| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4476539 = | 143 (1.050) | 7 (0.050) | 7/172 | NT | 4.9% | coding (1103/1815 nt) | yjgL | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
| ? | NC_000913 | 4476562 = | 135 (1.020) | coding (1126/1815 nt) | yjgL | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATAAATC > NC_000913/4476463‑4476661 | gTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCat < 1:2135022/100‑1 (MQ=255) ccTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATAtt > 1:1513360/1‑100 (MQ=255) ccTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATAtt > 1:2722752/1‑100 (MQ=255) ttttagtatcatcaaaatattgcatgcttttattaaaacaccaatccagtattcttacatcattaatataTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTa > 1:2651185‑M1/71‑100 (MQ=255) cTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTa > 2:2541708/1‑100 (MQ=255) tGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTaa > 1:2950584/1‑100 (MQ=255) tctcATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatg < 2:266750/100‑1 (MQ=255) tctcATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatg < 1:3204416/100‑1 (MQ=255) agtatcatcaaaatattgcatgcttttattaaaacaccaatccagtattcttacatcattaatataTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatga > 1:1150172‑M1/67‑100 (MQ=255) tcATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatgat > 2:3537937/1‑100 (MQ=255) tcATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatgat > 1:206533/1‑100 (MQ=255) tcATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGACTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatgat > 1:552198/1‑100 (MQ=255) cATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAattatg > 2:2155369/1‑100 (MQ=255) cATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatgatg > 2:2326299/1‑100 (MQ=255) cATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatgatg < 2:2050765/100‑1 (MQ=255) cATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatgatg > 1:2828110/1‑100 (MQ=255) cATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatgat > 1:1338276/1‑99 (MQ=255) tcatcaaaatattgcatgcttttattaaaacaccaatccagtattcttacatcattaatataTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTa > 1:859542‑M1/63‑100 (MQ=255) tatTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTa > 1:3376024/1‑100 (MQ=255) atTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTaa < 2:2879486/100‑1 (MQ=255) ttCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAg < 2:2305111/100‑1 (MQ=255) cTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCTATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAg > 2:1870003/1‑98 (MQ=255) ttATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAAt > 2:1737155/1‑100 (MQ=255) ttGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATACATTAATGATGTAAGAATACt < 2:252504/100‑1 (MQ=255) tGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTg < 1:130010/100‑1 (MQ=255) tGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTg < 1:302304/100‑1 (MQ=255) aTTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGa > 1:2927060/1‑100 (MQ=255) ttCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGAt < 2:3272236/100‑1 (MQ=255) tCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGAtt > 2:3269168/1‑100 (MQ=255) ccTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTg > 1:1865783/1‑100 (MQ=255) ccTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTg > 2:1648033/1‑100 (MQ=255) ccTTAGATGATGAAAAGGTTAACCTTACACCAGTCATCGAATCTATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTg < 2:427544/100‑1 (MQ=255) cTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTgg > 2:3629499/1‑100 (MQ=255) tAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGgtg < 1:3029439/100‑1 (MQ=255) tAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGgtg < 1:3707703/100‑1 (MQ=255) tgatgCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGtttt < 1:1758278/100‑1 (MQ=255) gatgCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTta > 1:2266462/1‑100 (MQ=255) atgCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTtaa < 1:3731431/100‑1 (MQ=255) tgCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTtaat > 2:1517377/1‑100 (MQ=255) gCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTtaata > 2:805649/1‑100 (MQ=255) cAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTtaataa > 1:2171389/1‑100 (MQ=255) cAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTtaataa > 1:1727731/1‑100 (MQ=255) cAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTtaataa > 1:2027598/1‑100 (MQ=255) aGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCGTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATaaaa > 2:695468/1‑99 (MQ=255) aGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAg < 2:1879434/100‑1 (MQ=255) ggTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAg > 2:508634/1‑99 (MQ=255) aCCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCa > 2:2701283/1‑100 (MQ=255) aCCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCa < 2:950166/100‑1 (MQ=255) aCCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCa < 1:1241173/100‑1 (MQ=255) aCCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCa > 1:391263/1‑100 (MQ=255) ccTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCaa > 1:74894/1‑100 (MQ=255) ccTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCaa > 2:1701902/1‑100 (MQ=255) cTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAat > 1:1552161/1‑100 (MQ=255) cTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAat > 2:3543526/1‑100 (MQ=255) ttACACCGGTCATAGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAata > 2:2359009/1‑100 (MQ=255) cccgggTCATCGAATAGAATATGGAGACTTTTTCAAAATCCCCGTATGTTAAAAATATAAGAATACTGCATTGGTGTTTTAATAAAAACATGc > 2:714285/5‑93 (MQ=255) cacCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATAttt < 2:610733/100‑1 (MQ=255) ccGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtg < 2:1839622/100‑1 (MQ=255) cGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtga > 1:1183604/1‑100 (MQ=255) cGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtg > 2:3133997/1‑99 (MQ=255) ggTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtgat < 2:3421859/100‑1 (MQ=255) ggTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtgat > 1:3639268/1‑100 (MQ=255) ggTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtgat < 2:1446244/100‑1 (MQ=255) ggTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtgat < 2:1072005/100‑1 (MQ=255) ttacatcattaatatatggggattttggaaaagtctccaGATATTACTGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtgatg > 1:93010‑M2/40‑100 (MQ=255) gTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtgatg < 1:1247956/100‑1 (MQ=255) tacatcattaatatatggggattttgaaaaagtctccaTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtgatga > 1:859542‑M2/39‑100 (MQ=255) cctcgattcgatTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTgatgat > 1:3534404/3‑100 (MQ=255) cATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATAtttt > 2:51675/1‑94 (MQ=255) acatcattaatatatggggattttgaaaaagtctccaTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTgatgat > 1:17291‑M2/38‑100 (MQ=255) aTCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATa > 2:3025537/1‑100 (MQ=255) tcgattcgatTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATAc < 1:2651419/100‑1 (MQ=255) tcgattcgatTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATAc < 2:2927542/100‑1 (MQ=255) tcgattcgatTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATAc < 1:926491/100‑1 (MQ=255) tcattaatatatggggattttgaaaaagtctccaTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACt > 1:1150172‑M2/35‑100 (MQ=255) cgattcgattCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACt > 1:3582485/1‑100 (MQ=255) cattaatatatggggattttgaaaaagtctccaTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTa > 2:1908451‑M2/34‑100 (MQ=255) gattcTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAg > 2:2106880/1‑100 (MQ=255) gattcTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAg < 1:1322176/100‑1 (MQ=255) gattcTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAg < 1:260185/100‑1 (MQ=255) attcTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGa < 1:2815376/100‑1 (MQ=255) atatggggattttgaaaaagtctccaTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGAt > 1:1529419‑M2/27‑100 (MQ=255) tcTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATa < 2:2773058/100‑1 (MQ=255) GGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAg > 1:3214088‑M1/1‑100 (MQ=255) agaCTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAgca < 1:3120996/100‑1 (MQ=255) agaATTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAgca < 2:1393721/100‑1 (MQ=255) cTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAgcatgc > 1:3717944/1‑100 (MQ=255) tttttCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAgcatgca < 1:795974/100‑1 (MQ=255) aaaaTCCCCATATAGTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTcc < 2:1102221/100‑1 (MQ=255) aaTCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAGAGATAAAGCATGCATGCTCCGt < 2:2219310/100‑1 (MQ=255) attcccATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGta < 2:2251710/97‑1 (MQ=255) aTCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGta < 1:2665961/100‑1 (MQ=255) tCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGtaa > 1:2055253/1‑100 (MQ=255) tCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGtaa < 1:1240572/100‑1 (MQ=255) tCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGtaa < 1:532839/100‑1 (MQ=255) ccccATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGtaat > 2:2393915/1‑100 (MQ=255) cccATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGtaata > 1:628829/1‑100 (MQ=255) ccaTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGtaataa < 1:3528758‑M2/97‑1 (MQ=255) caTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATaaa > 1:3663180‑M2/3‑100 (MQ=255) caTATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATaaa < 2:1750100‑M2/98‑1 (MQ=255) | GTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATAAATC > NC_000913/4476463‑4476661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |