| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2700568 | 67 (0.900) | 6 (0.100) | 5/160 | 9.7 | 10.3% | intergenic (‑371/+50) | shoB/acpS | toxic membrane protein/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 |
| ? | NC_000913 | = 2700581 | 51 (0.850) | intergenic (‑384/+37) | shoB/acpS | toxic membrane protein/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2700451‑2700568‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaaaagtaaaacccccgAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTACA < NC_000913/2700581‑2700484 CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGT > 1:1526437/1‑100CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATAAATAATAGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGT > 2:112755/1‑100 CGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTA > 1:436433/1‑100 TTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAA > 2:1301237/1‑100 TTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTA < 1:482143/100‑1 TATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAA < 1:1559175/100‑1 GCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAAC > 1:662196/1‑100 GCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAAC > 1:338305/1‑100 CTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACC > 2:795166/1‑100 CTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACC > 1:245356/1‑100 CTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGATGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTACAACC > 2:1200897/1‑100 AAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCC < 1:1609502/100‑1 AGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG < 2:584091/100‑1 AGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG < 2:851444/100‑1 AGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG < 1:1464543/100‑1 TTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCTCTGTTGTTGAGAGTTCATACTGCACAAAATTAAAGATAAAAAGTAAAA > 2:571675/1‑91 GATAAGTACACTGATCCATATTCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTT < 2:552292/100‑1 ATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTT < 2:635346/100‑1 ATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTT < 2:1021742/100‑1 AGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACT < 1:1155248/100‑1 TACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTT < 2:264486/99‑1 CTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAAC > 1:1423099/1‑100 TTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAG > 1:1653759/1‑100 AAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTG < 1:609500/100‑1 AAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTG < 2:1072114/99‑1 AAAGTAAAACCCACGAACTGGTAAAGAACAGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCAACCTCAACAACAGCGATTATGGATCAtttta > 1:1519665/1‑95 AAGTAAAACCCCCGAACTTGTAAGGAACGGGGGTTTTATTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTAC < 2:558343/100‑1 AAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTAT > 2:1136301/1‑100 AAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATC > 2:380305/1‑100 CCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTT > 1:635115/1‑100 CCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTTATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTA < 2:25242/100‑1 CCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTA > 2:50984/1‑100 CCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTATCTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTAGCTTTTAC < 1:955828/100‑1 CCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTAC < 1:826790/100‑1 CGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTACA > 2:1273329/1‑100 CGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTAC < 2:1203169/99‑1 CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2700451‑2700568‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaaaagtaaaacccccgAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTACA < NC_000913/2700581‑2700484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |