‑100 (MQ=255) acacGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatg < 1:277217/100‑1 (MQ=255) cacGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgt > 1:3111186/1‑100 (MQ=255) acGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGTTGTGCATTCGGTTTTTACAACgttatgtt > 2:1294211/1‑100 (MQ=255) cGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgtta > 1:3484910/1‑100 (MQ=255) gATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgttat < 1:2662225/100‑1 (MQ=255) gATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACgttatgttat > 1:2094385/1‑100 (MQ=255) aacagctttaaacacacctgataacataacgttgtaaaAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTacaacgttatgagatc < 1:1431395‑M1/62‑6 (MQ=255) tGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCa > 2:3660530/1‑100 (MQ=255) aaTAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAgg < 1:649681/100‑1 (MQ=255) aaTAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAgg < 1:3205808/100‑1 (MQ=255) aaTAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAgg > 1:3170682/1‑100 (MQ=255) aTAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgt > 1:1770107/1‑100 (MQ=255) gACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgtgtg > 1:2413694/1‑100 (MQ=255) gACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGgtgtg > 1:3790080/1‑100 (MQ=255) cAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGtt > 1:2527161/1‑100 (MQ=255) cAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGtt > 1:1862738/1‑100 (MQ=255) aGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGttt < 1:843226/100‑1 (MQ=255) gCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTa < 1:2495519/100‑1 (MQ=255) ccAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGTCTGGGCATTCGGCTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTaa > 2:3049815/1‑100 (MQ=255) cAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTaaa < 2:2306022/100‑1 (MQ=255) cacctgataacataacgttgtaaaAACCGAATACCCAACTGTTTTTTTAAAAGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTaaa > 2:2472979‑M1/25‑99 (MQ=255) aaTATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAg < 1:927283/100‑1 (MQ=255) aaTATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTGTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAg < 2:1062119/100‑1 (MQ=255) atatatTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATTCCCAGCTGTTTTTTTAACGGCTGGGCATTAGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGc < 2:1713254/100‑1 (MQ=255) atatatTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGc < 2:2177469/100‑1 (MQ=255) ttattGCGATTAATAAGGAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGtt < 2:3580314/99‑1 (MQ=255) ttGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgc < 1:3531206/100‑1 (MQ=255) ttGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgc < 2:2386607/100‑1 (MQ=255) cataacgttgtaaaaaccgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAagctgttagatc > 2:1431385‑M2/58‑95 (MQ=255) gCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgctg > 2:2704736/1‑100 (MQ=255) gCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgctg > 2:3696450/1‑100 (MQ=255) gCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTctgctg > 1:1955502/1‑100 (MQ=255) cGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGTCTTTCCATTCGGATTTCACAACGTTATGTTCTCAGGTGTGTTTAAAGATGTCctgttct > 2:2143774/1‑96 (MQ=255) gATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTggg > 2:2371323/1‑100 (MQ=255) gATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTggg < 2:1968659/100‑1 (MQ=255) gATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTggg < 1:2206886/100‑1 (MQ=255) aTTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGc < 1:2049563/100‑1 (MQ=255) aTTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGc < 1:3001244/100‑1 (MQ=255) ataaGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCTGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATa > 2:796329/1‑100 (MQ=255) ataaGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATa > 1:3029695/1‑100 (MQ=255) gCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCt > 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ccgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAg > 2:925082‑M2/42‑100 (MQ=255) ccgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAg > 1:1973824‑M2/42‑100 (MQ=255) CCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCa < 2:2494058‑M1/99‑1 (MQ=255) CCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAg > 2:1407877‑M1/1‑100 (MQ=255) cgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGt > 1:1148131‑M2/41‑100 (MQ=255) gaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGtt > 2:2197511‑M2/40‑100 (MQ=255) aatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGttt > 1:1088281‑M2/39‑100 (MQ=255) aaTGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTTCTTTTTTTTGTTATCAGGTGTGATTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTACAGtt > 2:1673917/1‑99 (MQ=255) gcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCgg > 1:2558804‑M2/36‑100 (MQ=255) gcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCgg > 1:493428‑M2/36‑100 (MQ=255) gcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCgg > 1:682184‑M2/36‑100 (MQ=255) gcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCgg > 2:1134649‑M2/36‑100 (MQ=255) GCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGATATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCgg < 2:2799315‑M1/100‑1 (MQ=255) cccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCggg > 2:878288‑M2/35‑100 (MQ=255) cccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCggg > 2:3242‑M2/35‑100 (MQ=255) gTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGGTATGTTATCAGGGGTGTTTAAAGCTTTTCTGCTGGGCAATACTTTGCAGTTTCGGGTGATAGc > 2:1505365/1‑100 (MQ=25) ttttttAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTg > 1:1658863/1‑100 (MQ=255) ttttttAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTg < 1:2113231/100‑1 (MQ=255) ttttAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTgag < 1:465197/100‑1 (MQ=255) tttAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGAGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTgaga > 2:2861822/1‑100 (MQ=255) ttAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGat > 2:3420958/1‑100 (MQ=255) gctgggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCa < 1:2108511‑M2/85‑1 (MQ=255) gggcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAggg < 2:2631440‑M2/88‑1 (MQ=255) gcattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAg < 2:2884845‑M2/90‑1 (MQ=255) cattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAgg < 2:1841403‑M2/91‑1 (MQ=255) cattcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAgg < 1:3587656‑M2/91‑1 (MQ=255) catgcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAgg < 2:1058098‑M2/91‑1 (MQ=255) attcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGCGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGc < 1:1023046‑M2/92‑1 (MQ=255) ttcggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCt < 1:2472995‑M2/93‑1 (MQ=255) cggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCttt > 2:3332933‑M2/6‑100 (MQ=255) ggttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTg < 1:3368877‑M2/96‑1 (MQ=255) ttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTa > 2:502136‑M2/3‑100 (MQ=255) ttTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTa > 2:536464‑M2/3‑100 (MQ=255) tttACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAg > 2:3146591/1‑99 (MQ=255) | ATATATCTTATCAACACGATGAATAGACAGCCAATATATTATTGCGATTAATAAGCAACCGAATGCCCAGCTGTTTTTTTAAAGGCTGGGCATTCGGTTTTTACAACGTTATGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGT > NC_000913/3666064‑3666262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |